登录
报名
关于
常见问题解答
问一个问题
最新的
新闻
工作
教程
标签
用户
新职位
最新的
新闻
工作
教程
论坛
标签
地球
用户
登录
报名
关于
关于
常见问题解答
限制
所有的时间
今天
本周
这个月
今年
没有回答
所有的帖子
排序
更新
答案
书签
创建
回复
排名
的观点
票
显示:
食物
•
重置
2
票
5
回复
115年
的观点
天窗:aggregateAcrossCells()在大型SingleCellExperiment崩溃R
食物
SingleCellExperiment
天窗
嘘
26天前
enricoferrero
•570年
•更新25天前
亚伦Lun
♦26 k
0
票
0
回复
39
的观点
创建一个稳定的batch-corrected scRNA-Seq数据与多个数据集和多个集成
嘘
singlecell
食物
BatchEffect
3个月前
hamza_karakurt
•50
1
投票
1
回复
85年
的观点
食物:computeSumFactors单细胞ATAC-seq数据
食物
3个月前
才气Armen
•0
•3个月前更新
亚伦Lun
♦26 k
1
投票
1
回复
136年
的观点
findMarkers(){残渣}没有找到标记
findMarkers
食物
5个月前
paula.vaccarello
•0
•5个月前更新
亚伦Lun
♦26 k
1
投票
3
回复
150年
的观点
multiBatchNorm与calculateSumFactors连接数据集
后面;
食物
5个月前
才气Armen
•0
•5个月前更新
亚伦Lun
♦26 k
3
票
4
回复
279年
的观点
与pseudobulkDGE scRNA-seq视总体差异表达分析()
食物
嘘
天窗
6个月前
enricoferrero
•570年
•6个月前更新
亚伦Lun
♦26 k
2
票
6
回复
186年
的观点
为什么一个平均引用用于DESeq2正常化吗?
deseq2
食物
后面;
7个月前
才气Armen
•0
•更新7个月前
亚伦Lun
♦26 k
3
票
4
回复
145年
的观点
去除细胞周期基因在大数据集的集成
食物
强热带风暴
8个月前
p.joshi
•20
•更新8个月前
亚伦Lun
♦26 k
0
票
4
回复
96年
的观点
食物是quickCluster错误
食物
8个月前
marc.tormo
•0
•更新8个月前
亚伦Lun
♦26 k
3
票
1
回复
112年
的观点
输出利物浦Wilcox-based findMarkers
食物
8个月前
ATpoint
•400年
•更新8个月前
亚伦Lun
♦26 k
7
票
5
回复
150年
的观点
最优簇数识别使用buildSNNgraph和igraph集群
食物
差距数据
单个细胞集群
9个月前
p.joshi
•20
•更新9个月前
亚伦Lun
♦26 k
4
票
3
回复
117年
的观点
Downsample Downsample与否?
scrna-seq
downsampleBatches
食物
9个月前
p.joshi
•20
•更新9个月前
亚伦Lun
♦26 k
0
票
3
回复
62年
的观点
如何doubletCell()分数转换为单/紧身上衣注释吗?
食物
紧身上衣
10个月前
tkapell
•10
•10个月前更新
亚伦Lun
♦26 k
2
票
1
回复
209年
的观点
批量修改(内容)与TPM的价值观
scRNA-Seq
嘘
食物
rna-seq
的内容
15个月前
hamza_karakurt
•50
•15个月前更新
亚伦Lun
♦26 k
1
投票
1
回复
140年
的观点
她的方法在残渣重量::pairwiseWilcox
食物
16个月前
才气Armen
•0
•16个月前更新
亚伦Lun
♦26 k
0
票
5
回复
780年
的观点
不能安装Bioconductor v3.9
食物
cellassign
bioconductor
16个月前
tkapell
•10
•16个月前更新
马丁•摩根
25 k
1
投票
2
回复
191年
的观点
减轻细胞周期影响scRNA-seq使用阻塞因素或设计矩阵
食物
16个月前
s1437643
•10
•16个月前更新
亚伦Lun
♦26 k
2
票
1
回复
173年
的观点
食物:排除基因与极高的表达规范化?
单细胞RNA-seq
食物
归一化
17个月前
daniel.borshagovski
•0
•17个月前更新
亚伦Lun
♦26 k
1
投票
3
回复
169年
的观点
在buildSNNGraph k参数
食物
18个月前
才气Armen
•0
•在18个月前更新
亚伦Lun
♦26 k
1
投票
5
回复
404年
的观点
预处理残渣::doubletCells
食物
simpleSingleCell
18个月前
才气Armen
•0
•在18个月前更新
亚伦Lun
♦26 k
4
票
4
回复
736年
的观点
使用limma和磨边机的微分表达式Drop-seq / 10 xgenomics scRNA-seq数据
limma
刨边机
simplesingleCell
食物
嘘
18个月前
波格丹
•610年
•在18个月前更新
亚伦Lun
♦26 k
4
票
4
回复
331年
的观点
scRNA-seq:细胞周期阶段的分类
嘘
食物
19个月前
波格丹
•610年
•更新19个月前
亚伦Lun
♦26 k
3
票
7
回复
415年
的观点
scRNA-seq: runPCA()和denoisePCA ()
嘘
食物
19个月前
波格丹
•610年
•更新19个月前
亚伦Lun
♦26 k
1
投票
4
回复
238年
的观点
scRNA-seq细胞集群的数量
食物
嘘
sc3
19个月前
波格丹
•610年
•更新19个月前
亚伦Lun
♦26 k
0
票
7
回复
247年
的观点
集群之间的微分表达式在scRNAseq(在不同的“治疗”)
嘘
limma
scde
食物
sc3
19个月前
波格丹
•610年
0
票
1
回复
159年
的观点
emptyDrops结果充满NAs
食物
dropletUtils
嘘
scRNA-Seq
20个月前
hamza_karakurt
•50
3
票
2
回复
255年
的观点
是logFC log2褶皱变化在食物或其他基地::findMarkers吗
食物
20个月前
克里斯·康利
•0
•更新20个月前
亚伦Lun
♦26 k
3
票
2
回复
394年
的观点
单个单元格数据:添加随机效应与多级试验设计主题
SingleCellExperiment
食物
limma
simpleSingleCell
20个月前
马特骡
•0
•更新20个月前
亚伦Lun
♦26 k
2
票
3
回复
982年
的观点
错误——大小因素应该是正实数(使用normalize()函数)
嘘
食物
singlecellexperiment
正常化
质量控制
22个月前•21个月前更新
kushshah
•10
2
票
4
回复
375年
的观点
一些问题通过使用mnnCorrect删除批处理效果
批处理效果
单个细胞
mnnCorrect
食物
21个月前
xingxd16
•0
•21个月前更新
亚伦Lun
♦26 k
4
票
4
回复
355年
的观点
使用doubletCells()函数之前或之后批校正?
嘘
食物
scRNA-Seq
doubletCells
21个月前
hamza_karakurt
•50
•21个月前更新
亚伦Lun
♦26 k
4
票
5
回复
423年
的观点
用SC3批更正内容值
SC3
嘘
食物
scRNA-Seq
批校正
22个月前
hamza_karakurt
•50
•更新22个月前
弗拉基米尔•Kiselev
•150年
2
票
2
回复
232年
的观点
正常化homogenious感染细胞数量
归一化
单个细胞
食物
22个月前
jcvera
•0
•更新22个月前
亚伦Lun
♦26 k
0
票
1
回复
257年
的观点
食物:执行后德cell-typle identifaction纠正和集成数据集
食物
MNN_correct
微分表达式
单细胞
22个月前
baldissera152
•0
1
投票
2
回复
377年
的观点
邓恩指数从scRNA-Seq集群
scRNA-Seq
聚类
嘘
食物
邓恩指数
23个月前
hamza_karakurt
•50
•23个月前更新
亚伦Lun
♦26 k
2
票
5
回复
316年
的观点
在scRNA-Seq模块化集群和微分表达式的值
嘘
食物
igraph
scRNA-Seq
腐烂
23个月前
hamza_karakurt
•50
•23个月前更新
亚伦Lun
♦26 k
1
投票
2
回复
834年
的观点
添加标签在集群t-SNE情节和改变颜色
食物
嘘
Rtsne
ggplot2
scRNA-Seq
23个月前
hamza_karakurt
•50
•23个月前更新
亚伦Lun
♦26 k
2
票
2
回复
658年
的观点
错误安装的残渣
S4Vectors
IRanges
XVector
GenomicRanges
食物
2.1年前
莫莫
•0
•更新2.1年前
亚伦Lun
♦26 k
0
票
2
回复
266年
的观点
食物/嘘规范化矩阵
食物
嘘
归一化计算
2.1年前
拉
•80年
•更新2.1年前
亚伦Lun
♦26 k
7
票
5
回复
389年
的观点
食物:日志项表达式在样本/细胞内不同基因之间具有可比性吗?
食物
嘘
2.1年前
heyao
•30
•更新2.1年前
亚伦Lun
♦26 k
1
投票
3
回复
341年
的观点
如何解决这些trendVar()警告和错误吗
嘘
食物
singlecellexperiment
2.1年前
辛格的阿布
•20
•更新2.1年前
亚伦Lun
♦26 k
2
票
2
回复
718年
的观点
(MnnCorrect)删除批处理效果,但保持条件的影响
单细胞
食物
mnncorrect
rnaseq
2.2年前
约翰•里德
•10
•更新2.2年前
亚伦Lun
♦26 k
2
票
6
回复
416年
的观点
改变与拟声唱法的群集的数量
嘘
食物
scrnaseq
聚类
2.2年前
shbrief
•10
•更新2.2年前
亚伦Lun
♦26 k
0
票
3
回复
340年
的观点
makeTechTrend误差()的食物
食物
单细胞
seq.default
2.5年前
Guangshuai贾
•0
•更新2.5年前
亚伦Lun
♦26 k
1
投票
1
回复
480年
的观点
调整的数量与残渣/ buildSNNGraph集群
食物
buildsnngraph
cluster_walktrap
单细胞
2.5年前
托比
•0
•更新2.5年前
亚伦Lun
♦26 k
1
投票
2
回复
548年
的观点
食物——问题:错误当调用通过fastMNN cosineNorm
食物
fastMNN
mnnCorrect
2.6年前
托比
•0
•更新2.6年前
亚伦Lun
♦26 k
1
投票
2
回复
731年
的观点
继续这个错误”的行数是不一样的在批次”虽然我2矩阵具有相同的行数
mnncorrect
批处理效果
食物
2.6年前
sara.nejat
•0
•更新2.6年前
亚伦Lun
♦26 k
3
票
3
回复
3.3 k
的观点
rowMeans rowSums()()不工作在稀疏矩阵“dgCMatrix”
嘘
食物
单细胞
2.8年前
MengChun曾
•10
•更新2.6年前
马丁•摩根
25 k
6
票
12
回复
1.4 k
的观点
合并RNAseq不同深度的数据集
singlecellexperiment
食物
测序深度
批处理效果
scrnaseq
2.6年前
liam.salleh
•0
•更新2.6年前
亚伦Lun
♦26 k
0
票
1
回复
528年
的观点
转换scater-normalized UMI Monocle CellDataSet数据
嘘
食物
umi
单片眼镜
2.8年前
supremerulersuraj
•0
•更新2.8年前
亚伦Lun
♦26 k
71•结果页面
1的2
最近……
回复
备注:我怎么能使用bioconductor和Deseq2 linux ubuntu 18
通过
凯文Blighe
2.4 k
这是默认R ?——它应该4.0.x。还应该有更多的行中的文本之前的错误消息。你能把它…
备注:错误:DBA peakset对象已经形成的一个共识
通过
ahua217
•0
如果零山峰最终他们可以生产,我将重新考虑我是否应该生成一个关于这些维恩图。谢谢!
备注:错误:DBA peakset对象已经形成的一个共识
通过
ahua217
•0
谢谢你斯塔克博士。这是信息从sessionInfo () > sessionInfo () R版本4.0.3(2020-10-10)平台:x86_64-apple-darwin…
备注:在DESeq2正常化
通过
ATpoint
•400年
如果你有这样的问题(如何工具x是y),第一步总是看报纸是基于工具。在这种情况下…
备注:桅杆比较两个条件与几个捐助者
通过
埃
•0
安德鲁你好,对不起跳入这个问题但是我也有类似的情况。关于你的回答,我怎么能告诉捐赠者数量…
票
答:没有结果plotPCA ()
备注:DEseq2比较指令
备注:DEseq2比较指令
备注:DEseq2比较指令
答:DEseq2比较指令
奖
•所有
先知
来
amel.zulji
•0
受欢迎的问题
来
erwan.scaon
•10
很好的问题
来
komal.rathi
•80年
史诗的问题
来
komal.rathi
•80年
欣赏
来
马修·里奇
•960年
位置
•所有
美国,
1分钟前
爱尔兰共和国,
2分钟前
德国,
6分钟前
美国,
47分钟前
瑞士,
1小时前
内容
搜索
用户
标签
徽章
帮助
关于
常见问题解答
访问
RSS
API
统计数据
使用本网站的构成接受我们
用户协议和隐私政策
。
由的
2.3.3版本