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2
的观点
新闻:
更新BiocFileCache, AnnotationHub和ExperimentHub
BiocFileCache
AnnotationHub
ExperimentHub
缓存
1小时前
shepherl
2.6 k
0
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4
的观点
总结CNV情节与圆锥
conumee
1小时前
melpag
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5
的观点
应用exomeCopy调用cnv而不考虑批处理效果的控制
exomeCopy
CNV
韦斯
1小时前
程
•0
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6
的观点
DiffBind不使用DESeq2的MLE估计折叠变化
DiffBind
1小时前
山姆
•10
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3.
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18
的观点
如何estimateDisp, glmQLFit和glmQLFTest处理我的TMM规范化读计数矩阵?
刨边机
glmQLFTest
glmQLFit
estimateDisp
3小时前
朱塞佩
•0
•25分钟前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
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15
的观点
以SDS格式读取qPCR数据时出错
HTqPCR
8小时前
Nghia
•0
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3.
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61
的观点
DiffBind DEseq
DiffBind
1天前
浩然
•0
•7小时前更新
swbarnes2
•670年
6
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2.9 k
的观点
教程:
从Bioconductor获取公共基因组数据
geoquery
geometadb
sradb
教程
5.8年前
肖恩·戴维斯
21日k
•1天前更新
鲁班雷克斯
•0
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2
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103
的观点
多因素设计矩阵
designmatrix
RNA-seq
limma
11天前
athief
•10
•1天前更新
戈登•史密斯
42 k
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105
的观点
VCF文件太大,不适合表格。最好的选择是让它与R一起使用?
samtools
tabix
VariantAnnotation
VCFArray
4星期前
天真的
•0
•2天前更新
小文森特·j·凯里
6.3 k
3.
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94
的观点
GEO + RNA-seq。完全的新手。
RNASeqData
RNASeq
地理
RNASeqR
帮助
2天前•1天前更新
hgalmoore
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29
的观点
ChIPseeker中下游的注释
下游
优先级
ChIPseeker
3天前
小姐程
•0
3.
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112
的观点
R会话中断:prcomp . log
Biobase
统计数据
9天前
Gero
•0
•3天前更新
凯文Blighe
2.7 k
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61
的观点
Limma boom设计和对比矩阵-我的参数也可以是一个因素吗?
RNASeqRData
limma
RNASeq
RNASeqR
3天前
丽塔
•0
•3天前更新
戈登•史密斯
42 k
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24
的观点
R中多个模式的matchPattern函数
matchPattern
自动
Biostrings
for循环
3天前
adklts
•0
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1
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29
的观点
IRanges / Granges对象的平均覆盖图
IRanges
3天前
n.mary
•0
•3天前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
0
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19
的观点
Gviz import lor从bam文件中读取
Gviz
longreads
3天前
ginlucks
•0
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36
的观点
Rhtslib错误
Rhts
Rhtslib
4天前
anand_mt
•80年
2
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35
的观点
新闻:
2021年生物导体社区咨询委员会新成员
bioconductoroversight
新闻
社区
BiocVersion
4天前
马修·里奇
•990年
0
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26
的观点
提取无参考基因组的侧翼序列SNP
SNPData
snpStats
单核苷酸多态性
flankingsequences
4天前
琥珀色的
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5
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75
的观点
TxDbfromGFF的基因组特征错误
GenomicFeatures
TxDb
4天前
sieminsk
•0
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10
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171
的观点
如何运行Goseq集合基因id列表
goseq
7天前•2天前更新
幸运的
•0
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1
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29
的观点
新闻:
SBGNview手稿bioRxiv现在
通路
SBGNview
Reactome
pathview
豹
4天前
罗Weijun
♦1.5 k
•4天前更新
楚
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2
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65
的观点
Aspli: gbCounts错误
Aspli
ASpli
13天前•4天前更新
jbono
•0
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5
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131
的观点
我在设计矩阵时出错了,请帮我解决
RNASeqR
5天前
Rishav
•0
•5天前更新
Basti
•60
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0
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62
的观点
可以ENmix:: oxBS。MLE在战斗调整数据上运行?
ENmix
战斗
5天前
joannew
•0
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2
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94
的观点
基因ID转换用于差异表达基因的通路富集分析
GeneIDConversion
AnnotationForge
7天前
AbhilashKumar。特里帕西
•0
•5天前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
1
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1
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40
的观点
如何分位数归一化arraystar lncRNA微阵列数据?
limma
微阵列
6天前
a.deb
•0
•5天前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
0
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25
的观点
工作:
意大利米兰IEO计算癌症生物学博士后
TCGAbiolinks
BiomedicalInformatics
网络
6天前
martin.schaefer
•0
0
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1
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54
的观点
利用重新计数数据计算内含子保留率
snapcount
recount3
重新计票
6天前
Mariela Cortés López
•0
•6天前更新
莱昂纳多·科拉多·托雷斯
•870年
0
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2
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75
的观点
对于计数数量非常不同的RNAseq样本的vom -limma工作流
轰
limma
RNASeq
6天前
annadv
•0
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4
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95
的观点
Pheatmap/Complexheatmap:用NAs制作连续的颜色标度
R
通路
pheatmap
limma
8天前
r.i.s.alnuwaysir
•10
•7天前更新
SamGG
•270年
1
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3.
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One hundred.
的观点
Illumina长基因优先测序
DESeq2
测序
8天前
simplyphage
•0
•7天前更新
victorbradford4
•0
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77
的观点
edgeR中可选剪接分析:重复外显子
刨边机
Rsubread
9天前•6天前更新
jbono
•0
2
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2
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93
的观点
如果整个样本的计数都很低,P值是否可靠?
DESeq2
测序
9天前
simplyphage
•0
0
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0
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40
的观点
工作:
北卡罗来纳大学夏洛特分校生物统计学/生物信息学研究科学家
R
统计数据
singlecellRNA-Seq
pathview
工作
9天前
罗Weijun
♦1.5 k
1
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1
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92
的观点
没有模块成员> 0.8的基因
wgcna
WGCNA
hubgenes
11星期前
汉娜
•10
•9天前更新
Vivek
•10
2
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1
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132
的观点
WGCNA:模块保存vs共识分析
WGCNA
wgcna
五星期前
Colari19
•20
•9天前更新
Vivek
•10
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113
的观点
如何重新分配DESeqDataSet设计,以包括新添加的列到columnData
DESeq2
9天前
rnavabjj
•0
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1
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101
的观点
(函数(类,fdef, mtable)中的错误:无法为签名“ExpressionSet”的函数“rma”找到继承的方法
地理
益生元
9天前
Gero
•0
•9天前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
0
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52
的观点
使用conda在Linux服务器上设置bioconductor
dada2
conda
phyloseq
10天前
丹尼尔
•0
•9天前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
0
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1
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61
的观点
DEseq2用于时间点分析
DESeq2
时间点
10天前
克洛伊
•0
•10天前更新
凯文Blighe
2.7 k
1
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3.
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70
的观点
用读组拆分BAM文件
readgroup
bam
Rsamtools
10天前
sbcn
•60
•4天前更新
马丁•摩根
25 k
1
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3.
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104
的观点
是否存在一个类似getSeq的函数,用于围绕结束到开始的范围?
circulargenome
ORFik
getSeq
19天前•10天前更新
hauken_heyken
•80年
3.
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2
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98
的观点
与配对数据的多级比较:重复相关与否?
limma
10天前
Lluís雷维拉·桑丘
•630年
0
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4
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One hundred.
的观点
BiocParallel: bplapply发明数据
BiocParallel
ShortRead
11天前•10天前更新
robmaz77
•20
2
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1
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83
的观点
在标准化之前移除基因?
刨边机
11天前
玛吉Sladek
•0
•10天前更新
戈登•史密斯
42 k
0
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0
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34
的观点
dba.analyze(dbObj)黑名单错误
DiffBind
ChIPSeq
10天前
悟空
•0
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3.
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82
的观点
DESEQ2:一些基因有空的pvalue和padj
DESeq2
10天前
蔓
•10
•10天前更新
ATpoint
•530年
0
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2
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73
的观点
Control在不同批次时的比较
DESeq2
DifferentialExpression
11天前
丽娜
•0
•11天前更新
凯文Blighe
2.7 k
40,474个结果
810个中的1个
最近……
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注释:如何estimateDisp, glmQLFit和glmQLFTest处理我的TMM规范化读计数m
通过
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
ATpoint提供的链接是“edgeR”,而不是“csaw”,所以你应该遵循链接并阅读用户指南。这个支持网站的目的是…
注释:如何estimateDisp, glmQLFit和glmQLFTest处理我的TMM规范化读计数m
通过
朱塞佩
•0
你好,ATpoint,谢谢你的回复…我使用Csaw为这个项目,但我认为不重要,因为我的怀疑是关于edgeR步骤后c…
注释:如何estimateDisp, glmQLFit和glmQLFTest处理我的TMM规范化读计数m
通过
ATpoint
•530年
你在手册的哪一点卡住了?//www.anjoumacpherson.com/packages/release/bioc/vignettes/edgeR/inst/doc/edgeRUsersGuid..。
注释:DiffBind DEseq
通过
swbarnes2
•670年
你是想在缺少复制的情况下欺骗自己吗?
注释:DiffBind DEseq
通过
浩然
•0
谢谢你,罗里!多个示例使用相同的bam文件。
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edgeR多重对比Vs.一次测试
A: edgeR多重对比Vs.一次测试
在limma decide测试中global vs. separate
decideTests (limma)中的方法
评论:GEO + RNA-seq。完全的新手。
奖
•所有
老师
来
珍妮Drnevich
♦2.0 k
受欢迎的问题
来
assaron
•160年
先知
来
cja
•0
受欢迎的问题
来
jennyl.smith12
•0
支持者
来
ag1805x
•50
位置
•所有
美国,
6分钟前
美国,
27分钟前
美国,
29分钟前
德国,
1小时前
瑞士,
1小时前
流量:过去一小时内有275个用户访问
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