登录
报名
关于
常见问题解答
问问题
最新的
新闻
工作
教程
标签
用户
新职位
最新的
新闻
工作
教程
论坛
标签
地球
用户
登录
报名
关于
关于
常见问题解答
限制
所有的时间
今天
本周
这个月
今年
没有回答
所有的帖子
排序
更新
答案
书签
创建
回复
排名
的观点
票
0
票
0
回复
2
的观点
新闻:
更新BiocFileCache, AnnotationHub和ExperimentHub
BiocFileCache
AnnotationHub
ExperimentHub
缓存
1小时前
shepherl
2.6 k
0
票
0
回复
4
的观点
总结CNV情节与圆锥
conumee
1小时前
melpag
•0
0
票
0
回复
5
的观点
应用exomeCopy调用cnv而不考虑批处理效果的控制
exomeCopy
CNV
韦斯
1小时前
程
•0
0
票
0
回复
6
的观点
DiffBind不使用DESeq2的MLE估计折叠变化
DiffBind
1小时前
山姆
•10
0
票
3.
回复
18
的观点
如何estimateDisp, glmQLFit和glmQLFTest处理我的TMM规范化读计数矩阵?
刨边机
glmQLFTest
glmQLFit
estimateDisp
3小时前
朱塞佩
•0
•25分钟前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
0
票
0
回复
15
的观点
以SDS格式读取qPCR数据时出错
HTqPCR
8小时前
Nghia
•0
0
票
3.
回复
61
的观点
DiffBind DEseq
DiffBind
1天前
浩然
•0
•8小时前更新
swbarnes2
•670年
6
票
1
回复
2.9 k
的观点
教程:
从Bioconductor获取公共基因组数据
geoquery
geometadb
sradb
教程
5.8年前
肖恩·戴维斯
21日k
•1天前更新
鲁班雷克斯
•0
0
票
2
回复
103
的观点
多因素设计矩阵
designmatrix
RNA-seq
limma
11天前
athief
•10
•1天前更新
戈登•史密斯
42 k
0
票
2
回复
105
的观点
VCF文件太大,不适合表格。最好的选择是让它与R一起使用?
samtools
tabix
VariantAnnotation
VCFArray
4星期前
天真的
•0
•2天前更新
小文森特·j·凯里
6.3 k
3.
票
4
回复
94
的观点
GEO + RNA-seq。完全的新手。
RNASeqData
RNASeq
地理
RNASeqR
帮助
2天前•1天前更新
hgalmoore
•0
0
票
0
回复
29
的观点
ChIPseeker中下游的注释
下游
优先级
ChIPseeker
3天前
小姐程
•0
3.
票
4
回复
112
的观点
R会话中断:prcomp . log
Biobase
统计数据
9天前
Gero
•0
•3天前更新
凯文Blighe
2.7 k
0
票
1
回复
61
的观点
Limma boom设计和对比矩阵-我的参数也可以是一个因素吗?
RNASeqRData
limma
RNASeq
RNASeqR
3天前
丽塔
•0
•3天前更新
戈登•史密斯
42 k
0
票
0
回复
24
的观点
R中多个模式的matchPattern函数
matchPattern
自动
Biostrings
for循环
3天前
adklts
•0
1
投票
1
回复
29
的观点
IRanges / Granges对象的平均覆盖图
IRanges
3天前
n.mary
•0
•3天前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
0
票
0
回复
19
的观点
Gviz import lor从bam文件中读取
Gviz
longreads
3天前
ginlucks
•0
0
票
0
回复
36
的观点
Rhtslib错误
Rhts
Rhtslib
4天前
anand_mt
•80年
2
票
0
回复
35
的观点
新闻:
2021年生物导体社区咨询委员会新成员
bioconductoroversight
新闻
社区
BiocVersion
4天前
马修·里奇
•990年
0
票
0
回复
26
的观点
提取无参考基因组的侧翼序列SNP
SNPData
snpStats
单核苷酸多态性
flankingsequences
4天前
琥珀色的
•0
0
票
5
回复
75
的观点
TxDbfromGFF的基因组特征错误
GenomicFeatures
TxDb
4天前
sieminsk
•0
1
投票
10
回复
171
的观点
如何运行Goseq集合基因id列表
goseq
7天前•2天前更新
幸运的
•0
0
票
1
回复
29
的观点
新闻:
SBGNview手稿bioRxiv现在
通路
SBGNview
Reactome
pathview
豹
5天前
罗Weijun
♦1.5 k
•4天前更新
楚
•0
0
票
2
回复
65
的观点
Aspli: gbCounts错误
Aspli
ASpli
13天前•4天前更新
jbono
•0
1
投票
5
回复
131
的观点
我在设计矩阵时出错了,请帮我解决
RNASeqR
5天前
Rishav
•0
•5天前更新
Basti
•60
0
票
0
回复
62
的观点
可以ENmix:: oxBS。MLE在战斗调整数据上运行?
ENmix
战斗
5天前
joannew
•0
1
投票
2
回复
94
的观点
基因ID转换用于差异表达基因的通路富集分析
GeneIDConversion
AnnotationForge
7天前
AbhilashKumar。特里帕西
•0
•5天前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
1
投票
1
回复
40
的观点
如何分位数归一化arraystar lncRNA微阵列数据?
limma
微阵列
6天前
a.deb
•0
•5天前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
0
票
0
回复
25
的观点
工作:
意大利米兰IEO计算癌症生物学博士后
TCGAbiolinks
BiomedicalInformatics
网络
6天前
martin.schaefer
•0
0
票
1
回复
54
的观点
利用重新计数数据计算内含子保留率
snapcount
recount3
重新计票
6天前
Mariela Cortés López
•0
•6天前更新
莱昂纳多·科拉多·托雷斯
•870年
0
票
2
回复
75
的观点
对于计数数量非常不同的RNAseq样本的vom -limma工作流
轰
limma
RNASeq
6天前
annadv
•0
0
票
4
回复
95
的观点
Pheatmap/Complexheatmap:用NAs制作连续的颜色标度
R
通路
pheatmap
limma
8天前
r.i.s.alnuwaysir
•10
•7天前更新
SamGG
•270年
1
投票
3.
回复
One hundred.
的观点
Illumina长基因优先测序
DESeq2
测序
8天前
simplyphage
•0
•7天前更新
victorbradford4
•0
0
票
2
回复
77
的观点
edgeR中可选剪接分析:重复外显子
刨边机
Rsubread
9天前•6天前更新
jbono
•0
2
票
2
回复
93
的观点
如果整个样本的计数都很低,P值是否可靠?
DESeq2
测序
9天前
simplyphage
•0
0
票
0
回复
40
的观点
工作:
北卡罗来纳大学夏洛特分校生物统计学/生物信息学研究科学家
R
统计数据
singlecellRNA-Seq
pathview
工作
9天前
罗Weijun
♦1.5 k
1
投票
1
回复
92
的观点
没有模块成员> 0.8的基因
wgcna
WGCNA
hubgenes
11星期前
汉娜
•10
•9天前更新
Vivek
•10
2
票
1
回复
132
的观点
WGCNA:模块保存vs共识分析
WGCNA
wgcna
五星期前
Colari19
•20
•9天前更新
Vivek
•10
2
票
2
回复
113
的观点
如何重新分配DESeqDataSet设计,以包括新添加的列到columnData
DESeq2
9天前
rnavabjj
•0
2
票
1
回复
101
的观点
(函数(类,fdef, mtable)中的错误:无法为签名“ExpressionSet”的函数“rma”找到继承的方法
地理
益生元
9天前
Gero
•0
•9天前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
0
票
1
回复
52
的观点
使用conda在Linux服务器上设置bioconductor
dada2
conda
phyloseq
10天前
丹尼尔
•0
•9天前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
0
票
1
回复
61
的观点
DEseq2用于时间点分析
DESeq2
时间点
10天前
克洛伊
•0
•10天前更新
凯文Blighe
2.7 k
1
投票
3.
回复
70
的观点
用读组拆分BAM文件
readgroup
bam
Rsamtools
10天前
sbcn
•60
•4天前更新
马丁•摩根
25 k
1
投票
3.
回复
104
的观点
是否存在一个类似getSeq的函数,用于围绕结束到开始的范围?
circulargenome
ORFik
getSeq
19天前•10天前更新
hauken_heyken
•80年
3.
票
2
回复
98
的观点
与配对数据的多级比较:重复相关与否?
limma
10天前
Lluís雷维拉·桑丘
•630年
0
票
4
回复
One hundred.
的观点
BiocParallel: bplapply发明数据
BiocParallel
ShortRead
11天前•10天前更新
robmaz77
•20
2
票
1
回复
83
的观点
在标准化之前移除基因?
刨边机
11天前
玛吉Sladek
•0
•10天前更新
戈登•史密斯
42 k
0
票
0
回复
34
的观点
dba.analyze(dbObj)黑名单错误
DiffBind
ChIPSeq
10天前
悟空
•0
2
票
3.
回复
82
的观点
DESEQ2:一些基因有空的pvalue和padj
DESeq2
10天前
蔓
•10
•10天前更新
ATpoint
•530年
0
票
2
回复
73
的观点
Control在不同批次时的比较
DESeq2
DifferentialExpression
11天前
丽娜
•0
•11天前更新
凯文Blighe
2.7 k
40,474个结果
810个中的1个
最近……
回复
注释:如何estimateDisp, glmQLFit和glmQLFTest处理我的TMM规范化读计数m
通过
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
ATpoint提供的链接是“edgeR”,而不是“csaw”,所以你应该遵循链接并阅读用户指南。这个支持网站的目的是…
注释:如何estimateDisp, glmQLFit和glmQLFTest处理我的TMM规范化读计数m
通过
朱塞佩
•0
你好,ATpoint,谢谢你的回复…我使用Csaw为这个项目,但我认为不重要,因为我的怀疑是关于edgeR步骤后c…
注释:如何estimateDisp, glmQLFit和glmQLFTest处理我的TMM规范化读计数m
通过
ATpoint
•530年
你在手册的哪一点卡住了?//www.anjoumacpherson.com/packages/release/bioc/vignettes/edgeR/inst/doc/edgeRUsersGuid..。
注释:DiffBind DEseq
通过
swbarnes2
•670年
你是想在缺少复制的情况下欺骗自己吗?
注释:DiffBind DEseq
通过
浩然
•0
谢谢你,罗里!多个示例使用相同的bam文件。
票
edgeR多重对比Vs.一次测试
A: edgeR多重对比Vs.一次测试
在limma decide测试中global vs. separate
decideTests (limma)中的方法
评论:GEO + RNA-seq。完全的新手。
奖
•所有
老师
来
珍妮Drnevich
♦2.0 k
受欢迎的问题
来
assaron
•160年
先知
来
cja
•0
受欢迎的问题
来
jennyl.smith12
•0
支持者
来
ag1805x
•50
位置
•所有
美国,
7分钟前
美国,
28分钟前
美国,
30分钟前
德国,
1小时前
瑞士,
1小时前
流量:过去一小时内有275个用户访问
内容
搜索
用户
标签
徽章
帮助
关于
常见问题解答
访问
RSS
API
统计数据
使用本网站即表示接受我们的
用户协议和隐私政策
.
由
版本2.3.4