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124
的观点
DESeq2:不同条件和重复的多次比较
的相互作用
DESeq2
设计
4星期前
vanbelj
•10
•26天前更新
凯文Blighe
2.4 k
0
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1
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59
的观点
DeSeq2 4个不同的公式,但4次相同的热图…
deseq2
设计
公式
3个月前
蔓
•0
•3个月前更新
迈克尔的爱
31 k
2
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3.
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97
的观点
多因子RNA序列的EdgeR设计矩阵
刨边机
设计
多因素
3个月前
jackiesalzbank
•0
•3个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
0
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5
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145
的观点
层次聚类的DESeq2问题
deseq2
设计
4个月前
mhnidhi2-c
•0
•4个月前更新
凯文Blighe
2.4 k
2
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5
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164
的观点
选择正确的设计公式
deseq2
设计
实验
4个月前
donnenfieldjonah
•0
2
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5
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216
的观点
如何将只存在于一个关卡中的批处理效果整合到设计中?
线性模型
批处理效果
DESeq2
设计
5个月前
tim.meese
•0
•5个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
2
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8
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310
的观点
去除批效应极限值、“系数不可估计”警告并设计矩阵
limma
deseq2
批处理
设计
批处理效果
5个月前
彼得罗
•30
4
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7
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117
的观点
在一种条件下基因上调,而在其他条件下基因上调
刨边机
设计
6个月前
dario.beraldi
•0
•6个月前更新
戈登•史密斯
42 k
0
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1
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88
的观点
具有多个数字协变量的系数不可估计
r
limma
设计
rnaseq
轰
7个月前
将
•0
•7个月前更新
戈登•史密斯
42 k
2
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7
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149
的观点
多变量Limma分析
limma
model.matrix
德
设计
rnaseq
7个月前
将
•0
•7个月前更新
戈登•史密斯
42 k
6
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6
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139
的观点
设计用于分析来自同一生物实体的多个样本的实验
rna-seq
设计
线性模型
全球语言监测机构
11个月前
预防维修
•0
•11个月前更新
史蒂夫Lianoglou
13 k
0
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10
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161
的观点
DEseq2设计公式批量校正
deseq2
设计
公式
批处理效果
12个月前
l.rijnberk
•0
•12个月前更新
swbarnes2
•620年
1
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4
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109
的观点
帮助Deseq2设计
deseq2
设计
多因素
12个月前
sxp585
•0
•12个月前更新
迈克尔的爱
31 k
1
投票
1
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322
的观点
lfcShrink不能使用对比
lfcShrink
对比
设计
deseq2
12个月前
亚萨合Yeroslaviz
♦1.5 k
•12个月前更新
迈克尔的爱
31 k
0
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2
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88
的观点
DESeq2时间过程实验设计
deseq2
设计
设计公式
时间进程
轻轨车
12个月前
ac_bioinformatics
•0
•12个月前更新
迈克尔的爱
31 k
2
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1
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78
的观点
在DESeq2中结合柱进行实验设计
deseq2
设计
元数据
13个月前
亚萨合Yeroslaviz
♦1.5 k
•12个月前更新
sebastian.lobentanzer
•50
1
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8
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829
的观点
DESeq2:设计中的连续变量和离散变量
deseq2
R
rna-seq
设计
14个月前
raquelgarza95
•0
•4周前更新
迈克尔的爱
31 k
1
投票
6
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134
的观点
平均表达式与折叠变化的关系
设计
AveExpr
比较
14个月前
Lluís雷维拉·桑丘
•610年
•14个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
0
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1
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183
的观点
DESeq2比较组织类型内的治疗,忽略其他组织类型
deseq2
比较
设计
配对
治疗
14个月前
tinglec
•0
•14个月前更新
swbarnes2
•620年
0
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4
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373
的观点
DESeq2:将所有tpts与基线进行比较,并相应地拉出结果表
deseq2
对比
设计
16个月前
luciest.rodriguez
•0
0
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2
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168
的观点
通过limma寻找DEG的不同设计
limma
度
设计
17个月前
amin.ghareyazi
•0
0
票
8
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307
的观点
RNAseq公式中的两个控件为DESeq2
deseq2
公式
控制
设计
17个月前
taveluz
•0
•17个月前更新
迈克尔的爱
31 k
0
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3.
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137
的观点
分析策略-两个治疗组的t=0时,是否可以使用朴素对照组?
Deseq2
设计
时间进程
基集团
19个月前
Rob Buurstede
•0
•19个月前更新
迈克尔的爱
31 k
2
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18
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15 k
的观点
DEseq2时间序列设计。
deseq2
timecourse
设计
6.2年前
邵
•90年
•19个月前更新
西蒙·鲍德温
•0
0
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1
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168
的观点
多因素RNAseq实验的DESeq2分析
deseq2
设计
时间进程
19个月前
维克多Chano
•0
•19个月前更新
迈克尔的爱
31 k
1
投票
1
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202
的观点
控制批量效应时与DESeq2的所有成对比较:参考水平重要吗?
deseq2
微分表达式
批校正
设计
19个月前
wunderl
•20
•19个月前更新
迈克尔的爱
31 k
0
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1
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162
的观点
对每个时间点进行单次设计或单独的微分分析,同时进行时间过程rna序列分析
deseq2
设计
19个月前
adhikb
•0
•19个月前更新
迈克尔的爱
31 k
3.
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3.
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229
的观点
利用DESeq2提取主体间和主体内模型中的主体内效应
deseq2
设计
22个月前
i.sudbery
•10
•22个月前更新
迈克尔的爱
31 k
3.
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368
的观点
实验设计RNAseq微分表达式
刨边机
limma
设计
对比
批处理
22个月前
彼得罗
•30
•22个月前更新
亚伦Lun
♦26 k
3.
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4
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292
的观点
用EdgeR在三种不同条件下进行配对分析(肿瘤vs正常)
刨边机
设计
矩阵
德
23个月前
takumima
•10
•23个月前更新
亚伦Lun
♦26 k
0
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7
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458
的观点
DESeq2“设计”参数使用Shiny/rhandsontable的问题
deseq2
闪亮的
设计
rhandsontable
hot_to_r ()
23个月前
hinkel2
•0
•23个月前更新
迈克尔的爱
31 k
0
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1
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185
的观点
DESeq2 3因素设计-是否拆分数据或添加交互项
deseq2
设计
24个月前
atongz652
•0
•24个月前更新
迈克尔的爱
31 k
0
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2
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221
的观点
DESeq2-多因素设计- 3个条件和3个时间点
deseq2
设计
24个月前
bioinfo
•0
•24个月前更新
迈克尔的爱
31 k
3.
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6
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490
的观点
Limma设计/对比正确吗?
limma
微阵列
设计
配对
混合模型
24个月前
rasmus.agren
•0
•24个月前更新
亚伦Lun
♦26 k
4
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7
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789
的观点
LIMMA时间序列样条模型。矩阵设计设置
limma
设计
model.matrix
时间序列
样条函数
2.0年前
tleona3
•0
2.0年前更新
亚伦Lun
♦26 k
1
投票
2
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264
的观点
不同细胞系和疾病状态的DESeq2设计
deseq2
设计
2.0年前
lu.ne
•0
2.0年前更新
迈克尔的爱
31 k
0
票
7
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519
的观点
DeSeq2核糖体分析:多因素设计
deseq2
设计
timeseries
2.0年前
indrik.wijaya
•20
2.0年前更新
迈克尔的爱
31 k
7
票
7
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5.4 k
的观点
DESeq2似然比检验(LRT)设计- 2个基因型,4个时间点
deseq2
轻轨车
rnaseq
设计
减少模型
3.8年前
I.Castanho
•50
•2.2年前更新
evocanres
•0
5
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6
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536
的观点
如何利用样品类型和条件对DESeq2进行合适的分析
deseq2
差异基因表达
设计
2.3年前
newbio17
•0
•2.3年前更新
迈克尔的爱
31 k
0
票
5
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428
的观点
DESeq2设计公式-与有序变量相关
DESeq2
设计
公式
矩阵
2.7年前
t.kuilman
170
•2.7年前更新
迈克尔的爱
31 k
2
票
4
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332
的观点
Limma模型用于配对和池在一起
limma
设计
rnaseq
2.8年前
b.nota
•340年
•更新于2.8年前
莱恩·c·汤普森
7.6 k
0
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5
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452
的观点
对患者变异性使用相互作用术语是正确的吗?
deseq2
设计
相互作用项
R
2.9年前
briverog
•0
1
投票
8
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522
的观点
设计与交互术语的相似或不同之处?
deseq2
方差分析
设计
相互作用项
3.0年前
tarun2
•0
•3.0年前更新
迈克尔的爱
31 k
1
投票
2
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658
的观点
DESeq2 -设计TCGA未配对RNAseq数据
DESeq2
设计
, TCGA
未配对
RNAseq
3.0年前
Talip Zengin
•10
•3.0年前更新
迈克尔的爱
31 k
0
票
5
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568
的观点
Limma:如何解释双胞胎数据(包括MZ和DZ双胞胎)?
limma
设计
RNA-seq
公式
双胞胎
3.3年前
西蒙
•0
•3.3年前更新
亚伦Lun
♦26 k
3.
票
7
回复
772
的观点
DESeq2设计公式:孪生数据(MZ和DZ)如何核算?
DESeq2
双胞胎
设计
公式
RNA-seq
3.3年前
西蒙
•0
2
票
4
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482
的观点
设计微阵列limma
limma
统计能力
设计
可变性
微阵列
3.3年前
roser.navarro
•0
•3.3年前更新
亚伦Lun
♦26 k
0
票
1
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954
的观点
使用DESeq2进行样本内时间序列比较
deseq2
时间进程
rnaseq
设计
对比
3.9年前
prppmet
•0
•更新于3.9年前
迈克尔的爱
31 k
2
票
13
回复
646
的观点
我应该使用哪个公式来设置我的分析的最佳模型矩阵?
DESEQ2
刨边机
设计
4.3年前
ZheFrench
•10
3.
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4
回复
800
的观点
相对于对照,将WT和突变体之间的DE归一化
deseq2
多因素设计
设计和对比矩阵
设计
多因子的设计
4.4年前
shimbalama
•0
61个结果•页面
二选一
最近……
回复
备注:从ENST到eng
通过
suxxa
•20
谢谢约翰内斯,找到染色体的方法已经过时了,对吗?
答:错误日志,当我使用biomaRt getBM
通过
迈克•史密斯
♦4.8 k
我不完全确定这个错误消息是如何与使用' getBM() '相关的,因为biomaRt不直接使用withr包。presuma…
答:独立过滤NGS数据
通过
沃尔夫冈•休伯
13 k
你面对的事实是....在处理样品的生物重复之间有很强的分散性*”,这表明D…
答:错误日志,当我使用biomaRt getBM
通过
沃尔夫冈•休伯
13 k
尝试[安装说明][1],特别是,运行if(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.pa…
注释:DiffBind安装失败:错误:包' BiocGenerics ' 0.34.0被加载,但是
通过
马丁•摩根
25 k
更新您的Bioconductor版本“BiocManager::install(version = "3.12")”。确保更新成功' BiocManager::valid() '。瞧…
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注释:ChemmineR函数propOB()和ChemmineOB prop_OB()中的错误
回答:如何更好地设计火山地块
答:从ENST到ENSG
注释:安装bsgenome . hspapiens . ucsc .hg38时出错
考虑3个因素的DESeq2设计模型
奖
•所有
受欢迎的问题
来
erwan.scaon
•10
很好的问题
来
komal.rathi
•80年
史诗的问题
来
komal.rathi
•80年
欣赏
来
马修·里奇
•960年
受欢迎的问题
来
s.munster
•40
位置
•所有
意大利,
4分钟前
海德堡EMBL / de.NBI,
18分钟前
荷兰瓦赫宁根大学
30分钟前
爱尔兰共和国,
30分钟前
德国,
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