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51
的观点
适合成对样品
适当的
配对
6个月前
christoph8
•0
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110
的观点
嵌套设计矩阵在edgeR
刨边机
limma
配对
阻塞
ruvseq
8个月前
ScA
•0
•8个月前更新
戈登•史密斯
42 k
1
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1
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49
的观点
DESeq2配对检验(大多数样品)
deseq2
配对
肿瘤vs正常
10个月前
dagsbio
•0
•10个月前更新
迈克尔的爱
31 k
1
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2
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78
的观点
使用配对和嵌套数据纠正DESeq2交互设计和结果
deseq2
配对
嵌套的
12个月前
julia.chariker
•10
•12个月前更新
迈克尔的爱
31 k
0
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1
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183
的观点
DESeq2比较组织类型内的治疗,忽略其他组织类型
deseq2
比较
设计
配对
治疗
14个月前
tinglec
•0
•14个月前更新
swbarnes2
•620年
0
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3.
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140
的观点
如何在R中运行配对的RankProd分析?
RankProd
配对
RNAseq
R
15个月前
joker33
•0
•15个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
1
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2
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295
的观点
时间序列数据和两个层次(对照和处理)的成对Limma分析
limma
微阵列
时间序列
度
配对
16个月前
kawess
•0
•16个月前更新
戈登•史密斯
42 k
6
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6
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281
的观点
Limma DEG分析实验采用部分配对设计+批效应
limma
配对
批处理
16个月前
english.server
•20
•16个月前更新
戈登•史密斯
42 k
3.
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3.
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239
的观点
limma成对设计
limma
配对
23个月前
rasmus.agren
•0
•23个月前更新
亚伦Lun
♦26 k
0
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1
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202
的观点
配对样本在DESeq2
R
deseq2
配对
样品
24个月前
m.wekking
•0
•24个月前更新
迈克尔的爱
31 k
3.
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6
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490
的观点
Limma设计/对比正确吗?
limma
微阵列
设计
配对
混合模型
24个月前
rasmus.agren
•0
•24个月前更新
亚伦Lun
♦26 k
4
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9
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650
的观点
连续协变量的Limma配对设计
limma
配对
协变量
4.7年前
meeta.mistry
•20
•更新于4.7年前
史蒂夫Lianoglou
13 k
3.
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3.
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827
的观点
DESeq2分析中配对结束读的读计数
deseq
featurecounts
配对
4.8年前
tszn1984
•0
•4.8年前更新
史蒂夫Lianoglou
13 k
0
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5
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892
的观点
diffic preparePairs()不识别成对的端读操作
diffHic
preparePairs
配对
BAM
5.0年前
ilyco
•0
•更新于5.0年前
亚伦Lun
♦26 k
1
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9
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2.2 k
的观点
成对分析的LIMMA与调整的混淆连续变量
limma
基因表达
混淆
调整
配对
5.2年前
Loodramon
•0
0
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2
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747
的观点
为DEXSeq使用PE读表的合并对齐
dexseq
配对
rnaseq
samtools合并
5.4年前
arom2
•0
•5.4年前更新
亚历杭德罗雷耶斯
♦1.7 k
0
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1
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684
的观点
WGCNA包与同卵双胞胎数据
wgcna
两个分析
within-pair分析
配对
5.7年前
mahes.muniandy
•0
•5.7年前更新
彼得Langfelder
♦2.6 k
4
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7
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2.6 k
的观点
在limma软件包中正确实现DE表达的多因子配对分析
limma
微阵列
多因素设计
配对
6.0年前
svlachavas
•770年
•6.0年前更新
戈登•史密斯
42 k
2
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1
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1.0 k
的观点
EdgeR:成对分析中的批效应
配对
batcheffect
6.0年前
cinderelliedoll
•0
•6.0年前更新
戈登•史密斯
42 k
4
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14
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2.9 k
的观点
在Limma区块分析中包括技术和生物重复吗?
limma
微阵列
块
配对
线性模型
6.1年前
血管
•40
4
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14
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9.5 k
的观点
DESeq2配对多因素检验
deseq2
配对
6.3 years ago•6.2年前更新
hwillenbrock
•10
1
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6
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2.5 k
的观点
Limma:需要对不平衡干预研究中联合配对和非配对分析的最佳方法提出建议
limma
配对
未配对
duplicateCorrelation
6.3年前
圭多Hooiveld
♦2.9 k
•更新于6.2年前
bcbio_uk
•10
1
投票
5
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1.2 k
的观点
Limma配对设计矩阵3个因素
limma
配对
设计和对比矩阵
6.3年前
wim.trypsteen
•0
23个结果•页面
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最近……
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备注:从ENST到eng
通过
suxxa
•20
谢谢约翰内斯,找到染色体的方法已经过时了,对吗?
答:错误日志,当我使用biomaRt getBM
通过
迈克•史密斯
♦4.8 k
我不完全确定这个错误消息是如何与使用' getBM() '相关的,因为biomaRt不直接使用withr包。presuma…
答:独立过滤NGS数据
通过
沃尔夫冈•休伯
13 k
你面对的事实是....在处理样品的生物重复之间有很强的分散性*”,这表明D…
答:错误日志,当我使用biomaRt getBM
通过
沃尔夫冈•休伯
13 k
尝试[安装说明][1],特别是,运行if(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.pa…
注释:DiffBind安装失败:错误:包' BiocGenerics ' 0.34.0被加载,但是
通过
马丁•摩根
25 k
更新您的Bioconductor版本“BiocManager::install(version = "3.12")”。确保更新成功' BiocManager::valid() '。瞧…
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注释:ChemmineR函数propOB()和ChemmineOB prop_OB()中的错误
回答:如何更好地设计火山地块
答:从ENST到ENSG
注释:安装bsgenome . hspapiens . ucsc .hg38时出错
考虑3个因素的DESeq2设计模型
奖
•所有
受欢迎的问题
来
erwan.scaon
•10
很好的问题
来
komal.rathi
•80年
史诗的问题
来
komal.rathi
•80年
欣赏
来
马修·里奇
•960年
受欢迎的问题
来
s.munster
•40
位置
•所有
意大利,
4分钟前
海德堡EMBL / de.NBI,
14分钟前
德国,
23分钟前
爱尔兰共和国,
36分钟前
荷兰瓦赫宁根大学
49分钟前
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