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GenomicFeatures
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76
的观点
重新探讨TxDB中基因名称的包含
Bioconductor
GenomicFeatures
TxDB
12周前
k.vitting.seerup
•100年
0
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2
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114
的观点
为什么与kallisto的tpm相比,tpm的值不同?
rnaseq
计数
tpm
GenomicFeatures
kallisto
3个月前
m93
•0
•3个月前更新
迈克尔的爱
31 k
0
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53
的观点
用于替代异构体的pmapToTranscripts
GenomicFeatures
3个月前
lvclark
•0
0
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1
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197
的观点
制作TxDb时添加基因符号
txdb
genomicfeatures
5个月前
杰克
•70年
•5个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
3.
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171
的观点
GRanges/GFeatures:在cdsByOverlaps输出中保留所有父列
农庄
GenomicRanges
GenomicFeatures
cdsByOverlaps
DiffBind
5个月前
vanbelj
•10
•5个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
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81
的观点
从GTF创建TXDB时出错
genomicfeatures
makeTxDbFromGRanges
GenomicFeatures
makeTxDbfromGRanges
6个月前
anze.zupanic
•0
•6个月前更新
shepherl
2.5 k
3.
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6
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131
的观点
TxDb,基因组特征从GTF文件加载(Mmul_8)
TxDb
GenomicFeatures
6个月前
布莱恩•史密斯
•120年
•6个月前更新
马丁•摩根
25 k
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62
的观点
makeTxDbFromGFF警告含义
GenomicFeatures
8个月前
ribioinfo
•90年
•8个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
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2
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92
的观点
如何为TES创建grange
GenomicFeatures
TxDb
CLIP-Seq
8个月前
mar.pieraccioli
•10
•8个月前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
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70
的观点
警告:使用makeTxDbFromGFF停止不能映射到外显子的密码子
genomicranges
genomicfeatures
9个月前
shangguandong1996
•20
0
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61
的观点
makeTxDbFromBiomart错误
GenomicFeatures
9个月前
sjmonkley
•30
•9个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
2
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3.
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214
的观点
在genome edbinfo包中“无法将以下UCSC序列水平映射到NCBI序列水平”错误
genomeinfodb
hg19
加州大学
seqlevel
genomicfeatures
10个月前
焚风
•60
•10个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
3.
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4
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120
的观点
如何关闭“makeTxDbFromGFF”中miRNA类型的识别特征
GenomicFeatures
genomicranges
10个月前
shangguandong1996
•20
•10个月前更新
Herve页面
14 k
1
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2
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80
的观点
任何“缓存”TxDb对象的可能性?
GenomicFeatures
TxDb
11个月前
aush
•40
•11个月前更新
史蒂夫Lianoglou
13 k
0
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79
的观点
试图转换gff文件-> txdb对象使用GenomicFeatures::makeTxDbFromGFF()错误
GenomicFeatures
注释
人造石铺地面
GenomicRanges
11个月前
domenick.braccia
•0
•11个月前更新
shepherl
2.5 k
0
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2
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69
的观点
在包GenomicFeatures中的makeTxDbFromBiomart期间,biomart web服务错误
biomart
txdb
makeTxDbFromBiomart
GenomicFeatures
12个月前
ksomi47
•0
•12个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
6
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11
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2.7 k
的观点
基因间坐标与基因组特征
genomicranges
genomicfeatures
iranges
5.9年前
饼干
•20
•12个月前更新
mohancm89
•0
2
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3.
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88
的观点
基因组特征启动子重叠:通过重叠识别启动子?
GenomicFeatures
GenomicRanges
12个月前
vanbelj
•10
•12个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
0
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3.
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148
的观点
将转录本中的外显子大小调整为总宽度
genomicranges
genomicfeatures
13个月前
杰克
•70年
•13个月前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
0
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8
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191
的观点
exonsBy没有按升序排列外显子,这是一个错误还是过时的文档?
GenomicFeatures
GenomicAlignment
GenomicAlignments
exonBy
coverageByTranscript
14个月前
Jiping王
•70年
•14个月前更新
Herve页面
14 k
0
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107
的观点
解决了。在GenomicRanges的列表中查找到最近邻居(非自己)的距离
GenomicRanges
GenomicFeatures
画眉山庄
distanceToNearest
R
15个月前
rmash
•0
4
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3.
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548
的观点
TxDb错误:外部指针无效
软件错误
GenomicFeatures
16个月前
威廉·麦克朗
•0
0
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2
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237
的观点
从gtf文件创建txDb时出错
genomicfeatures
17个月前
bioinagesh
•0
3.
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4
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224
的观点
每个基因有三个eutrsbytranscript
GenomicFeatures
成绩单
基因
threeUTRsByTranscript
17个月前
amgtech
•0
•17个月前更新
Herve页面
14 k
0
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1
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227
的观点
从GFF3数据为非系统生物/ denovo程序集创建完整的TXDB对象
GenomicFeatures
rtracklayer
21个月前
stephane.plaisance
•10
•21个月前更新
Herve页面
14 k
0
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0
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284
的观点
makeTxDbFromGFF错误
genomicfeatures
人造石铺地面
定制的基因组
makeTxDbFromGFF
makeTxDbFromGRanges
21个月前
xvazquezc
•0
0
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0
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189
的观点
基因组特征包的特征功能在2014年工作,但目前不工作(上传已删除的帖子)
genomicfeatures
22个月前
rodolfobahamonde
•0
•22个月前更新
马丁•摩根
25 k
4
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3.
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455
的观点
利用基因组特征提取转录本的上游和下游区域
genomicfeatures
23个月前
courtney.stairs
•0
•23个月前更新
Herve页面
14 k
5
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6
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516
的观点
makeTxDbFromUCSC错误
genomicfeatures
R
bioconductor
maketxdbfromucsc
2.0年前
alanchenslm
•0
2.0年前更新
Herve页面
14 k
0
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5
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284
的观点
基因组特征支持ducscfeaturedbtracks永不返回,必须与C-c终止
genomicfeatures
错误
2.2年前
马尔科姆。库克
♦1.5 k
•2.2年前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
1
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2
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450
的观点
makeTxDbFromUCSC: Make the TxDb对象出错
GenomicFeatures
makeTxDbFromUCSC
R
2.2年前
DMA1
•10
0
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2
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380
的观点
dexSeq总结实验的准备
dexseq
genomicalignments
genomicfeatures
genomicranges
2.3年前
一个
•40
0
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1
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349
的观点
NCBI hg38转录本注释包
GenomicFeatures
2.3年前
zoe.ward
•0
•2.3年前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
0
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0
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380
的观点
基因组特征:如何提取一个基因的TSS上游区域,直到侧翼(附近)基因的结束位置。
genomicranges
genomicfeatures
启动子
upstream_flank
2.4年前
Wojeff
•0
1
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8
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816
的观点
试图将核苷酸位置从转录本映射到基因组位置
genomicfeatures
mapfromtranscripts
microrna的
2.4年前
维多利亚Perreau
•20
•2.4年前更新
瓦莱丽Obenchain
♦6.7 k
0
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1
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652
的观点
getPromoterSeq error "错误值[[3L]](cond):记录1 (1:-XXXX-XXX)被截断"
getPromoterSeq
农庄
GenomicFeatures
2.4年前
jerrywu1987
•0
1
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1
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394
的观点
从GFF3文件中提取基因结构,用于annotateWithGeneParts()
genomicfeatures
genomation
genomicranges
甲基化
注释
2.5年前
alan.g.hudson
•0
•2.5年前更新
altuna akalin
•20
0
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1
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482
的观点
从makeTxDbFromUCSC()获取小鼠基因id
GenomicFeatures
makeTxDbFromUCSC
2.5年前
warrena
•0
•2.5年前更新
shepherl
2.5 k
0
票
5
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423
的观点
使用makeTxDbFromGFF自定义BSgenome
bsgenome
genomicfeatures
2.5年前
michael.weber.1
•0
0
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1
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443
的观点
“停止密码子不能映射到外显子”
genomicfeatures
txdb
maketxdbfromgff
2.6年前
marisa.e.miller
•0
•2.5年前更新
daniel.vantwisk
•50
1
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1
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344
的观点
makeTxdbFromUCSC下载失败
maketxdbpackagefromucsc
rtracklayer
genomicfeatures
2.6年前
lalchungnungabt17
•0
•2.6年前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
0
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1
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1.1 k
的观点
TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19。knownGen安装失败-非零退出状态
软件错误
包安装
genomicfeatures
2.6年前
isultan
•0
•2.6年前更新
马丁•摩根
25 k
3.
票
1
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566
的观点
GenomicFeature如何计算3'UTR?
genomicfeatures
注释
utr
2.6年前
hxlei613
•0
•2.6年前更新
Herve页面
14 k
1
投票
3.
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736
的观点
GenomicFeatures::makeTxDbFromEnsembl创建TxDb对象失败
genomicfeatures
2.6年前
kaur.alasoo
•30
•2.6年前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
0
票
1
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503
的观点
lncRNA的TPM和FPKM
GenomicFeatures
TPM
FPKM
lncRNA
2.7年前
艾娜Hoeschele
•610年
0
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2
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480
的观点
无法在任何表中使用makeTxDbFromUCSC获取TxDb对象:
软件错误
genomicfeatures
2.8年前
rmendez
•0
•更新于2.8年前
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
1
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1
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601
的观点
安装“基因组特征”
GenomicFeatures
2.8年前
krwyaong.ju
•0
•更新于2.8年前
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
1
投票
14
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1.1 k
的观点
DEXSeq - dexseq_count.py问题
dexseq
dexseq_count
genomicfeatures
2.9年前
marija.durdevic
•0
•更新于2.8年前
危害
•0
0
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1
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370
的观点
设置PLAYRDesign会在makeTxDbFromUCSC上出错,在tableNames上出错
genomicfeatures
R
2.8年前
songshan.guo
•0
5
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5
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819
的观点
makeTxDbFromUCSC("hg19", "refGene")给出"不支持"错误
genomicfeatures
2.8年前
RJ
•20
•更新于2.8年前
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
258个结果•页面
1 / 6
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评论:如何在linux ubuntu 18中使用bioconductor和Deseq2
通过
凯文Blighe
2.4 k
你的默认R是什么?-应该是4.0.x。在错误消息之前的行中还应该有更多的文本。你能把它寄出去吗?
注释:错误:DBA对象已经从共识峰值集形成
通过
ahua217
•0
如果零峰值是它们最终能产生的,我会重新考虑是否应该生成一个关于这些的维恩图。谢谢!
注释:错误:DBA对象已经从共识峰值集形成
通过
ahua217
•0
谢谢你,斯塔克博士。下面是来自sessionInfo() > sessionInfo() R version 4.0.3(2020-10-10)平台:x86_64-apple-darwin…
评论:DESeq2中的正常化
通过
ATpoint
•400年
如果你有这样的问题(工具x如何做y),第一步总是阅读该工具所基于的论文。在这种情况下…
评论:MAST将两种条件与几个捐助者进行了比较
通过
埃
•0
你好,安德鲁,很抱歉问这个问题,但我有一个类似的情况。关于你的回答,我怎么知道有多少捐献者是…
票
答案:没有结果从plotPCA()
评论:DEseq2比较顺序
评论:DEseq2比较顺序
评论:DEseq2比较顺序
答:DEseq2比较顺序
奖
•所有
先知
来
amel.zulji
•0
受欢迎的问题
来
erwan.scaon
•10
很好的问题
来
komal.rathi
•80年
史诗的问题
来
komal.rathi
•80年
欣赏
来
马修·里奇
•960年
位置
•所有
爱尔兰共和国,
28分钟前
美国,
29分钟前
瑞士,
46分钟前
美国,
1小时前
美国华盛顿州西雅图市
1小时前
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