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答案:[DESeq2] -使DESeq数据集对象从csv已经规范化计数。
通过
迈克尔
•0
小短文和其他评论中的共识似乎是,对象只能由整数矩阵构建。我基本上是…
注释:将DataFrame转换为data.frame,同时保持列名语法
通过
詹姆斯·w·麦克唐纳
57 k
哦。你使用的是' as。data。frame '这只是以重新创建' data.frame '结束,在它之上有一个'…的争论是……
答案:转换DataFrame到data.frame,同时保持列名语法
通过
詹姆斯·w·麦克唐纳
57 k
' ' ' > df <- DataFrame("HLA-A" = 1:5, "HLA-B" = 2:6, check.names = FALSE) > df DataFrame with 5 rows and 2 column HLA-A HLA-B…
答案:DESeq2 -不能复制log2FC计算
通过
莎拉
•0
我完全同意你关于GUI界面的观点,我信任DESeq2的所有结果。然而,我不能真正理解的区别,罪……
评论:在DESeq2版本1.2中,log2FC(MLE)和计算出的log2 fold变化的差异
通过
杜达
•0
亲爱的爱先生,是否有可能更准确地说出归一化因素如何影响最终比率,因为它不是确切的log2ra…
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答案:[DESeq2] -使DESeq数据集对象从csv已经规范化计数。
minfi, lumi, methylumi, DMRcate安装错误
成对样本,多组:问题理解对比和模型。矩阵
POU5F1(OCT4) /ENTREZID: 5460不在txdb . hsapiensucsc .hg19. knowngene中
A: deseq2对4种条件下DE表达的LRT vs Wald测试结果
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