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genomicranges
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44
的观点
不能再创建GRanges对象
GenomicR
GenomicRanges
8天前
zhezhen
•0
•8天前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
55 k
1
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1
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62
的观点
多个样本间的平均覆盖率
GenomicRanges
4星期前
杰克
•70年
•4周前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
1
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12
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292
的观点
如何检索entrezID及其各自的基因名称列表的基因组坐标
基因组
AnnotationHub
GenomicRanges
org.Hs.eg.db
7周前
rohitsatyam102
•10
•6周前更新
Herve页面
14 k
13
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10
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9.2 k
的观点
如何合并grange列表?
GenomicRanges
4.6年前
endrebak85
•30
•6天前更新
詹姆斯
•0
1
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1
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107
的观点
基因组范围相当于床工具集群
IRanges
GenomicRanges
8星期前
kalamari
•0
•8周前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
55 k
1
投票
3.
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94
的观点
合并相邻的基因组片段
农庄
GenomicRanges
9周前•8周前更新
rahnaman
•10
2
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2
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140
的观点
如何修改seqinfo对象中字段的单个值?
GenomicRanges
GenomeInfoDb
BSgenome
isCircular
4个月前
克里斯·塞德尔
•50
•9周前更新
Herve页面
14 k
0
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0
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31
的观点
annotatr包:GRanges对象包含边界外的范围
annotatr
GenomicRanges
11星期前
娜娜
•0
0
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0
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58
的观点
减少和聚集grange与间隙使用plyrange
GenomicRanges
plyranges
3个月前
r.a.policastro
•0
0
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1
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65
的观点
如何获得人类基因组中的重复元素基因组范围?
重复的元素
IRanges
GenomicRanges
BSgenome
4个月前
vinod.acear
•50
•4个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
55 k
3.
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7
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149
的观点
GRanges/GFeatures:在cdsByOverlaps输出中保留所有父列
农庄
GenomicRanges
GenomicFeatures
cdsByOverlaps
DiffBind
5个月前
vanbelj
•10
•5个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
55 k
0
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0
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60
的观点
用于GRangesList的启动子的预期输出
GenomicRanges
5个月前
达里奥Strbenac
♦1.5 k
0
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5
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85
的观点
GenomicRanges对象不再可见
GenomicRanges
7个月前
克里斯·塞德尔
•50
•7个月前更新
马丁•摩根
25 k
4
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2
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82
的观点
如何提取的位置,目前在一个基因组范围的对象,而不是另一个?
genomicranges
r
重叠
8个月前
令人扫兴的人
•0
•8个月前更新
凯文Blighe
2.3 k
0
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1
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56
的观点
有没有一个简单的方法来做pos(x) <- pos(x) + 1的GPos对象?
GenomicRanges
gpo
8个月前
查尔斯·普莱西
•130年
0
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0
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62
的观点
警告:使用makeTxDbFromGFF停止不能映射到外显子的密码子
genomicranges
genomicfeatures
8个月前
shangguandong1996
•20
2
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2
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91
的观点
基因组范围:从0碱基转换为1碱基
GenomicRanges
8个月前
扎克罗伊
•10
•8个月前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
1
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1
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102
的观点
Rtracklayer导出Granges对象为bigwig错误:特征不能重叠
rtracklayer
genomicranges
农庄
9个月前
ssabri
•20
•9个月前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
3.
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4
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104
的观点
如何关闭“makeTxDbFromGFF”中miRNA类型的识别特征
GenomicFeatures
genomicranges
10个月前
shangguandong1996
•20
•9个月前更新
Herve页面
14 k
0
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4
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76
的观点
试图从BiocManager安装GenomicRanges时编译错误。
软件错误
GenomicRanges
10个月前
atheeth14
•0
1
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1
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59
的观点
MEDIPS。CpGenrich现在RangedData已弃用
MEDIPS
RangedData
GenomicRanges
10个月前
emham
•0
•10个月前更新
卢卡斯查韦斯
•550年
0
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6
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110
的观点
基因组范围:找到第一,第二和第三个最近的基因
R
GenomicRanges
农庄
10个月前
ssabri
•20
•10个月前更新
戈登•史密斯
41 k
0
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0
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74
的观点
试图转换gff文件-> txdb对象使用GenomicFeatures::makeTxDbFromGFF()错误
GenomicFeatures
注释
人造石铺地面
GenomicRanges
11个月前
domenick.braccia
•0
•11个月前更新
shepherl
2.5 k
3.
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2
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116
的观点
基因组范围:找到N个最近的/前面的/后面的范围
genomicranges
11个月前
maltethodberg
•140年
•11个月前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
6
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11
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2.7 k
的观点
基因间坐标与基因组特征
genomicranges
genomicfeatures
iranges
5.8年前
饼干
•20
•11个月前更新
mohancm89
•0
2
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3.
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77
的观点
基因组特征启动子重叠:通过重叠识别启动子?
GenomicFeatures
GenomicRanges
12个月前
vanbelj
•10
•12个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
55 k
0
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3.
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142
的观点
将转录本中的外显子大小调整为总宽度
genomicranges
genomicfeatures
13个月前
杰克
•70年
•13个月前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
0
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1
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146
的观点
查找pintersect()时出错
GenomicRanges
14个月前
Prashantha Hebbar
•260年
0
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0
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103
的观点
解决了。在GenomicRanges的列表中查找到最近邻居(非自己)的距离
GenomicRanges
GenomicFeatures
画眉山庄
distanceToNearest
R
14个月前
rmash
•0
0
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1
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449
的观点
在range 1中,'end'必须是>= 'start' - 1。: .Call2(\"solve_user_SEW0\", start, end, width, PACKAGE = \"IRanges\")"
Genomicranges
IRanges
15个月前
bioinagesh
•0
•15个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
55 k
2
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3.
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195
的观点
GenomicRanges发现的重叠可以忽略序列名吗?
GenomicRanges
findOverlaps
15个月前
威廉·麦克朗
•0
0
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7
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818
的观点
当从BiocManager安装0.22.1时,GenomicRanges需要S4Vectors 0.23.19
S4Vectors
GenomicRanges
BiocManager
15个月前
james.dalgleish
•30
4
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9
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223
的观点
使用基因组范围获得非重叠(非冗余)区域的计数
genomicranges
农庄
grangeslist
R
16个月前
new_user6
•0
•16个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
55 k
0
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5
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175
的观点
关于seqnames()在GenomicRanges中的一个问题
GenomicRanges
16个月前
shangguandong1996
•20
0
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3.
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253
的观点
定义BSgenome -> GRanges S4钳子没有包附加
BSgenome
方法
GenomicRanges
16个月前
Aditya
•120年
1
投票
2
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184
的观点
定义和导出seta ('BSgenome', 'GRanges')有用吗?
BSgenome
GenomicRanges
16个月前
Aditya
•120年
•16个月前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
4
票
14
回复
349
的观点
将GenomicRanges::GRanges设置为“%in%”失败
genomicranges
16个月前
Aditya
•120年
3.
票
3.
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237
的观点
grange操作后是否检查范围有效性?
GenomicRanges
16个月前
Aditya
•120年
7
票
4
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130
的观点
seqlength不是从名称空间GenomicRanges导出的对象
GenomicRanges
17个月前
Aditya
•120年
•17个月前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
2
票
1
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199
的观点
如何使一个GPos子类接受UnstitchedGPos和StitchedGPos输入?
GenomicRanges
18个月前
查尔斯·普莱西
•130年
•17个月前更新
Herve页面
14 k
3.
票
10
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1.2 k
的观点
从GRanges对象中提取每个基因组坐标的元数据
GenomicRanges
农庄
18个月前
罗伯特。
•10
2
票
3.
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267
的观点
OSX中的rtracklayer对CRAN不可用,导致下游依赖项出现错误。
GenomicRanges
rtracklayer
VariantAnnotation
S4Vectors
SummarizedExperiment
18个月前
james.dalgleish
•30
•18个月前更新
史蒂夫Lianoglou
13 k
4
票
2
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354
的观点
从ipo中构建gpo
genomicranges
农庄
gpo
2.3年前
maltethodberg
•140年
•19个月前更新
Herve页面
14 k
0
票
1
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158
的观点
利用GenomicRanges (R-package)评估基因组片段富集
GenomicRanges
R
基因组富集
19个月前
geretshabile
•0
•19个月前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
0
票
1
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142
的观点
如何删除在组之前发现的值行
GenomicRanges
r
20个月前
naktang1
•0
0
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0
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192
的观点
无法在ChIPQC中使用酵母基因组进行注释
ChIPQC
GenomicRanges
ChIPpeakAnno
20个月前
bertb
•0
0
票
2
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224
的观点
根据ATACseq数据计算TSS富集
GenomicRanges
的观点
ATACseq
TSS
20个月前
tangming2005
•160年
3.
票
2
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938
的观点
无效类GRanges对象:1:'x@seqnames'不平行于'x
genomicranges
22个月前
rqmm9rrsd690
•10
•21个月前更新
hauken_heyken
•70年
1
投票
8
回复
287
的观点
在另一个GRanges对象上聚合多个元数据列的分数
GenomicRanges
22个月前
gueux
•0
•21个月前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
1
投票
1
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259
的观点
如何对5' utr和CDS进行联合标注?
注释
连接
GRangesList
GenomicRanges
22个月前
anmej
•0
352个结果•页面
1 / 8
最近……
回复
注释:ChIP seeker注释错误
通过
茉莉花
•0
你找到解决办法了吗?我也有这个问题。你用的是hg38参考吗?
回答:将LowRankMatrix强制为dgCMatrix错误
通过
亚伦Lun
♦26 k
我有一个更长的答案,但我不小心按了ESC并删除了它。我只提到**tl, dr**。立即修复:只需擦拭…
评论:txImport:样本数据中似乎缺少一个基因
通过
詹姆斯·w·麦克唐纳
55 k
请不要在多年前的帖子上添加评论。相反,问一个新问题。
评论:txImport:样本数据中似乎缺少一个基因
通过
马丁
•0
你好,我也是新来的,我也在学习。如果我创建自己的表tx2gene。tx2基因中这些缺失的转录本会引起问题吗?
注释:avereps函数由limma包
通过
莉莉
•10
谢谢你的回复
票
差异表达分析:排列试验
注释:avereps函数由limma包
注释:avereps函数由limma包
答:DESeq2中的log2 Fold Change与由归一化cou计算的FC不相同
注释:vsn2的一层
奖
•所有
受欢迎的问题
来
efratsh
•0
先知
来
ilysR
•0
受欢迎的问题
来
苏菲·玛丽恩·德·普罗斯
•0
先知
来
jol.espinoz
•30
史诗的问题
来
jol.espinoz
•30
位置
•所有
德国,
15分钟前
爱尔兰共和国,
20分钟前
美国,
1小时前
海德堡EMBL / de.NBI,
1小时前
海边的城市,
1小时前
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