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findoverlaps
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197
的观点
GenomicRanges发现的重叠可以忽略序列名吗?
GenomicRanges
findOverlaps
•15个月前更新
威廉·麦克朗
•0
4
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5
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1.7 k
的观点
把grange的分数汇总到箱子里
genomicranges
grangeslist
箱子
findoverlaps
3.4年前
亚萨合Yeroslaviz
♦1.5 k
•2.3年前更新
李慧珍
•0
0
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3.
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306
的观点
基于索引或更多条件的基因组范围,并从匹配中添加列
genomicranges
iranges
findoverlaps
2.3年前
弗朗西斯卡casalino
•50
0
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1
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344
的观点
r_granges_add合并的元数据列
农庄
findoverlaps
2.9年前
me.saichi
•0
2
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8
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2.3 k
的观点
基因组范围:识别重叠区域,得到每个重叠对之间的交集,并添加基因坐标(开始,结束,链和id)
genomicranges
重叠
相交
findoverlaps
3.0年前
卡罗琳·格里斯巴赫·迈斯纳
•10
2
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3.
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789
的观点
subsetByOverlaps with Multimapping
genomicranges
subsetbyoverlaps
农庄
findoverlaps
3.4年前
亚萨合Yeroslaviz
♦1.5 k
0
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10
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922
的观点
在GRangesList对象上查找重叠的行为
findOverlaps
grangeslist
GenomicRanges
3.6年前
lovro0
•10
1
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1
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470
的观点
得到正好重叠的区间
findoverlaps
农庄
3.7年前
julrodr80
•30
•3.7年前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
2
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2
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571
的观点
在同一样本中发现重叠
genomicranges
农庄
findoverlaps
3.7年前
julrodr80
•30
0
票
1
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634
的观点
如何获得相邻的范围?
findOverlaps
IRanges
3.8年前
tobias.kockmann
•20
•3.8年前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
0
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3.
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808
的观点
更新包后finoverllaps()错误
GenomicRanges
findOverlaps
4.0年前
sellis18
•20
•4.0年前更新
马丁•摩根
25 k
1
投票
4
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589
的观点
查找重叠的问题
农庄
iranges
findoverlaps
4.0年前
julrodr80
•30
•4.0年前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
2
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7
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969
的观点
如何从genomicAlignments包中查找重叠,以考虑重叠计算中BWA配对读的软剪切部分?
genomicalignments
findoverlaps
剪读
4.2年前
lovro0
•10
1
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12
回复
1.2 k
的观点
我如何能集成的compressedList在多个列表成一个没有复制集?
r
iranges
findoverlaps
IntegerList
列表
4.5年前•4.2年前更新
jian_liangli
•0
5
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2
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709
的观点
为多个grange重叠寻找合适的输出表示方法
r
grangeslist
biocparallel
findoverlaps
4.5年前•4.2年前更新
地方法官Shahidin
•70年
3.
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3.
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577
的观点
通过使用GRanges / IRanges和finoverlap()找到在查询中某处开始的主题的命中值
IRanges
农庄
findoverlaps
R
4.5年前
svenbioinf
•0
•4.5年前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
3.
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5
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767
的观点
提取重叠基因组间隔的坐标
genomicranges
findoverlaps
相交
4.5年前
rubi
•90年
•4.5年前更新
史蒂夫Lianoglou
13 k
2
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2
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574
的观点
GRanges使用findOverlaps()从(仅)反义链获得命中。
农庄
findoverlaps
反义
4.5年前
svenbioinf
•0
•4.5年前更新
李lilingdu
•450年
3.
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9
回复
756
的观点
找出给定区域下一个不重叠的第n个元素
biomart
农庄
findoverlaps
4.6年前
alessandro.pastore
•20
•4.6年前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
28
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43
回复
4.4 k
的观点
同时发现超过2个GRanges对象的重叠(可重复的例子被更新)?
findoverlaps
农庄
4.9年前
地方法官Shahidin
•70年
•4.8年前更新
马丁•摩根
25 k
0
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6
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817
的观点
这是找到重叠的上游和下游基因的有效方法吗
genomicranges
geneoverlap
findoverlaps
4.8年前
yao.h.1988
•0
•4.8年前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
6
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7
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908
的观点
如何在R中实现两个不同床文件的迭代元素重叠?
r
findoverlaps
迭代器
5.1年前
地方法官Shahidin
•70年
•5.1年前更新
Herve页面
14 k
0
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9
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1.7 k
的观点
IRanges:按分组reduce()、finoverlap()、intersect()
iranges
findoverlaps
相交
集团
5.1年前
pesquivel
•0
0
票
3.
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989
的观点
我想要得到一个与其他grange重叠的grange长度的分数向量。
农庄
findoverlaps
subsetbyoverlaps
5.2年前
vinod.acear
•50
•5.2年前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
0
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0
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610
的观点
chippeakano - package中不同数量的重叠峰
chippeakanno
findoverlaps
维恩图解
5.2年前
n . F。
•0
8
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3.
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1.9 k
的观点
如何提取不与其他恒河重叠的Granges ?
农庄
findoverlaps
5.3年前
vinod.acear
•50
•5.3年前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
3.
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2
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769
的观点
通过查找重叠法得到的对中的每对有多少重叠的位置。
农庄
genomicranges
findoverlaps
subsetbyoverlaps
5.3年前
vinod.acear
•50
•5.3年前更新
Herve页面
14 k
2
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5
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1.0 k
的观点
在内部使用Granges和GRangesList交叉
农庄
grangeslist
findoverlaps
5.4年前
d r
•150年
•5.4年前更新
Herve页面
14 k
3.
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7
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1.0 k
的观点
交叉Granges和GRangesList元素
findoverlaps
genomicranges
5.4年前
d r
•150年
•5.4年前更新
Herve页面
14 k
1
投票
1
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667
的观点
使用findOverlaps仅查找部分重叠
findoverlaps
genomicranges
5.4年前
d r
•150年
•5.4年前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
1
投票
1
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720
的观点
当主题和查询都在一百万量级时执行finoverlap
findoverlaps
5.9年前
mrk.carty
•30
•5.9年前更新
Herve页面
14 k
3.
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5
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1.9 k
的观点
使用VariantAnnotation()包添加自定义注释到Multi-Sample VCF
variantannotation
农庄
DNAStringSetList
findoverlaps
Vranges
6.0年前
summerela
•0
10
票
8
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1.6 k
的观点
GRanges对象的传递重叠
农庄
findOverlaps
6.0年前
斯蒂芬妮陶贝尔
•40
•6.0年前更新
Herve页面
14 k
33个结果•页面
1 / 1
最近……
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备注:在DiffBind中,比较结果score和Conc不同
通过
shangguandong1996
•20
谢谢Stark博士,我会尽力的:)
答案:为什么我的p值缩水(GWAS)?
通过
安娜
•0
同样值得注意的是,你的样本量非常小,这并不一定会导致这个qq图,但这是一个更普遍的问题……
评论:DESeq2对Log2FoldChange的异常高估计
通过
迈克尔的爱
31 k
由' plotCounts '返回的值有一个伪计数添加,而GLM不使用伪计数再次,这里没有一个错误。如果你……
评论:DESeq2对Log2FoldChange的异常高估计
通过
swbarnes2
•620年
你怎么能算一半呢?0比任何数都很大。至于排除他们……在……方面有区别。
答案:DESeq2异常高估计Log2FoldChange
通过
hugo.denis
•0
您好,非常感谢您的回答。根据设计,我对log2FoldChange计算的假设是m…
票
答案:DESeq2异常高估计Log2FoldChange
评论:为什么在AnnotationHub中没有一些其他生物的Uniprot信息?
注释:DiffBind安装失败:错误:包' BiocGenerics ' 0.34.0被加载,但是
注释:DiffBind安装失败:错误:包' BiocGenerics ' 0.34.0被加载,但是
答:一组与另外两组比较,采用LRT检验(伪体法)
奖
•所有
先知
来
amel.zulji
•0
受欢迎的问题
来
erwan.scaon
•10
很好的问题
来
komal.rathi
•80年
史诗的问题
来
komal.rathi
•80年
欣赏
来
马修·里奇
•960年
位置
•所有
美国,
1小时前
澳大利亚,
1小时前
WEHI,澳大利亚墨尔本,
2小时前
海德堡EMBL / de.NBI,
3小时前
爱尔兰共和国,
3小时前
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