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131
的观点
P调整值在Deseq2
DESeq2
统计数据
•3天前更新
耶稣
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43
的观点
工作:
科学家/高级科学家,统计遗传学家
测序
遗传学
GeneticsPed
统计数据
8天前
António米格尔·德·杰西·多明戈斯
•480年
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79
的观点
工作:
蛋白质组学Bioinformatician
支持,
蛋白质组学
统计数据
工作
27天前
劳拉
•0
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69
的观点
工作:
北卡罗来纳大学夏洛特分校生物统计学/生物信息学研究科学家
singlecellRNA-Seq
pathview
R
统计数据
7周前更新
罗Weijun
♦1.5 k
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One hundred.
的观点
Padj的重新计算(P调整值)
统计数据
Benjamini-Hochberg过程
deseq2
3个月前
Matan G。
•30
•3个月前更新
迈克尔的爱
31 k
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93
的观点
工作:
Eurac研究公司在意大利生物医学统计方面有多个空缺职位
流行病学
统计数据
生物信息学
工作
3个月前
约翰内斯Rainer
♦1.7 k
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75
的观点
工作:
美国环保署两个生物信息学研究职位
生物信息学
毒理学
工作
sequenicng
统计数据
5个月前•10周前更新
whduke
•0
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1.1 k
的观点
工作:
生物信息学/生物统计学博士后和博士研究生
基因组学
总会在
R
遗传学
统计数据
2.5年前•8周前更新
罗Weijun
♦1.5 k
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75
的观点
工作:
癌症基因组学博士后研究员
基因组学
西雅图
生物信息学
数据科学
统计数据
工作
7个月前
弗雷德·哈奇(招聘)
•40
3.
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1.3 k
的观点
工作:
澳大利亚WEHI统计生物信息学和蛋白质组学博士后科学家
工作
蛋白质组学
工作
统计数据
14个月前•12个月前更新
戈登•史密斯
41 k
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467
的观点
工作:
生物信息学/生物统计学博士后和博士研究生
总会在
R
统计数据
基因组学
大数据
工作
23个月前•13个月前更新
罗Weijun
♦1.5 k
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87
的观点
如何处理批效应以及与实验变量的相互作用
deseq2
统计数据
微分表达式
14个月前
一个
•0
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143
的观点
在设计中排除交互术语
deseq2
统计数据
造型
15个月前
polyptwo
•0
•15个月前更新
迈克尔的爱
31 k
2
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206
的观点
在limma中如何计算调整后的p值
limma
r
转录组
罗斯福
统计数据
15个月前
Wuschel
•10
•15个月前更新
戈登•史密斯
41 k
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164
的观点
用DEP进行蛋白质组学数据分析,无重复
部
蛋白质组学
统计数据
limma
17个月前
tatabox
•0
3.
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3.
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250
的观点
使用其他LFC收缩方法计算DESeq2中的p值
deseq2
apeglm
统计数据
19个月前
zefrieira
•0
•19个月前更新
迈克尔的爱
31 k
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227
的观点
在GENESIS或其他Bioconductor GWAS包中进行有效的重采样以获得经验p值?
《创世纪》
GWAS
重采样
重新取样
统计数据
23个月前
naglemi
•10
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189
的观点
不匹配分布的包?
遗传学
统计数据
24个月前
myriam.croze07
•0
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4
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628
的观点
不平衡样本量
deseq2
bioconductor
生物信息学
统计数据
2.1年前
casikecola
•0
•2.1年前更新
迈克尔的爱
31 k
1
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338
的观点
这一切都是新手
bioconductor
统计数据
2.3年前
sportwoo
•0
8
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8
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2.2 k
的观点
从计数和归一化到负值的轰击变换
rnaseq
轰
limma
, tcga
统计数据
2.3年前
初学者
•50
•2.3年前更新
莱恩·c·汤普森
7.6 k
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305
的观点
如何使用捕捉多个基因的微阵列探针?
affymetrix微阵列
微阵列
探针
统计数据
2.4年前
ravelarvargas
•0
•2.4年前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
55 k
1
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4
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404
的观点
ROAST论文的基因集统计是否与.roastEffects R函数中实现的基因集统计相对应?
limma
烤
统计数据
源代码
基因组检测
2.4年前
安德里亚Carenzo
•0
0
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2
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350
的观点
比较两个GOstats结果列表
gostats
统计数据
2.6年前
sven.schenk
•10
•2.6年前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
55 k
1
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439
的观点
工作:
统计研究助理
生物统计学
统计数据
情景应用程序
git
分析
工作
2.7年前
弗雷德·哈奇(招聘)
•40
0
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376
的观点
离散度的先验估计
DSS
dmltest
贝叶斯
统计数据
甲基化
2.8年前
floriandeckert
•30
0
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0
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406
的观点
新闻:
SCANGEN: ISMB 2018单细胞癌症基因组学研讨会
单个细胞
癌症基因组学
统计数据
新闻
2.8年前
kieranrcampbell
•30
0
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0
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406
的观点
关于致病菌包的两个问题
通路
统计数据
微阵列
3.0年前
arronar
•0
10
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6
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3.2 k
的观点
lfcThreshold对DESeq2中p值的影响
deseq2
rnaseq
统计数据
3.3年前
拉斯•弗雷泽
•10
•3.3年前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
55 k
2
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436
的观点
当相互作用时,删除edgeR上的批处理效果
rnaseq
刨边机
统计数据
模型矩阵
3.3年前
大卫Rengel
•70年
•3.3年前更新
史蒂夫Lianoglou
13 k
0
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515
的观点
为相对于TSS的不同峰值位置分配统计数据
chipseeker
chipseq
统计数据
3.3年前
rbronste
•60
0
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778
的观点
工作:
生物统计学/生物信息学研究科学家
统计数据
遗传学
基因组学
R
工作
3.9 years ago•3.8年前更新
罗Weijun
♦1.5 k
1
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1.2 k
的观点
如何在R中进行预排名的GSEA ?
r
微阵列
统计数据
GSEA
5.9年前
尼莫
•80年
•更新于3.9年前
predeus
•0
0
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691
的观点
工作:
生物信息学家,研究程序员
R
基因组学
统计数据
工作
3.9年前
radel
•0
1
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1.7 k
的观点
DESeq2使用的统计检验
deseq2
统计数据
3.9年前
elhamdallalbashi
•0
•更新于3.9年前
莱恩·c·汤普森
7.6 k
2
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2
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3.4 k
的观点
edgeR:如何计算logFC的FDR ?(错误发现率)
刨边机
bioconductor
罗斯福
统计数据
差异基因表达
4.1年前
jol.espinoz
•30
1
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870
的观点
工作:
计算癌症研究博士职位
计算生物学
图像分析
癌症基因组学
统计数据
工作
4.1年前
贝恩德•菲舍尔
•540年
0
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587
的观点
工作:
在免疫公司,剑桥MA和纽约寻找具有RNA-Seq和/或统计学专业知识的计算生物学家
rna-seq
中枢神经系统
神经退化
统计数据
计算生物学
工作
4.2年前
mmartin
•20
0
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0
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658
的观点
工作:
美国北卡罗来纳大学夏洛特分校生物统计学/生物信息学博士后
遗传学和基因组学
组学数据
统计数据
发展
R
工作
4.5 years ago•4.3年前更新
罗Weijun
♦1.5 k
0
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0
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1.2 k
的观点
新闻:
单细胞生物学统计挑战研讨会,2017年4月30日至5月5日,在阿斯科纳蒙特维尔塔别墅举行
车间
统计数据
单细胞
新闻
4.4年前
沃尔夫冈•休伯
13 k
0
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0
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1.1 k
的观点
工作:
加州大学旧金山分校生物信息学程序员(统计学家)
R
bioinformatician工作
Perl
Python
统计数据
工作
4.8年前•4.5年前更新
clif.duhn
•0
0
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4
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3.0 k
的观点
在DESeq2中有10个多重比较
deseq2
rnaseq
统计数据
4.6年前
kissmatee
•0
•4.6年前更新
迈克尔的爱
31 k
2
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3.
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761
的观点
RNAseq异常值是一个临界样本
rnaseq
离群值
统计数据
批处理效果
4.6年前
grastalt27
•0
•4.6年前更新
戈登•史密斯
41 k
2
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1
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462
的观点
Limma用于大样本量和不平衡的基因表达分析
limma
微阵列
统计数据
4.6年前
tati6406
•0
•4.6年前更新
亚伦Lun
♦26 k
7
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3.
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1.5 k
的观点
不同的topTable()结果与Limma有或没有指定系数
limma
微阵列
统计数据
4.8年前
krr
•0
•4.8年前更新
戈登•史密斯
41 k
19
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4
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5.1 k
的观点
edgeR logFC上的置信区间
刨边机
统计数据
置信区间
6.3年前
ri.lars
•40
•4.8年前更新
nwvidal
•0
0
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2
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735
的观点
计算测试得分统计显著性使用对照得分从洗牌人口
统计数据
假设
R
4.8年前
吩咐
•310年
0
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0
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971
的观点
工作:
英国克鲁克曼彻斯特研究所计算生物学家(基因组统计分析师)职位
工作
生物信息学
总会在
基因组学
统计数据
工作
4.9年前
许新良
•10
4
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13
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7.6 k
的观点
DESeq如何计算p值?
deseq
差异基因表达
统计数据
假定值
4.9年前
Giard
•10
•4.9年前更新
莱恩·c·汤普森
7.6 k
0
票
4
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1.4 k
的观点
XCMS用于靶向代谢组学/脂质组学/蛋白质组学
xcms
代谢组学
lipidomics
统计数据
5.0年前
泰坦
•0
55个结果•页面
二选一
最近……
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注释:ChIP seeker注释错误
通过
茉莉花
•0
你找到解决办法了吗?我也有这个问题。你用的是hg38参考吗?
回答:将LowRankMatrix强制为dgCMatrix错误
通过
亚伦Lun
♦26 k
我有一个更长的答案,但我不小心按了ESC并删除了它。我只提到**tl, dr**。立即修复:只需擦拭…
评论:txImport:样本数据中似乎缺少一个基因
通过
詹姆斯·w·麦克唐纳
55 k
请不要在多年前的帖子上添加评论。相反,问一个新问题。
评论:txImport:样本数据中似乎缺少一个基因
通过
马丁
•0
你好,我也是新来的,我也在学习。如果我创建自己的表tx2gene。tx2基因中这些缺失的转录本会引起问题吗?
注释:avereps函数由limma包
通过
莉莉
•10
谢谢你的回复
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差异表达分析:排列试验
注释:avereps函数由limma包
注释:avereps函数由limma包
答:DESeq2中的log2 Fold Change与由归一化cou计算的FC不相同
注释:vsn2的一层
奖
•所有
受欢迎的问题
来
efratsh
•0
先知
来
ilysR
•0
受欢迎的问题
来
苏菲·玛丽恩·德·普罗斯
•0
先知
来
jol.espinoz
•30
史诗的问题
来
jol.espinoz
•30
位置
•所有
德国,
刚才
爱尔兰共和国,
6分钟前
美国,
1小时前
海德堡EMBL / de.NBI,
1小时前
海边的城市,
1小时前
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