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WGCNA
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30.
的观点
两种生物(病毒-宿主)的WGCNA归一化
RNA-Seq
DESeq2
WGCNA
归一化
5天前
wrzl
•0
1
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48
的观点
没有模块成员> 0.8的基因
wgcna
WGCNA
hubgenes
18天前
汉娜
•10
0
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43
的观点
为什么“无标度拓扑”在WGCNA中估计为-符号(斜率)* (R^2) ?
网络
StatisticalMethod
WGCNA
ExpressionData
18天前
jol.espinoz
•30
0
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1
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88
的观点
安装。bd为WGCNA
GO.db
WGCNA
6周前
VictoriaL
•0
•6周前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
1
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132
的观点
DESeq2作为WGCNA的输入
WGCNA
DESeq2
•更新于5周前
块钱
•0
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77
的观点
来自labeledHeatmap的相关值
WGCNA
6周前
R
•40
•更新于25天前
nick.eagles
•90年
15
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17
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10 k
的观点
WGCNA:什么是“软阈值”?
wgcna
网络分析
网络
相关
coexpression
4.4年前
jol.espinoz
•30
•8周前更新
Lluis里维拉桑丘
•610年
0
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56
的观点
每个基因的基因显著性p值需要FDR校正吗?
WGCNA
8周前
米格尔。科森扎
•10
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82
的观点
在WGCNA中使用RSEM计数
rsem
RSEM
WGCNA
10周前
harelarik
•50
1
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89
的观点
任何可能性应用
WGCNA
12周前
做到!
•0
•更新于12周前
凯文Blighe
2.4 k
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102
的观点
如何通过WGCNA在不同平台的两个数据集之间找到共识模块
consensusmodule
微阵列
RNA-seq
WGCNA
3个月前
modarzi
•10
2
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7
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139
的观点
WGCNA:拓扑重叠矩阵(TOM)值大于1
WGCNA
3个月前
teresisc
•10
0
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2
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121
的观点
WGCNA软阈值斜率
wgcna
4个月前
kiddos17
•0
•4个月前更新
priyabansal8855
•0
0
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73
的观点
未配对数量性状
wgcna
5个月前
lidia.mateo
•30
2
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1
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269
的观点
WGCNA中模块成员的计算
WGCNA
RNA-seq
ModuleMembership
网络
中心基因
5个月前
ag1805x
•50
•5个月前更新
彼得Langfelder
♦2.6 k
0
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2
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113
的观点
在WGCNA不足
wgcna
网络
bicor
阈值
5个月前
ag1805x
•50
•5个月前更新
彼得Langfelder
♦2.6 k
0
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9
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369
的观点
WGCNA模块特性关系问题
wgcna
7个月前
禅
•0
•7个月前更新
彼得Langfelder
♦2.6 k
4
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2
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93
的观点
Mac版本的R在安装WGCNA时总是报错
软件错误
WGCNA
mac
8个月前
562125035
•0
•8个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
0
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7
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159
的观点
WGCNA教程二世
WGCNA
女性和男性数据集
9个月前
bahmanik@msu.edu
•20
•9个月前更新
凯文Blighe
2.4 k
2
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5
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97
的观点
样品在WGCNA中复制?
WGCNA
9个月前
bahmanik@msu.edu
•20
•9个月前更新
凯文Blighe
2.4 k
3.
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2
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97
的观点
WGCNA与差分表达式分析的耦合:关于基线模块检测的问题
wgcna
WGCNA
9个月前
Colari19
•10
•9个月前更新
凯文Blighe
2.4 k
1
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2
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73
的观点
“将共识模块与女性集特定模块关联”错误
WGCNA
9个月前
bahmanik@msu.edu
•20
•9个月前更新
彼得Langfelder
♦2.6 k
0
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1
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65
的观点
计算TOM在块的WGCNA
WGCNA
汤姆
基于块
9个月前
C一个
•0
•9个月前更新
彼得Langfelder
♦2.6 k
0
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2
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74
的观点
wgcna的TOM比TOM一般化
WGCNA
汤姆
10个月前
n.naharfancy
•0
•10个月前更新
彼得Langfelder
♦2.6 k
1
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5
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102
的观点
需要对WGCNA网络可视化的意见/建议
WGCNA
10个月前
minyaaa9058
•10
0
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8
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197
的观点
WGCNA软阈值:为什么符号R^2 (R ^2)的y轴大于1,渐近线在1.5处?
WGCNA
软阈值
10个月前
DWF
•0
•10个月前更新
彼得Langfelder
♦2.6 k
0
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0
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84
的观点
WGCNA用于剂量-响应RNA-Seq数据
wgcna
网络分析
10个月前
jwilliamblamer
•0
0
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2
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398
的观点
研究模块在ONE网络中的重要性(或模块保存)
modulePreservation
WGCNA
模块的意义
排列
•更新于11个月前
harelarik
•50
1
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1
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45
的观点
WGCNA样本数减少
wgcna
networkanalysis
11个月前
anjanaram1
•10
•11个月前更新
shepherl
2.5 k
2
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2
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118
的观点
如何在一个模块中可视化基因网络
WGCNA
网络
11个月前
huynguyen96.dnu
•10
•11个月前更新
凯文Blighe
2.4 k
3.
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2
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125
的观点
筛选WGCNA的低方差基因
deseq2
WGCNA
12个月前
minyaaa9058
•10
•更新12个月前
彼得Langfelder
♦2.6 k
1
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0
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66
的观点
热图中WGCNA特征排序
wgcna
WGCNA
wgcna包
12个月前
coyoung
•10
3.
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3.
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98
的观点
WGCNA模块颜色显示不正确
WGCNA
12个月前
minyaaa9058
•10
•更新12个月前
彼得Langfelder
♦2.6 k
0
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2
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797
的观点
无法安装,更新WGCNA和GO.db
WGCNA
软件错误
12个月前
rproendo
•0
2
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3.
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99
的观点
WGCNA中树状图高度的解释?
WGCNA
coexpression网络
12个月前
huynguyen96.dnu
•10
•更新12个月前
彼得Langfelder
♦2.6 k
0
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0
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60
的观点
如何在WGCNA TOMplot中标记模块颜色
WGCNA
TOMplot
module-colors
12个月前
saadmurtazakhan
•10
0
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6
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169
的观点
WGCNA基因模块之间的重叠基因
WGCNA
12个月前
shresthavivek18
•0
0
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4
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144
的观点
采用WGCNA的病例对照研究
wgcna
网络
rna-seq
13个月前
ag1805x
•50
1
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2
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294
的观点
WGCNA并行多线程块模块和TOMsimilarity
wgcna
并行化
14个月前
生物群落
•10
•更新于14个月前
彼得Langfelder
♦2.6 k
0
票
2
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294
的观点
WGCNA模块特征基因PC1及其表达相关性
WGCNA
DESeq2
RNA-Seq
14个月前
斯里兰卡戴维·
•0
1
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4
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340
的观点
去除WGCNA的RNA-seq数据中的批处理效应
limma
deseq2
wgcna
RUVseq
14个月前
ag1805x
•50
2
票
4
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508
的观点
WGCNA基因的显著性和模块成员关系
WGCNA
R
14个月前
VictoriaL
•0
•更新于14个月前
彼得Langfelder
♦2.6 k
0
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1
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163
的观点
plotEigengeneNetworks WGCNA将ME标签添加到图的左侧
R
WGCNA
15个月前
normingt
•0
0
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6
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251
的观点
分解plotEigengeneNetworks()的输出
WGCNA
的热图
EigenGeneNetworks
15个月前
l.s.wijaya
•0
0
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1
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162
的观点
寻找具有WGCNA的模块-在表达数据中折叠生物复制-然后在先前发现的模块上寻找特征基因
WGCNA
模块检测
15个月前
vsa1111
•0
4
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6
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388
的观点
将WGCNA结果子集导出到Cytoscape
wgcna
16个月前
charles.foster
•100年
•16个月前更新
彼得Langfelder
♦2.6 k
1
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4
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716
的观点
WGCNA: 1)软阈值能力低,2)模块大,3)不同类型特征变量的相关性最好
WGCNA
16个月前
stu111538
•0
•16个月前更新
彼得Langfelder
♦2.6 k
0
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1
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370
的观点
WGCNA:相关性模块-性状,模块成员-基因显著性
WGCNA
co-expression分析
基因的意义
会员模块
module-trait关系
16个月前
rodrigo.duarte88
•30
1
投票
1
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207
的观点
WGCNA基因簇vs本征基因
wgcna
网络
coexpression
eigengenes
17个月前
生物群落
•10
•更新于17个月前
戈登•史密斯
42 k
0
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3.
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223
的观点
具有甲基化数据但无无标度拓扑的WGCNA软阈值
甲基化
史诗
无标度拓扑
WGCNA
17个月前
enora.fremy
•0
•更新于17个月前
彼得Langfelder
♦2.6 k
239结果•页面
1的5
最近……
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答:NGS数据的独立过滤
通过
沃尔夫冈•休伯
13 k
事实上,你正“*面对....”处理过的样品的生物重复之间的非常强的分散*”表明D…
答:当我使用biomaRt getBM时,错误日志
通过
沃尔夫冈•休伯
13 k
尝试[安装说明][1],特别是运行if(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.pa…
注释:DiffBind安装失败:错误:包' BiocGenerics ' 0.34.0被加载,但是
通过
马丁•摩根
25 k
更新您的Bioconductor版本' BiocManager::install(version = "3.12") '。确保更新成功' BiocManager::valid() '。瞧…
注释:DiffBind安装失败:错误:包' BiocGenerics ' 0.34.0被加载,但是
通过
ATpoint
•390年
当前的bios是3.12,不是3.11,参见//www.anjoumacpherson.com/install/
注释:DEseq2比较顺序
通过
凯文Blighe
2.4 k
嗨,我认为你需要改变这一行:sampleTable$condition <- factor(sampleTable$condition)…: sampleTable conditi美元……
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注释:安装bsgome . hsapiens . ucsc .hg38时出错
DESeq2设计模型,考虑3个因素
注释:DESeq2用于嵌套个体的时间过程
加入生物导体社区咨询委员会
答:DiffBind 3.0的dba.count()没有bSubControl参数
奖
•所有
受欢迎的问题
来
erwan.scaon
•10
很好的问题
来
komal.rathi
•80年
史诗的问题
来
komal.rathi
•80年
欣赏
来
马修·里奇
•960年
受欢迎的问题
来
s.munster
•40
位置
•所有
WEHI,墨尔本,澳大利亚,
17分钟前
阿根廷罗萨里奥(罗萨里奥国立大学),
26分钟前
美国,
38分钟前
中国
1小时前
海边的城市,
1小时前
内容
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