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112
视图
scuttle :: gentregateacrosscells()在大型单链球上撞击r
斯克兰
Singlecellexperiment
砍伐
评分
22天前
Enricoferrero
•570
•22天前更新
亚伦·伦
♦26K
2
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2
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96
视图
如何并行运行RunNMF?
评分
单身的
Singlecellexperiment
12周前•更新11周前
P.Joshi
•20
0
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0
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37
视图
创建具有多个数据集和多个集成的稳定批处理校正的SCRNA-SEQ数据
评分
Singlecell
斯克兰
批处理效应
12周前
hamza_karakurt
•50
2
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3
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232
视图
用于计算“ scater”软件包中TPM的长度
评分
计算
rnaseq
3个月前
马坦·G。
•30
•3个月前更新
亚伦·伦
♦26K
5
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5
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162
视图
为单个单元运行NMF
NMF
评分
3个月前
Lirongrossmann
•30
0
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1
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115
视图
更改注释颜色PlotheatMap
评分
plotheatmap
4个月前
Simone.Avesani22
•0
3
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4
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276
视图
用pseudobulkdge()scrna-seq伪散差异表达分析
斯克兰
评分
砍伐
5个月前
Enricoferrero
•570
•5个月前更新
亚伦·伦
♦26K
2
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1
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80
视图
FastMNN中的缩放选项
FastMnn
评分
Batchelor
7个月前
Atpoint
•390
•7个月前更新
亚伦·伦
♦26K
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1
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58
视图
清晰的错误消息在单圈Perlexperiment cbind中
Singlecellexperiment
SCE
评分
8个月前
巴里斯
•0
•8个月前更新
亚伦·伦
♦26K
0
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4
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87
视图
标准化病毒感染的单细胞数据的问题
扫描
评分
单细胞
正常化
10个月前
珍妮·德纳维奇(Jenny Drnevich)
♦2.0k
•10个月前更新
亚伦·伦
♦26K
0
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4
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138
视图
质量控制在SingleCellexperiment
Singlecellexperiment
评分
SCE
质量控制
10个月前
琳达
•0
•19小时前更新
1498554536
•0
0
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1
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207
视图
scbind for Singlecellexperiment对象问题
评分
Singlecellexperiment
14个月前
Santos22903
•0
•14个月前更新
亚伦·伦
♦26K
4
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1
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307
视图
在Scater软件包中找不到函数“ plotQc”
评分
15个月前
摩尔奇
•20
•15个月前更新
亚伦·伦
♦26K
2
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1
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207
视图
具有TPM值的批次校正(MNN)
scrna-seq
评分
斯克兰
RNA-seq
MNN
15个月前
hamza_karakurt
•50
•15个月前更新
亚伦·伦
♦26K
4
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4
答复
728
视图
使用limma和Edger进行降低序列/10x基因组学SCRNA-SEQ数据的差异表达
林玛
EDGER
Simplesinglecell
斯克兰
评分
18个月前
Bogdan
•610
•18个月前更新
亚伦·伦
♦26K
4
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4
答复
331
视图
SCRNA-SEQ:细胞周期阶段的分类
评分
斯克兰
19个月前
Bogdan
•610
•19个月前更新
亚伦·伦
♦26K
3
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7
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413
视图
scrna-seq:runpca()和denoisepca()
评分
斯克兰
19个月前
Bogdan
•610
•19个月前更新
亚伦·伦
♦26K
1
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4
答复
236
视图
SCRNA-SEQ中的细胞簇数量
斯克兰
评分
SC3
19个月前
Bogdan
•610
•19个月前更新
亚伦·伦
♦26K
0
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7
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246
视图
scrnaseq中簇之间的差异表达(在不同的“治疗”中)
评分
林玛
SCDE
斯克兰
SC3
19个月前
Bogdan
•610
0
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1
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158
视图
空滴定结果是完整的NAS
斯克兰
液滴
评分
scrna-seq
19个月前
hamza_karakurt
•50
2
投票
1
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304
视图
scater :: runpca()delayedmatrix上的错误(delayedArray :::。check_ops_vector_arg_length)
评分
生物兴奋
延迟
20个月前
kevin.rue
•300
•20个月前更新
亚伦·伦
♦26K
2
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3
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974
视图
错误 - 尺寸因子应为正实数(使用strormanize()函数)
评分
斯克兰
Singlecellexperiment
归一化
QC
22个月前•21个月前更新
库什沙
•10
4
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4
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350
视图
在批处理校正之前或之后使用DoubleTcells()函数?
评分
斯克兰
scrna-seq
双电池
21个月前
hamza_karakurt
•50
•21个月前更新
亚伦·伦
♦26K
2
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3
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299
视图
无法更改plotexpression()中的点大小
评分
plotexpression
Singlecellexperiment
绘图
21个月前
库什沙
•10
•21个月前更新
亚伦·伦
♦26K
4
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5
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421
视图
将SC3与批校正的MNN值一起使用
SC3
评分
斯克兰
scrna-seq
批校正
22个月前
hamza_karakurt
•50
•22个月前更新
弗拉基米尔·基塞列夫(Vladimir Kiselev)
•150
6
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3
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552
视图
log2(rpkm)在生物导体中计数
RPKM
评分
钙化
r
表达
22个月前
库什沙
•10
•22个月前更新
亚伦·伦
♦26K
1
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2
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375
视图
Scrna-Seq簇的Dunn索引
scrna-seq
聚类
评分
斯克兰
邓恩索引
23个月前
hamza_karakurt
•50
•23个月前更新
亚伦·伦
♦26K
2
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5
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315
视图
簇的模块化值和scrna-seq中的差异表达
评分
斯克兰
Igraph
scrna-seq
腐烂
23个月前
hamza_karakurt
•50
•23个月前更新
亚伦·伦
♦26K
1
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2
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827
视图
在T-SNE图中添加标签,并更改颜色
斯克兰
评分
RTSNE
GGPLOT2
scrna-seq
23个月前
hamza_karakurt
•50
•23个月前更新
亚伦·伦
♦26K
2
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2
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367
视图
评估错误:无效的Rownames长度
评分
23个月前
Lileijie1992
•0
•23个月前更新
亚伦·伦
♦26K
0
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2
答复
265
视图
SCRAN/SCHATER标准化矩阵
斯克兰
评分
归一化计数
2.1年前
拉德克
•80
•2。1年前更新
亚伦·伦
♦26K
7
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5
答复
389
视图
SCRAN:log计数表达在样品/细胞中不同基因之间的表达是否可比?
斯克兰
评分
2.1年前
嘿
•30
•2。1年前更新
亚伦·伦
♦26K
2
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3
答复
638
视图
织机文件中基因名称/符号的基因ID
评分
Loomr
Scopeloomr
2.1年前
Abhishek Singh
•20
•2。1年前更新
亚伦·伦
♦26K
0
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1
回复
798
视图
seurat中的反卷积方法,并从单链体波动转换
评分
Seurat
Singlecellexperiment
rnaseq
2.1年前
hamza_karakurt
•50
•2。1年前更新
戈登·史密斯(Gordon Smyth)
42k
1
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3
答复
338
视图
如何解决这些Trendvar()警告和错误
评分
斯克兰
Singlecellexperiment
2.1年前
Abhishek Singh
•20
•2。1年前更新
亚伦·伦
♦26K
2
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1
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358
视图
scater中使用的“ runpca”使用的顶级变量功能
评分
PCA
特征
2.1年前
JWS
•0
•2。1年前更新
亚伦·伦
♦26K
3
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5
答复
364
视图
plotplatePosition和plate_position
评分
r
Singlecellexperiment
2.1年前
TJ
•0
•2。1年前更新
亚伦·伦
♦26K
0
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2
答复
687
视图
问题安装SCOTATER
评分
r
生物管理器
生物导体
2.1年前
HFBERG
•0
•2。1年前更新
亚伦·伦
♦26K
2
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6
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416
视图
用Spoter更改聚类数量
评分
斯克兰
scrnaseq
聚类
2.2年前
shbrief
•10
•2。2年前更新
亚伦·伦
♦26K
1
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5
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937
视图
Newsceset和SingleCellexperiment基本差异和TMM归一化
Singlecellexperiment
单细胞
rnaseq
Seurat
评分
2.3年前
hamza_karakurt
•50
0
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6
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605
视图
Spater软件包plotexpression
评分
2.5年前
mayank.geit89
•0
0
投票
1
回复
355
视图
plotqc()中的rnaseq scater错误
评分
plotqc
scrnaseq
2.5年前
弗拉基米尔·克拉西科夫(Vladimir Krasikov)
•90
•2。5年前更新
亚伦·伦
♦26K
3
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3
答复
3.3k
视图
rowsums()rowmeans()在稀疏矩阵“ dgcmatrix”上不起作用
评分
斯克兰
单细胞
2.7年前
Mengchun Tseng
•10
•2。6年前更新
马丁·摩根
25k
0
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1
回复
527
视图
将调节归一化的UMI数据转换为单片celldataset
评分
斯克兰
嗯
单片
2.8年前
至上
•0
•2。8年前更新
亚伦·伦
♦26K
5
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2
答复
400
视图
访问归一化计数
飞溅
Singlecellexperiment
评分
2.8年前
Luke.Zappia
•50
0
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4
答复
2.0k
视图
更改点大小并删除Scater Plotpca中的轮廓
评分
rnaseq
单细胞
3.7年前
编码
•60
•2。8年前更新
Angela.ubn
•0
1
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2
答复
357
视图
将“生物型”插入SCEATER SCE对象
评分
SCE
生物型
r
2.9年前
thebadpenny
•0
•2。9年前更新
亚伦·伦
♦26K
4
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15
答复
1.8k
视图
警告:负尺寸因素
尺寸因子
消极的
斯克兰
Singlecellexperiment
评分
2.9年前
Marina V.V.
•0
•2。9年前更新
亚伦·伦
♦26K
1
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2
答复
794
视图
schoter package无法使用单链球镜对象?
评分
Singlecellexperiment
Simplesinglecell
3.0年前
Xingyu
•0
•3.0年前更新
亚伦·伦
♦26K
0
投票
1
回复
378
视图
计算Qcmetrics在Scater 1.6.2中不接受`数字`
评分
3.0年前
Andrew_mcdavid
•260
•3.0年前更新
亚伦·伦
♦26K
74结果•页面
第2个中的1
最近的 ...
答复
评论:SingleCellexperiment包:存储还原元素元数据
经过
BGE
•0
嗨,从开发人员的角度来看,我有更多的问题,该开发人员定义了继承Singlecellexperiment的类。作为开发人员,我...
评论:与嵌套个体的时间课程DESEQ2
经过
迈克尔·洛夫
31k
伟大的。听起来不错。我还试图在Vignette中阐明为创建所需设计引线时的情况的数据集的方法。
评论:与嵌套个体的时间课程DESEQ2
经过
纳什拉
•0
迈克尔,非常感谢您的回复。设置设计= 〜1以创建原始的deseqdataset效果很好,可以解决Havin…
答案:diffbind 3.0的dba.count()没有bsubcontrol参数
经过
罗里·史塔克(Rory Stark)
♦3.5k
`bsubcontrol`参数已还原为dba.count()`,您只需要更新即可。当前版本为`diffbind_3.0.12`。新的行为…
答案:Biocmanager :: install(“ ensdb.hsapiens.v75”)安装失败,而非零出口stat
经过
詹姆斯·W·麦克唐纳
56k
我无法复制错误,所以也许您只需要重新启动R并重试?``````'> install(“ ensdb.hsapiens.v75”)bioconductor versi…
投票
考虑3个因素的DESEQ2设计模型
评论:与嵌套个体的时间课程DESEQ2
加入生物导体社区顾问委员会
答案:diffbind 3.0的dba.count()没有bsubcontrol参数
答案:基因的基因本体论分析
奖项
• 全部
流行问题
至
Erwan.Scaon
•10
好问题
至
Komal.Rathi
•80
史诗般的问题
至
Komal.Rathi
•80
感谢
至
马修·里奇(Matthew Ritchie)
•960
流行问题
至
S.Munster
•40
位置
• 全部
美国/纽约/Nathan Kline精神病学研究所,
14分钟前
爱尔兰共和国,
2小时前
美国,
2小时前
Embl Heidelberg / de.nbi,
2小时前
澳大利亚墨尔本的Walter和Eliza Hall医学研究所,
3小时前
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