显示：tximport.•重启
0.
投票
7.
答案
111.
意见
Tximport的问题
tximportdata.tximport.
3天前•1天前更新Agoesmartini.•0
0.
投票
1
回复
43.
意见
Tximport错误导入预期计数来自RSEM的文件
rsem.tximport.
23天前muyu.•0•23天前更新迈克尔爱 31K.
2
投票
1
回复
81.
意见
Tximport后转录TPM的DESEQ使用
tximport.
5周前Kir_f.•0•5周前更新迈克尔爱 31K.
2
投票
1
回复
68.
意见
Tximport与Salmon Bootstraps和Edger / Deseq2
tximport.
6周前主题•0•6周前更新迈克尔爱 31K.
0.
投票
5.
答案
161.
意见
Sumarizetogene正在降落成绩单，如何调试
Sumarizetogene.tximport.
7周前AEDAVID•0•28天前更新迈克尔爱 31K.
5.
投票
6.
答案
243.
意见
具有方差稳定转换和TXIMPORT R包的原料RSEM基因表达估计的转化
deseq2.vst.rsem.tximport.
9周前•8周前更新svlachavas.•770.
0.
投票
1
回复
60.
意见
如何在丰度文件的输出上使用TX导入
tximportdata.tximport.
11周前朱丽叶•0•11周前更新Kevin Blighe. 2.4K.
1
投票
4.
答案
166.
意见
Tximport AbundancoL参数无法运行RSEM数据
tximport.rsem.转录物丰富TPM.FPKM.
4个月前M.Metger.•0•12周前更新迈克尔爱 31K.
0.
投票
1
回复
108.
意见
将RSEM数据导入DESEQ2
deseq2.tximport.
3个月前dequattro.concetta.•10•3个月前更新迈克尔爱 31K.
1
投票
9.
答案
155.
意见
问题：运行汇总错误（） - RNA SEQ Bioconductor管道
tximeta.tximport.deseq2.
4个月前Anthony.Nash.•20•4个月前更新迈克尔爱 31K.
0.
投票
8.
答案
153.
意见
使用Tximport导入RSEM
tximport.rsem.导入错误
5个月前Harelarik.•50•5个月前更新迈克尔爱 31K.
2
投票
8.
答案
331.
意见
Tximport包需要哪个R版本？
tximport.包裹R版本安装tximport.
5个月前Harelarik.•50
0.
投票
5.
答案
108.
意见
使用Drimseq与Salmon Count数据时出错
德里姆瑟克tximport.TXDB.三文鱼
5个月前夏洛特•0•5个月前更新迈克尔爱 31K.
2
投票
2
答案
105.
意见
没有丰富矩阵的DESEQ2的RSEM
tximport.deseq2.rsem.
5个月前LE2336.•20•5个月前更新迈克尔爱 31K.
1
投票
1
回复
67.
意见
用Tximport将三文鱼量化导入r的错误
deseq2.tximport.
6个月前六月。•10•6个月前更新迈克尔爱 31K.
1
投票
2
答案
70
意见
Tximport如何计算丰富
tximport.丰富
6个月前Chendianyu.•0•6个月前更新迈克尔爱 31K.
2
投票
1
回复
97.
意见
tximport samples.txt文件强制性与可选的colnames？
tximport.三文鱼deseq2.
6个月前AKSR.•20•6个月前更新迈克尔爱 31K.
0.
投票
4.
答案
99.
意见
平均方差趋势图具有来自Tximport的同种型和基因级数据
tximport.同种型变焦
6个月前ina hoeschele.•610.•6个月前更新戈登·斯密 42K.
5.
投票
3.
答案
200.
意见
全长单单元RNA-SEQ - 下游分析的Tximport输出
tximport.Seurat.SMART-SEQ.SMART-SEQ2.
6个月前Lshepard.•40•6个月前更新迈克尔爱 31K.
1
投票
1
回复
67.
意见
用Tximeta指定Tx2gene
tximeta.tximport.
6个月前Aimee.Hanson.•0•6个月前更新迈克尔爱 31K.
1
投票
2
答案
79.
意见
来自Musmusculus和Homosapiens的RNA SEQ
tximeta.tximport.注解
6个月前guillaume.dachy•0•6个月前更新迈克尔爱 31K.
1
投票
2
答案
84.
意见
Tximport计数与TPM
tximport.TPM.
6个月前ina hoeschele.•610.•6个月前更新迈克尔爱 31K.
2
投票
2
答案
88.
意见
deseqdatasetfromtximport with and and ofter offset
deseq2.tximport.
6个月前伊戈尔•40
6.
投票
2
答案
184.
意见
Tximport + Edger不推荐？
tximport.edger.
7个月前Simon.michaelis88.•0•7个月前更新迈克尔爱 31K.
2
投票
2
答案
68.
意见
Tximport缺少组概述计数的值
tximport.鼠参考GTF.三文鱼
7个月前keremwai.•0
1
投票
6.
答案
108.
意见
使用尖峰RNA用于使用Tximport进口鲑鱼计数的标准化
deseq2.tximport.suctionfactors.标准化活性仪斯皮克 - in.
7个月前hina.abbas.bandukwala.•0•7个月前更新迈克尔爱 31K.
2
投票
6.
答案
164.
意见
如何运行tximport？
tximport.
7个月前Sunnykevin97.•0•7个月前更新在地点•390
1
投票
1
回复
58.
意见
无法使用sample.info运行tximport？
tximport.deseq2.edger.
7个月前Sunnykevin97.•0•7个月前更新迈克尔爱 31K.
0.
投票
3.
答案
58.
意见
Tximport进口商异构丰富
tximport.
7个月前ina hoeschele.•610.•7个月前更新迈克尔爱 31K.
0.
投票
1
回复
69.
意见
Tximport无法Inport RSEM FPKM数据
tximport.
7个月前137737756•0•7个月前更新迈克尔爱 31K.
1
投票
1
回复
75.
意见
Dexseq-DTU规范化建议 - ScaleDTPM VS DTUSCALEDTPM
tximport.dexseq-dtu.德里姆瑟克
7个月前Aleksandar.baburski.g.•0•7个月前更新迈克尔爱 31K.
1
投票
3.
答案
75.
意见
RSEM和Tximport.
rsem.tximport.deseq2.
7个月前Pthom010•0•7个月前更新詹姆斯W.麦克唐纳 56K.
2
投票
3.
答案
74.
意见
使用sparsematrix在scaledtpm选项中使用tximport时出错
tximport.三文鱼疏
8个月前noorpratap.•0•8个月前更新迈克尔爱 31K.
0.
投票
3.
答案
89.
意见
使用DESEQ2的协变量进行奇怪P值
deseq2.edger.三文鱼tximport.
8个月前Iaradsouza1.•0•8个月前更新迈克尔爱 31K.
3.
投票
5.
答案
125.
意见
Edger + Tximport：Calcnormfactor和偏移的使用
edger.tximport.差异表达
8个月前霍尔德尼亚梅洛•0
4.
投票
7.
答案
257.
意见
使用DESEQ2的TCGA RSEM数据从Virebrows中下载
deseq2.tximport.TCGA.rsem.Wirebrowse.
8个月前J. Smith.•0•8个月前更新Kevin Blighe. 2.4K.
1
投票
2
答案
81.
意见
来自RSEM预期计数的Tximport：是否可以从表而不是文件导入？
tximport.林马rnaseq.
8个月前Ahdee•50•8个月前更新迈克尔爱 31K.
3.
投票
3.
答案
84.
意见
无法从DESEQ2分析中提取大小因素
deseq2.tximport.
9个月前Zroger499•0
1
投票
9.
答案
354.
意见
导入Kallisto与Tximport计数
tximport.KallistoH5Fopen.
9个月前Zroger499•0•9个月前更新迈克尔爱 31K.
0.
投票
4.
答案
77.
意见
困难时间从现有的鲑鱼输出文件创建TXI对象以将抄本文件转换为基因ID TPM
三文鱼tximport.tximportdata.Ensembl.
9个月前sl•0•9个月前更新迈克尔爱 31K.
0.
投票
2
答案
57.
意见
解析创建Tximport的Tx2gene对象的错误
tximport.GCF功能表解析错误染色体
9个月前knholm.•0•9个月前更新迈克尔爱 31K.
1
投票
0.
答案
71.
意见
消息：使用Tximport导入Alevin推理复制到R中的R
tximport.消息
10个月前迈克尔爱31K.
2
投票
4.
答案
618.
意见
Tximport，Kallisto和Deseq2（快速答案）
Kallistotximport.deseq2.算
21个月前•10个月前更新莫扎特•10
0.
投票
6.
答案
121.
意见
Tximport使用Salmon Bootstrap丢失成绩单
三文鱼tximport.引导
10个月前辛迪•0•10个月前更新Julia.jefferson23.•0
0.
投票
7.
答案
76.
意见
Tximeta不起作用下载ref Genome
deseq2.tximeta.tximport.rnaseq.
11个月前拉法斯罗斯汉堡•0
0.
投票
3.
答案
72.
意见
“词汇错误：使用Tximport时，JSON文本中的CHAR中无效”
tximport.三文鱼
12个月前阿拉洛•0•12个月前更新迈克尔爱 31K.
0.
投票
1
回复
81.
意见
SALMON / DESEQ2：DESEQ对象中的TX2GENE差异
deseq2.tximport.三文鱼
12个月前ggchaput•0•12个月前更新迈克尔爱 31K.
0.
投票
5.
答案
75.
意见
改变基因ID注释风格 - 使用鲑鱼输出[nm ...]并产生的计数文件是仅限数字ID
tximport.基因IDTXDB.refseq.三文鱼
12个月前霍尔姆克•0•12个月前更新迈克尔爱 31K.
5.
投票
11.
答案
496.
意见
正确使用Tximport与Edger CPM（）组合使用
tximport.edger.
20个月前•12个月前更新在地点•390
1
投票
1
回复
127.
意见
使用H5和TSV文件的Tximport错误
tximport.Kallisto
14个月前SP21.•0•14个月前更新迈克尔爱 31K.
212结果•页面1的5
最近的 ...
答案
注释：DiffBind安装失败：错误：加载包装的“生物根学”0.34.0，但经过在地点 •390
目前的BIOC为3.12，而不是3.11，见https://www.biocumon.org/install/
评论：DESEQ2比较订单经过Kevin Blighe. 2.4K.
嗨，我认为你需要更改这一行：采样$条件< - 因子（采样$条件）......到：采样$ $ conditi ...
评论：DESEQ2比较订单经过模糊 •0
亲爱的凯文，谢谢你的帮助。我正在使用它来确定基线：DDS $条件< - 相关（DDS $条件，REF =“UNTREA ......
注释：安装bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38时出​​错经过Ahorn720 •10
在尝试Innstall HG38时，我正在收到同样的错误：“Biocmanager ::安装（”bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38“）````错误：包或nam ...
答：错误'无效类“dmngroup”对象“的意思是什么，如何解决p经过MSCHMIDT. •10
我已经使用了Biocometiond为3.0.3版本3.12。现在它有效。有关类似的问题，请检查类似帖子[fockover ...
投票
注释：安装bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38时出​​错
DESEQ2考虑3个因素的设计模型
评论：DESEQ2用于嵌套个人的时间课程
加入Bioconductor社区咨询委员会
答案：diffbind 3.0的dba.count（）没有bsubcontrol参数
奖项 • 全部
受欢迎的问题至erwan.scaon.•10
好问题至Komal.rathi.•80
史诗问题至Komal.rathi.•80
赞赏至马修里奇•960
受欢迎的问题至s.munster.•40
地点 • 全部
Wehi，墨尔本，澳大利亚，3分钟前
德国，3分钟前
美国，29分钟前
爱尔兰共和国，1小时前
萨勒诺大学，萨勒诺，意大利，2小时前
内容 搜索
用户
标签
徽章
帮助 关于
常问问题
使用权 rss.
API.
统计

使用本网站构成了我们的接受用户协议和隐私政策。

由我们提供动力2.3.3版