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singlecellexperiment
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61年
的观点
SingleCellExperiment包:存储reducedDims元数据
SingleCellExperiment
1天前
知母
•0
1
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3
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103年
的观点
10 x FeatureBarcode生产太多的“细胞”
SingleCellExperiment
DropletUtils
SingleCellData
21天前
msn
•0
•18天前更新
亚伦Lun
♦26 k
2
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5
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111年
的观点
天窗:aggregateAcrossCells()在大型SingleCellExperiment崩溃R
食物
SingleCellExperiment
天窗
嘘
21天前
enricoferrero
•570年
•20天前更新
亚伦Lun
♦26 k
0
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2
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85年
的观点
从phenograph输出singlecellexperiment对象元数据
SingleCellExperiment
5周前
achaillon
•0
1
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3
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103年
的观点
singlecellexperiments标记聚类后
催化剂
SingleCellExperiment
5周前
achaillon
•0
•更新5周前
crowellh
•30
1
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3
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123年
的观点
SingleCellExperiment和单一识别T细胞的子集
cellsubset
单
SingleCellExperiment
6周前•更新5周前
achaillon
•0
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2
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126年
的观点
使用确定的:去除细胞周期影响:regressBatches()和适当的使用纠正UMI矩阵
scRNAseq
后面;
SingleCell
SingleCellExperiment
食物
7周前•更新6周前
jirkanov
•0
1
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2
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107年
的观点
当转换修SingleCellExperiment错误
修拉
SingleCellExperiment
7周前
lirongrossmann
•30
0
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1
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67年
的观点
提高runNMF的运行时间
runNMF
嘘
singlecell
SingleCellExperiment
11周之前
lirongrossmann
•30
•更新11周之前
亚伦Lun
♦26 k
2
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2
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95年
的观点
如何运行runNMF并行?
嘘
单
SingleCellExperiment
12周前•更新11周之前
p.joshi
•20
0
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6
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243年
的观点
细胞类型之间的差异和集群使用SingleCellExperiment和单一
singlecell
singlecellexperiment
umap
单
4个月前
lirongrossmann
•60
•4个月前更新
亚伦Lun
♦26 k
1
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One hundred.
的观点
德在单细胞生物复制实验
singleCellExperiment
4个月前
emy_66
•0
•4个月前更新
亚伦Lun
♦26 k
0
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4
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119年
的观点
标记基因在单个细胞实验
单个细胞
singlecellexperiment
基因标记
5个月前
lirongrossmann
•30
•5个月前更新
亚伦Lun
♦26 k
0
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80年
的观点
单细胞WGS和ATAC-seq工具
单个细胞
singlecellexperiment
atac seq
WGS
5个月前
lirongrossmann
•60
0
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3
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213年
的观点
标记基因在单
单
singlecell
singlecellexperiment
5个月前
lirongrossmann
•30
•5个月前更新
亚伦Lun
♦26 k
1
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2
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63年
的观点
南加州爱迪生公司识别功能
SingleCellExperiment
集群
身份
南加州爱迪生公司
8个月前
reinepapillon
•0
•更新8个月前
亚伦Lun
♦26 k
0
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1
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58
的观点
清晰的错误消息在SingleCellExperiment cbind
singlecellexperiment
南加州爱迪生公司
嘘
8个月前
bharris
•0
•更新8个月前
亚伦Lun
♦26 k
0
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2
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101年
的观点
质量控制SingleCellExperiment
SingleCellExperiment
嘘
南加州爱迪生公司
质量控制
10个月前
琳达
•0
•10个月前更新
亚伦Lun
♦26 k
0
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2
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255年
的观点
不能加载SingleCellExperiment对象
软件错误
SingleCellExperiment
13个月前
afichten
•0
•13个月前更新
亚伦Lun
♦26 k
0
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1
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207年
的观点
拟声唱法cbind singlecellexperiment对象问题
嘘
SingleCellExperiment
14个月前
santos22903
•0
•14个月前更新
亚伦Lun
♦26 k
0
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2
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205年
的观点
PCA局外人清洁
scRNAseq
管道
修拉
SingleCellExperiment
14个月前
albadrs.93
•10
3
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2
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392年
的观点
单个单元格数据:添加随机效应与多级试验设计主题
SingleCellExperiment
食物
limma
simpleSingleCell
20个月前
马特骡
•0
•更新20个月前
亚伦Lun
♦26 k
2
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3
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973年
的观点
错误——大小因素应该是正实数(使用normalize()函数)
嘘
食物
singlecellexperiment
正常化
质量控制
21个月前
kushshah
•10
2
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3
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299年
的观点
无法改变点大小plotExpression ()
嘘
plotexpression
singlecellexperiment
策划
21个月前
kushshah
•10
•21个月前更新
亚伦Lun
♦26 k
1
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2
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343年
的观点
结合和使用10倍基因组学在SingleCellExperiment对象输出
SingleCellExperiment
21个月前
马修·桑顿
•330年
•21个月前更新
亚伦Lun
♦26 k
2
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228年
的观点
Bioconductor RPKM计数或原始计数
singlecellexperiment
rpkm
归一化
质量控制
22个月前
kushshah
•10
•更新22个月前
亚伦Lun
♦26 k
4
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5
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368年
的观点
从运用获得CDSCHROM值/钥匙使用TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene mapIds象征
运用
cdschrom
org.Hs.eg.db
AnnotationDbi
SingleCellExperiment
22个月前
kushshah
•10
•更新22个月前
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
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2
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317年
的观点
如何使用dplyr动词SingleCellExperiment colData槽的对象?
SingleCellExperiment
2.0年前
ramonmassoni
•10
•更新2.0年前
马丁•摩根
25 k
4
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6
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378年
的观点
如何最好地代表权重SummarizedExperiment还是SingleCellExperiment ?
SummarizedExperiment
SingleCellExperiment
2.0年前
保罗•哈里森
•90年
•更新2.0年前
大卫。risso
•850年
3
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7
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585年
的观点
从SingleCellExperiment容器删除行
南加州爱迪生公司
singlecellexperiment
scRNAseq
构造子集
2.1年前
TJ
•0
•更新2.1年前
亚伦Lun
♦26 k
0
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1
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797年
的观点
从SingleCellExperiment反褶积方法在修拉和转换
嘘
修拉
singlecellexperiment
rnaseq
2.1年前
hamza_karakurt
•50
•更新2.1年前
戈登•史密斯
42 k
1
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3
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337年
的观点
如何解决这些trendVar()警告和错误吗
嘘
食物
singlecellexperiment
2.1年前
辛格的阿布
•20
•更新2.1年前
亚伦Lun
♦26 k
3
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5
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364年
的观点
plotPlatePosition和plate_position
嘘
R
singlecellexperiment
2.1年前
TJ
•0
•更新2.1年前
亚伦Lun
♦26 k
3
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2
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590年
的观点
修拉在MAC SingleCellExperiment转换错误
singlecellexperiment
单细胞
rnaseq
2.2年前
hamza_karakurt
•50
•更新2.2年前
史蒂夫Lianoglou
13 k
2
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2
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486年
的观点
建议结合多个10 x运行到一个SingleCellExperiment
singlecellexperiment
dropletutils
simplesinglecell
2.3年前
彼得希
•460年
•更新2.3年前
亚伦Lun
♦26 k
1
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5
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936年
的观点
newSCESet和SingleCellExperiment基本差异和TMM正常化
singlecellexperiment
单细胞
rnaseq
修拉
嘘
2.3年前
hamza_karakurt
•50
6
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12
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1.4 k
的观点
合并RNAseq不同深度的数据集
singlecellexperiment
食物
测序深度
批处理效果
scrnaseq
2.6年前
liam.salleh
•0
•更新2.6年前
亚伦Lun
♦26 k
0
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1
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1.4 k
的观点
转换从修SingleCellExperiment对象
修拉
SingleCellExperiment
2.7年前
沃尔夫冈•休伯
13 k
5
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2
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400年
的观点
访问归一化计算
飞溅
singlecellexperiment
嘘
2.8年前
luke.zappia
•50
4
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15
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1.8 k
的观点
警告:消极的大小的因素
大小的因素
负
食物
singlecellexperiment
嘘
2.9年前
玛丽娜教授
•0
•更新2.9年前
亚伦Lun
♦26 k
1
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2
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794年
的观点
SingleCellExperiment对象不能使用拟声唱法包吗?
嘘
singlecellexperiment
simplesinglecell
3.0年前
Xingyu
•0
•更新3.0年前
亚伦Lun
♦26 k
2
票
2
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4.5 k
的观点
错误:seq_len (ncol(化验)):第一个元素使用的长度。出的论点
singlecellexperiment
3.0年前
玛丽娜教授
•0
5
票
2
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2.4 k
的观点
原始统计数据SC3和SingleCellExperiment设置问题
singlecellexperiment
sc3
嘘
3.2年前
chengyuzou
•10
•更新3.2年前
弗拉基米尔•Kiselev
•150年
3
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3
回复
1.1 k
的观点
不能创建SingleCellExperiment对象
singlecellexperiment
3.2年前
Shian苏
•40
•更新3.2年前
亚伦Lun
♦26 k
3
票
5
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3.0 k
的观点
SingleCellExperiment函数在SingleCellExperiment包返回错误(复制)
R
bioconductor
singlecellexperiment
单个细胞
3.3年前
沃尔特·f·鲍曼
•10
•更新3.3年前
lahrmannu
•0
0
票
2
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1.7 k
的观点
问题在处理SingleCellExperiment对象走开
嘘
SingleCellExperiment
3.3年前
chriad
•10
•更新3.3年前
戴维斯
•90年
1
投票
1
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498年
的观点
计算方法不出口
singlecellexperiment
3.4年前
弗拉基米尔•Kiselev
•150年
47•结果页面
1的1
最近……
回复
备注:当加载DEP RStudio错误
通过
拿破仑情史。
•0
我发现我的来源问题。我和莫哈韦运行R(暂时还没更新我的Mac),发现一个解决方案在一篇文章在圣…
备注:问题在减去芯片使用ChIPSeqSpike Seq试验输入
通过
Ainul
•0
嗨尼古拉斯,反正接力传送< - # #文件路径帐目基因组信息(nb的铬,铬的名字,长度铬)我可以使用th…
备注:问题在减去芯片使用ChIPSeqSpike Seq试验输入
通过
Ainul
•0
谢谢尼古拉斯,我先试一试
答:如何让BiocParallel DiffBind当在windows系统下工作
通过
罗里斯塔克
♦3.5 k
这是正确的。“BiocParallel”(进而DiffBind)不支持多个并行操作在Windows平台上。
评论:比较不同分数和结果是在DiffBind浓缩的
通过
罗里斯塔克
♦3.5 k
我真的不能够支持旧版本的细节。我知道网站的报告应该是正确的p-va…
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答:如何检索基因组坐标entrezID及其各自的列表
答:如何检索基因组坐标entrezID及其各自的列表
备注:如何检索基因组坐标entrezID及其各自的列表
备注:如何检索基因组坐标entrezID及其各自的列表
答:如何检索基因组坐标entrezID及其各自的列表
奖
•所有
受欢迎的问题
来
erwan.scaon
•10
很好的问题
来
komal.rathi
•80年
史诗的问题
来
komal.rathi
•80年
欣赏
来
马修·里奇
•950年
受欢迎的问题
来
s.munster
•40
位置
•所有
EMBL海德堡/ de.NBI,
6分钟前
意大利,
23分钟前
WEHI,墨尔本,澳大利亚,
59分钟前
美国,
1小时前
阿根廷罗萨里奥(德罗萨里奥所),
1小时前
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