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2
的观点
新闻:
BiocFileCache, AnnotationHub和ExperimentHub的更新
BiocFileCache
AnnotationHub
ExperimentHub
缓存
1小时前
shepherl
2.6 k
0
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4
的观点
总结CNV曲线图
conumee
1小时前
melpag
•0
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5
的观点
应用exomeCopy调用cnv而不考虑批处理效果
exomeCopy
CNV
韦斯
1小时前
程
•0
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6
的观点
DiffBind不使用DESeq2 MLE估计fold change
DiffBind
1小时前
山姆
•10
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3.
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18
的观点
如何estimateDisp, glmQLFit和glmQLFTest处理我的TMM归一化读计数矩阵?
刨边机
glmQLFTest
glmQLFit
estimateDisp
3小时前
朱塞佩
•0
•25分钟前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
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15
的观点
读取SDS格式的qPCR数据时出错
HTqPCR
8小时前
Nghia
•0
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3.
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61
的观点
DiffBind DEseq
DiffBind
1天前
浩然
•0
•8小时前更新
swbarnes2
•670年
6
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2.9 k
的观点
教程:
从Bioconductor获取公共基因组数据
geoquery
geometadb
sradb
教程
5.8年前
肖恩·戴维斯
21日k
•更新1天前
鲁班雷克斯
•0
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2
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103
的观点
多因子的设计矩阵
designmatrix
RNA-seq
limma
11天前
athief
•10
•更新1天前
戈登•史密斯
42 k
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105
的观点
VCF文件太大,不适合tabix。最好的选择,使它与R?
samtools
tabix
VariantAnnotation
VCFArray
4星期前
天真的
•0
•2天前更新
小文森特·j·凯里
6.3 k
3.
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94
的观点
GEO + RNA-seq。完全的新手。
RNASeqData
RNASeq
地理
RNASeqR
帮助
2天前•更新1天前
hgalmoore
•0
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29
的观点
ChIPseeker下游注释
下游
优先级
ChIPseeker
3天前
小姐程
•0
3.
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112
的观点
R会话中止:prcomp
Biobase
统计数据
9天前
Gero
•0
•3天前更新
凯文Blighe
2.7 k
0
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1
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61
的观点
Limma Voom设计和对比矩阵-我的参数也可以是一个因素吗?
RNASeqRData
limma
RNASeq
RNASeqR
3天前
丽塔
•0
•3天前更新
戈登•史密斯
42 k
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0
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24
的观点
匹配模式函数用于R
matchPattern
自动
Biostrings
for循环
3天前
adklts
•0
1
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1
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29
的观点
IRanges / Granges对象的平均覆盖率图
IRanges
3天前
n.mary
•0
•3天前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
0
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19
的观点
Gviz import lor从bam文件读取
Gviz
longreads
3天前
ginlucks
•0
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36
的观点
错误与Rhtslib
Rhts
Rhtslib
4天前
anand_mt
•80年
2
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35
的观点
新闻:
2021年新生物导体社区咨询委员会成员
bioconductoroversight
新闻
社区
BiocVersion
4天前
马修·里奇
•990年
0
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0
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26
的观点
提取侧翼序列SNP,不含参考基因组
SNPData
snpStats
单核苷酸多态性
flankingsequences
4天前
琥珀色的
•0
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5
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75
的观点
TxDbfromGFF的基因组特征错误
GenomicFeatures
TxDb
4天前
sieminsk
•0
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10
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171
的观点
如何运行Goseq列表的集成基因id
goseq
7天前•2天前更新
幸运的
•0
0
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1
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29
的观点
新闻:
SBGNview手稿bioRxiv现在
通路
SBGNview
Reactome
pathview
豹
5天前
罗Weijun
♦1.5 k
•4天前更新
楚
•0
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2
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65
的观点
错误与gbCounts
Aspli
ASpli
13天前•4天前更新
jbono
•0
1
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5
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131
的观点
在设计矩阵的时候,我得到了一个错误,请帮助我
RNASeqR
5天前
Rishav
•0
•5天前更新
Basti
•60
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0
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62
的观点
可以ENmix:: oxBS。MLE是在战斗调整数据上运行的?
ENmix
战斗
5天前
joannew
•0
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2
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94
的观点
基因ID转换用于差异表达基因的途径富集分析
GeneIDConversion
AnnotationForge
7天前
AbhilashKumar。特里帕西
•0
•5天前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
1
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1
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40
的观点
lncRNA微阵列数据如何分位数归一化?
limma
微阵列
6天前
a.deb
•0
•5天前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
0
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0
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25
的观点
工作:
意大利米兰IEO计算机癌症生物学博士后
TCGAbiolinks
BiomedicalInformatics
网络
6天前
martin.schaefer
•0
0
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1
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54
的观点
利用计数数据计算内含子保留率
snapcount
recount3
重新计票
6天前
马列拉议会洛佩兹
•0
•6天前更新
莱昂纳多Collado托雷斯
•870年
0
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2
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75
的观点
对于RNAseq样本具有非常不同的计数数的voom-limma工作流
轰
limma
RNASeq
6天前
annadv
•0
0
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4
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95
的观点
Pheatmap/Complexheatmap:用NAs制作连续色标
R
通路
pheatmap
limma
8天前
r.i.s.alnuwaysir
•10
•7天前更新
SamGG
•270年
1
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3.
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One hundred.
的观点
Illumina?
DESeq2
测序
8天前
simplyphage
•0
•7天前更新
victorbradford4
•0
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2
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77
的观点
边缘器中的另一种剪接分析:重复的外显子
刨边机
Rsubread
9天前•6天前更新
jbono
•0
2
票
2
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93
的观点
如果整个样本的计数都很低,P值是否可靠?
DESeq2
测序
9天前
simplyphage
•0
0
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0
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40
的观点
工作:
北卡罗来纳大学夏洛特分校生物统计/生物信息学研究科学家
R
统计数据
singlecellRNA-Seq
pathview
工作
9天前
罗Weijun
♦1.5 k
1
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1
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92
的观点
没有模块成员> 0.8的基因
wgcna
WGCNA
hubgenes
11周之前
汉娜
•10
•9天前更新
Vivek
•10
2
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1
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132
的观点
模块保存vs共识分析
WGCNA
wgcna
5周前
Colari19
•20
•9天前更新
Vivek
•10
2
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2
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113
的观点
如何重新分配DESeqDataSet设计包括新添加的列到columnData
DESeq2
9天前
rnavabjj
•0
2
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1
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101
的观点
Error in (function (classes, fdef, mtable)): unable to find a inherited method for function ' rma ' for signature ' "ExpressionSet" "
地理
益生元
9天前
Gero
•0
•9天前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
0
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1
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52
的观点
使用conda在Linux服务器上设置bioconductor
dada2
conda
phyloseq
10天前
丹尼尔
•0
•9天前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
0
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1
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61
的观点
DEseq2用于时间点分析
DESeq2
时间点
10天前
克洛伊
•0
•10天前更新
凯文Blighe
2.7 k
1
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3.
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70
的观点
使用读组分割BAM文件
readgroup
bam
Rsamtools
10天前
sbcn
•60
•4天前更新
马丁•摩根
25 k
1
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3.
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104
的观点
是否存在一个类似getSeq函数的范围,围绕结束到开始?
circulargenome
ORFik
getSeq
•10天前更新
hauken_heyken
•80年
3.
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98
的观点
对成对数据的多级比较:是否重复相关?
limma
10天前
Lluis里维拉桑丘
•630年
0
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4
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One hundred.
的观点
BiocParallel: bplapply发明数据
BiocParallel
ShortRead
10天前更新
robmaz77
•20
2
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1
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83
的观点
在正常化之前移除基因?
刨边机
11天前
玛吉Sladek
•0
•10天前更新
戈登•史密斯
42 k
0
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0
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34
的观点
黑名单错误在dba.analyze(dbObj)
DiffBind
ChIPSeq
10天前
悟空
•0
2
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3.
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82
的观点
一些基因的pvalue和padj是空的
DESeq2
10天前
蔓
•10
•10天前更新
ATpoint
•530年
0
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2
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73
的观点
比较控制是在不同的批
DESeq2
DifferentialExpression
11天前
丽娜
•0
•11天前更新
凯文Blighe
2.7 k
40,474结果•页面
810年1
最近……
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注释:如何estimateDisp, glmQLFit和glmQLFTest处理我的TMM规范化读计数m
通过
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
ATpoint提供的链接是指向' edgeR ',而不是' csaw ',所以你应该跟随该链接并阅读用户指南。这个支持网站的目的是…
注释:如何estimateDisp, glmQLFit和glmQLFTest处理我的TMM规范化读计数m
通过
朱塞佩
•0
嗨ATpoint,谢谢你的回复…我使用Csaw为这个项目,但我认为不重要,因为我的怀疑是关于edgeR步骤后c…
注释:如何estimateDisp, glmQLFit和glmQLFTest处理我的TMM规范化读计数m
通过
ATpoint
•530年
你在手册的哪一点卡住了?//www.anjoumacpherson.com/packages/release/bioc/vignettes/edgeR/inst/doc/edgeRUsersGuid..。
备注:DiffBind DEseq
通过
swbarnes2
•670年
你是否试图在缺少复制的情况下作弊?
备注:DiffBind DEseq
通过
浩然
•0
谢谢你,罗里!多个示例使用了相同的bam文件。
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edge多重对比Vs. One测试
A: edge多重对比Vs. One测试
global vs. separate in limma decideTests
决策测试(limma)中的方法
评论:GEO + RNA-seq。完全的新手。
奖
•所有
老师
来
珍妮Drnevich
♦2.0 k
受欢迎的问题
来
assaron
•160年
先知
来
cja
•0
受欢迎的问题
来
jennyl.smith12
•0
支持者
来
ag1805x
•50
位置
•所有
美国,
6分钟前
美国,
27分钟前
美国,
29分钟前
德国,
1小时前
瑞士,
1小时前
流量:过去一小时访问了275名用户
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