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quasr
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80
的观点
当从QuasR包运行qAlign进行序列比对和QC时出现错误。
质量控制
对齐
QuasR
3个月前更新
迈克尔·施
▴340•写于3个月前
h.kozlowski
•0
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105
的观点
利用QuasR对未纳入BSgenome的生物进行RNAseq分析
QuasR
6个月前更新
迈克尔·施
▴340•6个月前写的
anuranjansrathore
•0
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96
的观点
使用QuasR包中的qCount
qCount
QuasR
NA
9个月前更新
迈克尔·施
▴340•9个月前写的
jabbar_campbell
•0
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3.
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178
的观点
qAlign:如何指定最大允许的不匹配数和输出所有对齐
QuasR
17个月前更新
迈克尔·施
▴340•17个月前写的
朱莉·朱
★4.3 k
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318
的观点
qqreport文件中描述的失踪地块
QuasR
更新于2.2年前
霍兼
▴400•写于2.2年前
达里奥Strbenac
★1.5 k
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433
的观点
QuasR:不能传递对齐参数
quasR
quasr错误
alignmentparameters
quasr
2.5年前
Amer Ghalawinji
•0
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422
的观点
QuasR错误消息
QuasR
RNA_Seq
更新于3.4年前
霍兼
▴400•写于3.4年前
ta_awwad
▴10
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1
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409
的观点
带有GRangesList的qCount非常慢
QuasR
qCount
GRangesList
3.9年前
vakul.mohanty
▴10
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425
的观点
不能依赖于另一个包中的QuasR
QuasR
3.9年前
zwfanwz678
•0
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779
的观点
QuasR - preprocessReads失败,出现SRFilterResult错误
quasr
quasr错误
4.2年前
jlncrnt
▴10
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465
的观点
RNA Seq // QuasR:提取未映射reads时出错
quasr
quasr错误
paired-end读取
rnaseq
4.3年前
guillaume.dachy
•0
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492
的观点
配对端RNA序列qAlign, QuasR错误
quasr
paired-end读取
rnaseq
4.3年前
guillaume.dachy
•0
0
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0
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451
的观点
Error preprocessReads: Error in writeFastq
quasr
rnaseq
paired-end读取
4.4年前
guillaume.dachy
•0
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6
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728
的观点
qalign的多线程问题
quasr
平行
更新于4.4年前
霍兼
▴400•写于4.4年前
kirt.onthank
•0
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2
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665
的观点
融合基因突变检测
bioconductor
quasr
4.8年前
maedakus
▴10
1
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1
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2.5 k
的观点
ERROR: lazy loading failed for package 'QuasR'
QuasR
更新于5.1年前
马丁•摩根
25k•写于5.1年前
Hackerzone85
•0
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4
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825
的观点
Splicemap(在QuasR)在对准25mers时失败
QuasR
rnaseq
对齐
splicemap
bowtie2
5.2年前
加布里埃尔
•0
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1
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691
的观点
在>3集群上运行Quasr时出错
quasr
平行
集群
5.3年前
rna seq
▴90
0
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9
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1.1 k
的观点
问题使用>3集群与Quasr
quasr
平行
更新于5.3年前
马丁•摩根
写于5.3年前
rna seq
▴90
0
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3.
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729
的观点
RNAseq_alignment_SpliceMap处理time_QuasR
SpliceMap
QuasR
RNAseq
对齐
更新于5.3年前
霍兼
▴400•写于5.3年前
tarek.mohamed
▴10
2
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4
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840
的观点
蝴蝶结%为DGE映射读数
领结
quasr
rnaseq
更新于5.3年前
达里奥Strbenac
★1.5k•写5.3年前
tarek.mohamed
▴10
0
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1
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695
的观点
类星体:拼接和未拼接对齐
quasr
对齐
更新于5.3年前
霍兼
▴400•写于5.3年前
nadia_boufaied
•0
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1
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728
的观点
博士后研究员
QuasR
更新于5.3年前
霍兼
▴400•写于5.3年前
tarek.mohamed
▴10
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2
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735
的观点
QuasR对齐中断
quasr
更新于5.4年前
霍兼
▴400•5.4年前写的
nadia_boufaied
•0
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5
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947
的观点
QuasR包中的SpliceMap在排序25mer-alignment时失败
rnaseq
quasr
对齐
更新于5.4年前
霍兼
▴400•5.4年前写的
nadia_boufaied
•0
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5
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1.2 k
的观点
QuasR:加载BAM文件作为起点
quasr
更新于5.7年前
迈克尔·施
▴340•写于5.7年前
rahel14350
▴10
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6
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1.8 k
的观点
R/BioC rna序列分析:对齐和读取计数
黑腹果蝇
quasR
genomicfeatures
genomicranges
对齐
更新于5.8年前
Herve页面
14k•写于5.8年前
霏欧纳
▴70
0
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2
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1.0 k
的观点
如何确定外显子计数的外显子标识符
rnaseq
外显子
quasr
更新于6.4年前
史蒂夫Lianoglou
13k•写于6.4年前
sven.schuierer
•0
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1
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623
的观点
QuasR -从其他对齐器导入对齐文件
quasr
更新于6.5年前
霍兼
▴400•写于6.5年前
sven.schuierer
•0
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1
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623
的观点
内存错误建立索引
QuasR
更新于6.6年前
马丁•摩根
2.5 k•写于6.6年前
hmabril
•0
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7
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2.3 k
的观点
使用Rbowtie运行CreateProcess失败
软件错误
quasr
rbowtie
6.6年前
annabel.ferguson
•0
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2
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971
的观点
QuasR问题
QuasR
更新于6.7年前
丹尼尔Soronellas
▴10•写于6.7年前
迈克尔·施
▴340
0
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0
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696
的观点
QuasR microrna的
microrna的
QuasR
microrna的
QuasR
7.0年前
迈克尔·施
▴340
0
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7
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1.2 k
的观点
QuasR:访问BSgenome.Rnorvegicus.UCSC.rn5的问题
对齐
鼠形
BSgenome
BSgenome
QuasR
对齐
鼠形
BSgenome
更新于7.2年前
Herve页面
14k•写于7.2年前
圭多Hooiveld
★2.9 k
0
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3.
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988
的观点
由基因或外显子或转录本总结
QuasR
QuasR
7.5年前
迈克尔·施
▴340
0
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0
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1.1 k
的观点
在QuasR中创建一个示例文件/tab分隔文件
BSgenome
转换
BSgenome
基因组
QuasR
BSgenome
转换
BSgenome
基因组
QuasR
7.5年前
迈克尔·施
▴340
0
票
0
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893
的观点
在QuasR中创建一个示例文件/tab分隔文件
BSgenome
转换
BSgenome
QuasR
BSgenome
转换
BSgenome
QuasR
7.5年前
客人的用户
★12 k
0
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7
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1.6 k
的观点
Linux集群上的QuasR
BSgenome
BSgenome
QuasR
BSgenome
BSgenome
QuasR
更新于7.6年前
迈克尔·施
▴340•写于7.6年前
尤格Borello
▴340
0
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8
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1.8 k
的观点
QuasR:如何使用索引参考基因组?
BSgenome
BSgenome
基因组
QuasR
BSgenome
BSgenome
基因组
QuasR
更新于8年前
迈克尔·施
▴340•写于8.0年前
保罗·香农
▴750
0
票
2
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887
的观点
QuasR特殊情况对齐
对齐
基因组
QuasR
对齐
基因组
QuasR
更新于8年前
尤格Borello
▴340•写于8.0年前
迈克尔·施
▴340
0
票
2
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675
的观点
QuasR特殊情况对齐
对齐
QuasR
对齐
QuasR
更新于8年前
迈克尔·施
▴340•写于8.0年前
尤格Borello
▴340
1
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1
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1.3 k
的观点
QuasR上的多个线程
对齐
很高兴
QuasR
对齐
很高兴
QuasR
8.1年前
迈克尔·施
▴340
42个结果•页面
1的1
最近……
回复
答:DiffBind
通过
罗里斯塔克
★3.8 k
我先回答第二个问题。您不应该直接访问“$binding”矩阵——染色体名称是因子数,…
注释:如何下载ChAMP依赖项ChAMPdata
通过
shepherl
2.6 k
您可以尝试增加下载文件的超时限制。我增加了我的。Rprofile ' script所以它的持久化在所有的会话…
注释:DiffBind报告错误
通过
罗里斯塔克
★3.8 k
如果您可以给我访问您的' dbind_de '对象,我可以看看发生了什么。这将有助于看到呼叫的序列哟…
评论:去limma样品?
通过
RMP87
•0
非常感谢你的解释。让它更精确。我可以分析和规范化一个数据集的所有样本,即使我有…
评论:DESeq2,为什么与CQN相比,EDASeq的偏移量出现了反转?
通过
Saulius
•0
是的,我认为你又说对了。谢谢你花这么多时间调查这件事。大小因素在“cqn”的代码中出现两次:…
票
注释:如何下载ChAMP依赖项ChAMPdata
特征数对调整后的p值的影响
特征数对调整后的p值的影响
答:使用DADA2输出的DESeq2
答案:DESeq2,与CQN相比,为什么EDASeq的偏移量发生了反转?
奖
•所有
老师
来
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
学者
来
迈克尔的爱
32 k
受欢迎的问题
来
veronique.storme
•0
受欢迎的问题
来
戈登•史密斯
42 k
学者
来
亚伦Lun
★26 k
位置
•所有
美国,
刚才
美国,
刚才
巴西,
17分钟前
美国华盛顿州西雅图市
20分钟前
德国,
21分钟前
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