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genomicranges
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99
的观点
我应该创建一个新类还是使用公共类
GenomicRanges
18天前由
Herve页面
15k•19天前由
广东商
▴20
0
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47
的观点
使用genomicRanges / plyranges计算区间内的峰值分数
plyranges
GenomicRanges
五星期前
alorsonmethyle
•0
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4
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167
的观点
IRanges:: finoverlapairs不能接受太大的输入
IRanges
GenomicRanges
4周前更新
益鑫
•0
11
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13
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635
的观点
如何检索entrezID及其各自的基因名称列表的基因组坐标
基因组
AnnotationHub
GenomicRanges
org.Hs.eg.db
•4个月前更新
rohitsatyam102
▴10
1
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1
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168
的观点
不能再创建GRanges对象
GenomicR
GenomicRanges
4个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
57k•4个月前由
zhezhen
•0
1
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116
的观点
多个样本间的平均覆盖率
GenomicRanges
5个月前更新
迈克尔•劳伦斯
11k•5个月前由
杰克
▴70
14
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9.6 k
的观点
如何合并grange列表?
GenomicRanges
4个月前更新
mmfansler
▴30•写于5.0年前
endrebak85
▴30
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1
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167
的观点
基因组范围相当于床工具集群
IRanges
GenomicRanges
6个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
57k•6个月前由
kalamari
•0
1
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3.
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184
的观点
合并相邻的基因组片段
农庄
GenomicRanges
6个月前
rahnaman
▴10
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2
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229
的观点
如何修改seqinfo对象中字段的单个值?
GenomicRanges
GenomeInfoDb
BSgenome
isCircular
7个月前更新
Herve页面
15k•8个月前由
克里斯·塞德尔
▴80
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78
的观点
annotatr包:GRanges对象包含边界外的范围
annotatr
GenomicRanges
7个月前
娜娜
•0
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119
的观点
减少和聚集grange与间隙使用plyrange
GenomicRanges
plyranges
8个月前
r.a.policastro
•0
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1
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134
的观点
如何获得人类基因组中的重复元素基因组范围?
重复的元素
IRanges
GenomicRanges
BSgenome
9个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
57k•9个月前由
vinod.acear
▴50
3.
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7
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273
的观点
GRanges/GFeatures:在cdsByOverlaps输出中保留所有父列
农庄
GenomicRanges
GenomicFeatures
cdsByOverlaps
DiffBind
10个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
57k•10个月前由
vanbelj
▴10
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108
的观点
用于GRangesList的启动子的预期输出
GenomicRanges
10个月前
达里奥Strbenac
★1.5 k
0
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5
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163
的观点
GenomicRanges对象不再可见
GenomicRanges
12个月前更新
马丁•摩根
2.5万•12个月前由
克里斯·塞德尔
▴80
4
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2
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145
的观点
如何提取的位置,目前在一个基因组范围的对象,而不是另一个?
genomicranges
r
重叠
13个月前更新
凯文Blighe
3.1k•13个月前由
令人扫兴的人
•0
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1
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120
的观点
有没有一个简单的方法来做pos(x) <- pos(x) + 1的GPos对象?
GenomicRanges
gpo
13个月前
查尔斯·普莱西
▴130
0
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0
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126
的观点
警告:使用makeTxDbFromGFF停止不能映射到外显子的密码子
genomicranges
genomicfeatures
13个月前
广东商
▴20
2
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2
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188
的观点
基因组范围:从0碱基转换为1碱基
GenomicRanges
13个月前更新
迈克尔•劳伦斯
11k•13个月前由
扎克罗伊
▴10
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1
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237
的观点
Rtracklayer导出Granges对象为bigwig错误:特征不能重叠
rtracklayer
genomicranges
农庄
14个月前更新
迈克尔•劳伦斯
11k•14个月前由
ssabri
▴20
3.
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4
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228
的观点
如何关闭“makeTxDbFromGFF”中miRNA类型的识别特征
GenomicFeatures
genomicranges
14个月前更新
Herve页面
15k•14个月前由
广东商
▴20
0
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4
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257
的观点
试图从BiocManager安装GenomicRanges时编译错误。
软件错误
GenomicRanges
15个月前
atheeth14
•0
1
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1
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107
的观点
MEDIPS。CpGenrich现在RangedData已弃用
MEDIPS
RangedData
GenomicRanges
15个月前更新
卢卡斯查韦斯
▴550•15个月前由
emham
•0
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6
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208
的观点
基因组范围:找到第一,第二和第三个最近的基因
R
GenomicRanges
农庄
15个月前更新
戈登•史密斯
43k•15个月前由
ssabri
▴20
0
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0
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133
的观点
试图转换gff文件-> txdb对象使用GenomicFeatures::makeTxDbFromGFF()错误
GenomicFeatures
注释
人造石铺地面
GenomicRanges
15个月前更新
shepherl
2.7k•15个月前由
domenick.braccia
•0
3.
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2
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191
的观点
基因组范围:找到N个最近的/前面的/后面的范围
genomicranges
16个月前更新
迈克尔•劳伦斯
11k•16个月前由
maltethodberg
▴140
6
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11
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2.9 k
的观点
基因间坐标与基因组特征
genomicranges
genomicfeatures
iranges
16个月前更新
mohancm89
•0•写于6.2年前
饼干
▴20
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3.
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147
的观点
基因组特征启动子重叠:通过重叠识别启动子?
GenomicFeatures
GenomicRanges
17个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
57k•17个月前由
vanbelj
▴10
0
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3.
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226
的观点
将转录本中的外显子大小调整为总宽度
genomicranges
genomicfeatures
17个月前更新
迈克尔•劳伦斯
11k•17个月前由
杰克
▴70
0
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193
的观点
查找pintersect()时出错
GenomicRanges
18个月前
Prashantha Hebbar
▴260
0
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0
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144
的观点
解决了。在GenomicRanges的列表中查找到最近邻居(非自己)的距离
GenomicRanges
GenomicFeatures
画眉山庄
distanceToNearest
R
19个月前
rmash
•0
0
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1
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672
的观点
在range 1中,'end'必须是>= 'start' - 1。: .Call2(\"solve_user_SEW0\", start, end, width, PACKAGE = \"IRanges\")"
Genomicranges
IRanges
19个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
57k•19个月前由
bioinagesh
•0
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3.
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306
的观点
GenomicRanges发现的重叠可以忽略序列名吗?
GenomicRanges
findOverlaps
20个月前
威廉·麦克朗
•0
0
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7
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1.3 k
的观点
当从BiocManager安装0.22.1时,GenomicRanges需要S4Vectors 0.23.19
S4Vectors
GenomicRanges
BiocManager
20个月前
james.dalgleish
▴30
4
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9
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332
的观点
使用基因组范围获得非重叠(非冗余)区域的计数
genomicranges
农庄
grangeslist
R
21个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
57k•21个月前由
new_user6
•0
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5
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264
的观点
关于seqnames()在GenomicRanges中的一个问题
GenomicRanges
21个月前
广东商
▴20
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3.
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340
的观点
定义BSgenome -> GRanges S4钳子没有包附加
BSgenome
方法
GenomicRanges
21个月前
Aditya
▴120
1
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2
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248
的观点
定义和导出seta ('BSgenome', 'GRanges')有用吗?
BSgenome
GenomicRanges
21个月前更新
迈克尔•劳伦斯
11k•21个月前由
Aditya
▴120
4
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14
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644
的观点
将GenomicRanges::GRanges设置为“%in%”失败
genomicranges
21个月前
Aditya
▴120
3.
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3.
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319
的观点
grange操作后是否检查范围有效性?
GenomicRanges
21个月前
Aditya
▴120
7
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4
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244
的观点
seqlength不是从名称空间GenomicRanges导出的对象
GenomicRanges
21个月前更新
迈克尔•劳伦斯
11k•21个月前由
Aditya
▴120
2
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1
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260
的观点
如何使一个GPos子类接受UnstitchedGPos和StitchedGPos输入?
GenomicRanges
22个月前更新
Herve页面
15k•23个月前由
查尔斯·普莱西
▴130
3.
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10
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1.7 k
的观点
从GRanges对象中提取每个基因组坐标的元数据
GenomicRanges
农庄
23个月前•22个月前更新
罗伯特。
▴10
2
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3.
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370
的观点
OSX中的rtracklayer对CRAN不可用,导致下游依赖项出现错误。
GenomicRanges
rtracklayer
VariantAnnotation
S4Vectors
SummarizedExperiment
23个月前更新
史蒂夫Lianoglou
13k•23个月前由
james.dalgleish
▴30
4
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2
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428
的观点
从ipo中构建gpo
genomicranges
农庄
gpo
23个月前更新
Herve页面
15k•写于2.7年前
maltethodberg
▴140
0
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1
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245
的观点
利用GenomicRanges (R-package)评估基因组片段富集
GenomicRanges
R
基因组富集
2.0年前更新
迈克尔•劳伦斯
11k•2.0年前由
geretshabile
•0
0
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1
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187
的观点
如何删除在组之前发现的值行
GenomicRanges
r
2.1年前
naktang1
•0
0
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1
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300
的观点
无法在ChIPQC中使用酵母基因组进行注释
ChIPQC
GenomicRanges
ChIPpeakAnno
28天前由
正德尔
•0•写于2.1年前
bertb
•0
0
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2
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300
的观点
根据ATACseq数据计算TSS富集
GenomicRanges
的观点
ATACseq
TSS
2.1年前
tangming2005
▴170
50个结果•页面
1 / 1
最近……
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备注:无法通过BiocManager::install()安装包
通过
迈克•史密斯
★5.0 k
通过Github安装特定版本的**BiocManager**是一个临时的工作,使修复立即可用,因为我…
注释:路径视图中的多个样本具有不同的颜色
通过
esteban.peguero
•0
如果你能找到办法,我会很感兴趣的。谢谢。
注释:RNAseq:使用limma::removeBatchEffect后,相同的样本-样本距离
通过
athiebaut
•0
好吧,没什么好担心的,对吧?非常感谢您的回答!
注释:生成一个大小大于.Machine$integer.max的DelayedArray
通过
引人入胜
•0
我认为这不是一个微不足道的问题,而是一个问题,当处理一些巨大的数组数据与DelayedAr…
答案:网络分析:低可信度评分有效吗(STRING DB)
通过
凯文Blighe
3.1 k
在我看来,0.15的分数太低了,因为这意味着每10个交互中就有9个可能是假阳性。请……
票
注释:使用DelayedArray块处理不同维度的矩阵
注释:使用DelayedArray块处理不同维度的矩阵
答:用DelayedArray块处理不同维度的矩阵
答:在LIMMA中结合重复测量和重复相关
用于整合基因组学、转录组学和蛋白质组学数据的Bioconductor基础设施
奖
•所有
学者
来
Herve页面
15 k
受欢迎的问题
来
或者,Jianhong
★1.2 k
学者
来
凯文Blighe
3.1 k
受欢迎的问题
来
安东尼奥安
▴10
受欢迎的问题
来
戈登•史密斯
43 k
位置
•所有
西班牙,
1分钟前
瑞士,
4分钟前
法国,
4分钟前
美国,
16分钟前
海德堡EMBL / de.NBI,
26分钟前
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