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甲基化
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72
的观点
DNA甲基化数据中的替代变量、细胞型组成校正和过拟合
股东价值分析
limma
甲基化
MethylationArray
12天前
纸莎草纸
•10
0
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1
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71
的观点
如何在HPC集群中使用Slurm工作负载管理器并行化这个R脚本?
甲基化
表观基因组学
slurm
mpi
methylmix
6个月前
parra.sev
•20
•6个月前更新
凯文Blighe
2.4 k
0
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64
的观点
除了DMRs之外,对dmp / dmc使用Biseq是否有意义?
Biseq
甲基化
DMP
DMR
rrb
6个月前
i.s.castanho
•0
0
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1
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43
的观点
来自predictedMeth()的甲基化矩阵和坐标的输出顺序是否相同?
biseq
R
甲基化
8个月前
AishaD
•0
2
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1
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88
的观点
lumi:导入甲基化EPIC IDAT文件
光民
史诗
甲基化
9个月前
扎克罗伊
•10
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67
的观点
WGBS数据的反褶积方法(甲基化)
methylCC
反褶积
甲基化
dmrseq
血清
9个月前
marcin.bazyliszek
•0
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5
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91
的观点
champ.load错误
冠军
冠军
甲基化
9个月前
jkong
•0
0
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1
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37
的观点
BiSeq - betaResults输出只包含chr1和chr2
biseq
betaRegression
rrb
甲基化
10个月前
i.s.castanho
•0
1
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1
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79
的观点
SVA配对样本
股东价值分析
史诗
甲基化
limma
11个月前
whyw6948
•0
•11个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
0
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4
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83
的观点
修复了大黄蜂的区域
bumphunter
DMR
甲基化
minfi
•11个月前更新
i.s.brorson
•0
1
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3.
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106
的观点
甲基化EPIC阵列数据的偏斜β分布
冠军
史诗
Illumina公司
甲基化
12个月前
erwin.tomasich
•10
1
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1
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71
的观点
ChAMP DMP的问题。GUI
冠军
冠军
甲基化
史诗
12个月前
cherlyn.t
•0
•12个月前更新
元田
•90年
0
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65
的观点
试图在methylumi中读取idat文件时出错
methylumi
450 k
甲基化
methylome
12个月前
一个
•40
0
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1
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354
的观点
R:向量内存耗尽(达到极限?)
TCGAbiolinks
甲基化
环球数码创意数据
数据准备
12个月前
ph.shimaasherif
•0
2
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16
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311
的观点
甲基化EPIC阵列:ChAMP包- ChAMP。加载附加探针?
甲基化
史诗
冠军
champ.load ()
甲基化数组
12个月前
Ankit
•0
•12个月前更新
元田
•220年
0
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8
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120
的观点
DeSeq2:设计错误,个人嵌套在组中
deseq2
甲基化
•12个月前更新
sara.blocquiaux
•0
0
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0
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84
的观点
Methylmix结果与beta值结果略有不同
癌症
methylmix
甲基化
betavalues
DMvalues
13个月前
luciomora8
•0
0
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1
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101
的观点
甲基化数据线性模型的批量校正
甲基化
战斗
线性模型
批校正
另类投资会议
14个月前
lucasmiranda42
•0
•13个月前更新
凯文Blighe
2.4 k
1
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3.
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164
的观点
差异甲基化探针比差异甲基化基因少得多
甲基化
limma
14个月前
yuabrahamliu
•0
•14个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
1
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3.
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135
的观点
trackViewer:如何为甲基化数据制作棒棒糖
trackViewer
甲基化
lolliplot
15个月前
patriciasolesanchez
•0
0
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1
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94
的观点
建议dmrseq:当adjustCovariate(s)生成非满秩设计时产生Error
dmrseq
甲基化
15个月前
sorjuelal
•0
0
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2
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151
的观点
Illumina 450K质量控制与meffil
meffil
ewa
甲基化
16个月前
uxue33
•0
•16个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
2
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5
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180
的观点
DMR: DMR中的Cpgids
甲基化
史诗
注释
DMRcate
16个月前
yoursbassanio
•0
•16个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
0
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0
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99
的观点
DSS用于非cpg位点分析
DSS
甲基化
16个月前
平静
•0
0
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3.
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223
的观点
具有甲基化数据但无标度拓扑的WGCNA软阈值
甲基化
史诗
无标度拓扑
WGCNA
17个月前
enora.fremy
•0
•更新于17个月前
彼得Langfelder
♦2.6 k
1
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3.
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178
的观点
结合pfilter(西瓜)和preprocessNoob (minfi)
西瓜
minfi
甲基化
pfilter
preprocessNoob
17个月前
sara.blocquiaux
•0
•更新于17个月前
tgorri
•10
1
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6
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209
的观点
在模型矩阵中使用截距或不截距进行edgeR甲基化分析
刨边机
R
甲基化
全球语言监测机构
17个月前
sabrina.mcnew
•0
1
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1
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476
的观点
read.metharray中的小错误
minfi
甲基化
idat
samplesheet
21个月前
研究员
•0
•19个月前更新
戈登•史密斯
42 k
1
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4
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324
的观点
Dmrseq错误:承诺已经在评估中??
dmrseq
甲基化
19个月前
sorjuelal
•0
•19个月前更新
基冈
•60
0
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1
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321
的观点
冠军::冠军。范数误差在冠军。BMIQ(beta[, x], design.v, sampleID = colnames(beta)[x], : task 1 failed - "only defined on a data frame with all…
冠军
甲基化
BMIQ
21个月前
moldach
•20
•21个月前更新
元田
•220年
0
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0
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291
的观点
TCGAanalyze_DMR误差计算两组间平均甲基化差异。
TCGAbiolinks
SummarizedExperiment
TCGAanalyze_DMR
甲基化
R
22个月前
gerald.mccollam
•0
4
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4
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292
的观点
Illumina Methylation 27k minfi
微阵列
甲基化
illumina27k
minfi
23个月前
laurenz.holcik
•0
•23个月前更新
卡斯珀丹尼尔汉森
6.5 k
0
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0
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319
的观点
ENmix:: BMIQ .mc()中的错误:BMIQ估计遇到错误,尝试再次运行它
甲基化
ENmix
BMIQ
西瓜
23个月前
moldach
•20
0
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1
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258
的观点
创建grange对象
微阵列
minfi
GenomicRatio
农庄
甲基化
2.0年前
lalchungnungabt17
•0
•2.0年前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
1
投票
2
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437
的观点
甲基化数据可视化使用methyAnalysis与minfi
甲基化
微阵列
illumina公司
minfi
methyanalysis
2.1年前
Adam_M
•0
•2.1年前更新
或者,Jianhong
♦1.2 k
2
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1
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364
的观点
EPIC甲基化阵列-分析与ChAMP -如何导出床/假发文件在UCSC/IGV查看?
甲基化
史诗
冠军
2.2年前
D
•0
•2.2年前更新
元田
•220年
0
票
0
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226
的观点
使用MeDIP捕获的所有片段/序列都被甲基化了?
medip-seq
甲基化
论文认定
2.2年前
saripalligautam86
•10
0
票
2
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540
的观点
EPIC甲基化数据的ChAMP规范化
冠军
归一化
FunctionalNormalization
甲基化
史诗
2.3年前
yuabrahamliu
•0
1
投票
2
回复
622
的观点
Minfi read.metharray.sheet错误
minfi
甲基化
dataimport
minfidata
missmethyl
2.4年前
moldach
•20
•2.4年前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
2
票
8
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539
的观点
edgeR:甲基化分析的设计矩阵
刨边机
甲基化
2.6年前
sgld
•0
•2.4年前更新
戈登•史密斯
42 k
0
票
0
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306
的观点
使用TCGAanalyze_DMR分析>2组时出错
甲基化
tcgabiolinks
R
格里森评分
TCGAanalyze_DMR
2.4年前
mtkk94
•0
5
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9
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516
的观点
连续协变量校正的limma多级实验
limma
史诗
甲基化
极限设计矩阵
协变量
2.4年前
c.bettencourt
•0
•2.4年前更新
亚伦Lun
♦26 k
0
票
4
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395
的观点
在差异甲基化分析中考虑个体间的亲缘关系?
甲基化
minfi
冠军
2.4年前
elgomez
•0
•2.4年前更新
卡斯珀丹尼尔汉森
6.5 k
1
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2
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435
的观点
安装ChAMP包时出现问题。
软件错误
微阵列
冠军
甲基化
2.4年前
cawten
•10
•2.4年前更新
马丁•摩根
25 k
0
票
3.
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421
的观点
在read.metharray中使用force=TRUE时的最小错误
minfi
甲基化
史诗
2.5年前
jbar3141
•0
1
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1
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394
的观点
从GFF3文件中提取基因结构,用于annotateWithGeneParts()
genomicfeatures
genomation
genomicranges
甲基化
注释
2.5年前
alan.g.hudson
•0
•更新于2.5年前
altuna akalin
•20
0
票
0
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369
的观点
使用minFi解释Illumina甲基化阵列数据的对照条和beta密度图
minfi
甲基化
史诗
2.5年前
四川省
•0
0
票
2
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356
的观点
MethylKit DSS包装
R
bioconductor
甲基化
methylkit
2.5年前
nilaycan
•0
•更新于2.5年前
altuna akalin
•20
0
票
0
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440
的观点
工作:
英国圣安德鲁斯大学招收前列腺癌研究博士后(统计学/计算生物学)
癌症
测序
rnaseq
甲基化
smallrna
工作
2.6年前
安迪•林奇
•100年
1
投票
1
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623
的观点
如何将Illumina HumanMethylation27 BeadChip ID转换为基因名称?
基因名字
甲基化
illumina公司
convertids
2.7年前
arbet003
•10
•2.7年前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
128个结果
三选一
最近……
回复
答:NGS数据独立过滤
通过
沃尔夫冈•休伯
13 k
事实上,你正面对....处理样品的生物重复之间的非常强的分散*”表明D…
答:当我使用biomaRt getBM时的错误日志
通过
沃尔夫冈•休伯
13 k
试试[安装说明][1],特别是运行if(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.pa…
注释:DiffBind安装失败:错误:包' BiocGenerics ' 0.34.0被加载,但是
通过
马丁•摩根
25 k
更新您的Bioconductor版本' BiocManager::install(version = "3.12") '。确保更新成功' BiocManager::valid() '。瞧…
注释:DiffBind安装失败:错误:包' BiocGenerics ' 0.34.0被加载,但是
通过
ATpoint
•390年
当前的Bioc是3.12,而不是3.11,参见//www.anjoumacpherson.com/install/
注释:DEseq2比较顺序
通过
凯文Blighe
2.4 k
嗨,我认为你需要改变这一行:sampleTable$condition <- factor(sampleTable$condition)…: sampleTable conditi美元……
票
注释:安装BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38时出错
DESeq2设计模型,考虑3个因素
注释:DESeq2用于嵌套个体的时间过程
加入Bioconductor社区顾问委员会
答:DiffBind 3.0的dba.count()没有bSubControl参数
奖
•所有
受欢迎的问题
来
erwan.scaon
•10
很好的问题
来
komal.rathi
•80年
史诗的问题
来
komal.rathi
•80年
欣赏
来
马修·里奇
•960年
受欢迎的问题
来
s.munster
•40
位置
•所有
WEHI,澳大利亚墨尔本,
15分钟前
海湾边的城市,
21分钟前
德国,
33分钟前
海德堡/ de.NBI;
45分钟前
欧盟、
1小时前
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