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deseq
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1.9 k
的观点
Deseq2:在治疗后测试组间差异时,如何调整基线读数计数
deseq2
deseq
5.7年前
尼克
•0
•3个月前更新
迈克尔的爱
31 k
1
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109
的观点
DESeq错误(nbinomTest ())
Deseq
nbinomTest
8个月前
坎菲尔德
•10
0
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110
的观点
DESeq错误:validityMethod(object)中的错误:nrow(design) == ncol(object)不是TRUE
deseq2
DESeq
nrow == ncol不是TRUE
8个月前
maniermk
•0
•8个月前更新
凯文Blighe
2.4 k
2
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3.
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85
的观点
安装DESeq时RCurl包错误配置失败
错误:RCurl包配置失败
DESeq
9个月前
krunal.24.6
•10
•9个月前更新
迈克尔的爱
31 k
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68
的观点
模拟数据以理解DESeq2中的交互
deseq2
deseq
10个月前
blawney
•0
•10个月前更新
西蒙•安德斯
♦3.6 k
3.
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117
的观点
如何基于deseq R包对GEO预处理的RNA-Seq数据进行过滤和DE分析
deseq
rna-seq
过滤
德
deseq2
10个月前
svlachavas
•770年
•10个月前更新
迈克尔的爱
31 k
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134
的观点
对于一些测试用例,DESeq与DESeq2的结果是错误的?
deseq2
DESeq
10个月前
megapode32559
•0
•10个月前更新
西蒙•安德斯
♦3.6 k
0
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7
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124
的观点
如何根据miRNA基因原始读取计数分析和发现差异表达基因?
deseq2
deseq
12个月前
husainmanagori1998
•0
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150
的观点
DESeq2计数函数不工作
deseq2
Deseq
RNAseq
14个月前
mrfossl97
•0
•14个月前更新
迈克尔的爱
31 k
2
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3.
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188
的观点
DESeq2 2x2析因设计:找到因子A特有的基因?
deseq2
deseq
微分表达式
对比
14个月前
基斯Hughitt
•130年
•14个月前更新
迈克尔的爱
31 k
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4
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608
的观点
TMM归一化:DESeqDataSet:化验中的一些值为阴性
deseq2
deseq
归一化
18个月前
neekonsu
•0
•18个月前更新
wunderl
•20
1
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2
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202
的观点
过滤无关样本会影响DESeq结果。这是怎么回事?
deseq
deseq2
18个月前
sxv
•0
•18个月前更新
迈克尔的爱
31 k
0
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187
的观点
在SeqGSEA中包含具有批处理效应的数据的sva结果
limma
deseq2
seqgsea
股东价值分析
deseq
19个月前
kentfung
•0
0
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9
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393
的观点
NOOB问题:如何在DESeq2中使用对比进行亚组分析?
deseq
deseq2
对比
子群
23个月前
爱丽儿
•0
3.
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12
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326
的观点
为什么我在连续变量的DESeq中得到NA p值?
deseq2
假定值
连续
deseq
23个月前
爱丽儿
•0
2
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3.
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572
的观点
DESeq2计数库克阈值的异常值替换
deseq2
deseq
rnaseq
离群值
统计离群值
2.2年前
lefeverde
•10
•2.2年前更新
迈克尔的爱
31 k
0
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263
的观点
关于多因素Deseq分析的问题
DESeq
deseq2
微生物组
肠道微生物组
2.2年前
FaisalH
•0
•2.2年前更新
迈克尔的爱
31 k
0
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3.
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365
的观点
运行DESeq2工作流时奇怪的lfcShrink plot
DESeq2
rnaseq
rna-seq
deseq2
deseq
2.3年前
本
•10
0
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7
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1.6 k
的观点
DESeq2安装问题
deseq
2.3年前
bikashten
•0
•2.3年前更新
迈克尔的爱
31 k
4
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7
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1.0 k
的观点
Deseq2设计为一个条件超过8个不同的时间点
deseq2
rna-seq
设计矩阵
deseq
2.3年前
thindmarsmission
•0
•2.3年前更新
迈克尔的爱
31 k
0
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3.
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358
的观点
DESeq2组比较
deseq2
deseq
微分结合分析
2.4年前
rbronste
•60
•2.4年前更新
迈克尔的爱
31 k
3.
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5
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397
的观点
协助进行多因素Deseq分析
deseq2
rnaseq
deseq
2.4年前
MAPK
•0
•2.4年前更新
迈克尔的爱
31 k
0
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7
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399
的观点
Deseq 2多重比较(3组,24个样本)
deseq
2.4年前
Matthew.baldwin
•0
•2.4年前更新
迈克尔的爱
31 k
3.
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1
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11 k
的观点
R的最新版本是3.5.1,它与许多Bioconductor软件包不兼容。
R
deseq
tcgabiolinks
2.4年前
ansari.sarabio
•0
1
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5
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342
的观点
组特定条件查询
deseq2
deseq
batcheffect
2.5年前
bdy8
•0
•2.5年前更新
迈克尔的爱
31 k
3.
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7
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391
的观点
提取拟合值的均值与基于LFC的计算均值和SE之间的差异。
deseq2
deseq
2.5年前
blastzone.heimerdinger
•0
0
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8
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564
的观点
多因素、多时间点对比设计公式
rna-seq
deseq2
deseq
R
2.5年前
arun.thirumaran
•0
•2.5年前更新
迈克尔的爱
31 k
0
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1
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280
的观点
如何开始正常化
deseq
2.5年前
raghavaraghava049
•0
0
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1
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290
的观点
在deseq2结果中,基准值总是0.5的倍数
deseq
结果
baseMean
2.6年前
batmaiden
•0
•2.6年前更新
迈克尔的爱
31 k
0
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3.
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323
的观点
在DEseq - time(3个时间点)和两个处理中进行3x2比较
deseq2
deseq
rna-seq
多重比较
2.6年前
rbronste
•60
•2.6年前更新
迈克尔的爱
31 k
2
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3.
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607
的观点
ASE使用DESeq2
deseq2
deseq
归一化
等位基因特异性表达
rnaseq
2.7年前
c.martinezruiz
•0
•2.7年前更新
西蒙•安德斯
♦3.6 k
0
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5
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457
的观点
如何使用DESeq模拟时间过程RNA序列数据?
deseq2
R
makeexampledeseqdataset
deseq
2.7年前
kjkjindal
•0
•2.7年前更新
迈克尔的爱
31 k
3.
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7
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781
的观点
新手:使用RNA-Seq数据构建基因共表达网络
rna-seq
WGCNA
deseq
方法
coexpression
2.8年前
7 kemzmani
•10
•更新于2.8年前
彼得Langfelder
♦2.6 k
1
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2
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474
的观点
用重复的均值和方差信息Deseq2
deseq2
deseq
差分析
蛋白质组学
2.8年前
blehtine
•0
1
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8
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1.1 k
的观点
DESeq2:一种治疗的群体特异性效应,同时控制个体效应
deseq2
DESeq
设计和对比矩阵
deseq
2.9年前
SPbeginner
•0
1
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3.
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469
的观点
DEseq2样品不平衡
deseq
2.9年前
aishu.jp
•20
0
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4
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12 k
的观点
DEseq归一化
遗传学
归一化
DESeq
遗传学
归一化
DESeq
10.3年前
瑞罗
•20
•2.9年前更新
diannedai
•0
0
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8
回复
1.1 k
的观点
比较两种差异表达分析——两种不同的褶皱变化
Deseq
deseq2
差异基因表达
rnaseq
统计检验
3.0年前
玛丽娜
•0
0
票
4
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482
的观点
当肿瘤样本有正常的组织污染时,正常计数。
deseq2
deseq
刨边机
rnaseq
htseqcounts
3.0年前
迪帕莉。
•0
0
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2
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1.6 k
的观点
加载或运行DESeq2时出现问题
deseq
无法找到函数
3.0年前
brynnhvoy
•0
•3.0年前更新
迈克尔的爱
31 k
5
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3.
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1.9 k
的观点
使用SVA进行交互的DESeq2
deseq2
股东价值分析
相互作用项
分组变量
deseq
3.0年前
kevin.kingsland
•40
4
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6
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552
的观点
DESeq2设计和统计问题
deseq2
微分结合分析
deseq
atac-seq
3.0年前
rbronste
•60
•3.0年前更新
迈克尔的爱
31 k
2
票
10
回复
782
的观点
DESeq2结果导出padj排序
deseq2
deseq
微分结合分析
3.0年前
rbronste
•60
•3.0年前更新
迈克尔的爱
31 k
2
票
4
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608
的观点
矩阵未满秩- DESeq2
deseq2
模型矩阵不是满秩的
model.matrix
deseq
微分结合分析
3.0年前
rbronste
•60
•3.0年前更新
西蒙•安德斯
♦3.6 k
2
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5
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517
的观点
将DESeq2输出映射回染色体位置
deseq2
deseq
diffbind
微分结合分析
3.1年前
rbronste
•60
•3.1年前更新
迈克尔的爱
31 k
40
票
44
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5.3 k
的观点
发表的RNA序列数据分析在计算p值和FDR时经常出错吗?
罗斯福
假定值
DESeq
RNA-Seq
3.7年前
yjiangnan
•10
•3.1年前更新
韦德戴维斯
•60
1
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2
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367
的观点
DESeq可能时,只有rlog表可用?(DESeq2包)
deseq2
rlog
deseq
3.1年前
sreibe
•0
9
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17
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561
的观点
DESeq2设计子类别
deseq2
deseq
微分结合分析
3.1年前
rbronste
•60
•3.1年前更新
迈克尔的爱
31 k
2
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6
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891
的观点
DESeq:关于对比和分组细分的问题。
deseq2
deseq
3.2 years ago•3.1年前更新
hrishi27n
•20
0
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1
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523
的观点
RNAseq生成tx2gene表,使用kallisto输出运行DEseq
deseq
注释
3.1年前
nupur.dasgupta
•0
•3.1年前更新
迈克尔的爱
31 k
482个结果•页面
1 / 10
最近……
回复
备注:数值变量缩放+居中后,DESeq2结果变化很大
通过
凯文Blighe
2.4 k
你不需要为了调整质量而包含' percent_mapped '。通过包括它,即使是按比例,你也可能会引入偏见……
答案:将UniProt条目名称转换为基因符号
通过
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
理想的UniProt。ws '会在本地这样做,因为'常规'查询ID是ACC+ID,其中ACC是你在那里显示的键,ID是ENT…
备注:数值变量缩放+居中后,DESeq2结果变化很大
通过
马提亚Munz
•0
我写了数据质量。缩放和居中对我来说并不新鲜。
评论:如何在linux ubuntu 18中使用bioconductor和Deseq2
通过
凯文Blighe
2.4 k
你的默认R是什么?-应该是4.0.x。在错误消息之前的行中还应该有更多的文本。你能把它寄出去吗?
注释:错误:DBA对象已经从共识峰值集形成
通过
ahua217
•0
如果零峰值是它们最终能产生的,我会重新考虑是否应该生成一个关于这些的维恩图。谢谢!
票
答案:将UniProt条目名称转换为基因符号
答案:将UniProt条目名称转换为基因符号
答:数值变量缩放+居中后,DESeq2结果变化很大
答案:没有结果从plotPCA()
评论:DEseq2比较顺序
奖
•所有
先知
来
amel.zulji
•0
受欢迎的问题
来
erwan.scaon
•10
很好的问题
来
komal.rathi
•80年
史诗的问题
来
komal.rathi
•80年
欣赏
来
马修·里奇
•960年
位置
•所有
WEHI,澳大利亚墨尔本,
8分钟前
德国,
30分钟前
澳大利亚,
44分钟前
瑞士,
1小时前
爱尔兰共和国,
1小时前
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