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农庄
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11
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10 k
的观点
DESEQ2:将注释(从数据帧)添加到DeseqDataset
deseq2.
注释
农庄
6.2年前
Darya Vanichkina
•120年
•28天前更新
MSCHMIDT.
•10
1
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3.
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77.
的观点
合并相邻的基因组段
农庄
Genomicranges.
5周前
Rahnaman.
•10
0
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4
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93.
的观点
基因信息(GRanges +序列)到GenBank
农庄
基因组范围
GenBankr.
Ensembldb.
9周前
biomiha
•20
•9周前更新
詹姆斯W.麦克唐纳
55 k
0
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1
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68
的观点
需要帮助使用复合基因组范围的置换测试重叠超级陈述
地区
农庄
绞喉
7个月前
天使梁
•0
•10周前更新
bernatgel
•130年
6
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3.
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102
的观点
我如何基于染色体(和近似区域)划分一个GRanges对象子集?
农庄
3个月前
deepue
•10
•3个月前更新
mmfansler.
•20
3.
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7
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113
的观点
GRanges/GFeatures:保留cdsByOverlaps输出中的所有父列
农庄
Genomicranges.
GenomicFeatures
cdsbyoverlaps.
DiffBind
4个月前
vanbelj.
•10
•4个月前更新
詹姆斯W.麦克唐纳
55 k
8
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10
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133
的观点
比较来自两个经纪的范围,检查另一个麦克饼的范围是否包含在另一个格里。
农庄
绞喉
6个月前
omarrafiqued
•50
•6个月前更新
詹姆斯W.麦克唐纳
55 k
2
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2
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67
的观点
如何访问对齐对象的元数据
rtracklayer.
Rsamtools
GAlignments
农庄
元数据
7个月前
罗伯特
•10
•7个月前更新
Herve页面
14 k
1
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1
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79.
的观点
Rtracklayer导出Granges对象为bigwig错误:特性不能重叠
rtracklayer.
genomicranges
农庄
8个月前
Ssabri.
•20
•8个月前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
7
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13
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229
的观点
如何使用GenomicScores提取所有蛋白编码基因和lncRNAs的phasstcons评分?
genomicscores
农庄
phastCons100way.UCSC.hg38
r
rtracklayer.
9个月前
生物学家
•90年
•9个月前更新
罗伯特Castelo
♦2.6K.
0
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6
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94.
的观点
基因组范围:寻找最接近的第一、第二和第三个基因
R
Genomicranges.
农庄
10个月前
Ssabri.
•20
•10个月前更新
戈登•史密斯
41 k
0
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1
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126
的观点
计算和绘制内容在一个平铺窗口的基因组与田庄
生物体
生物仪器
gc含量
生物过度
农庄
13个月前
Atotalamateur.
•0
•13个月前更新
Herve页面
14 k
3.
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12
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202
的观点
理解group_by reduce_ranges,
普利兰语
农庄
13个月前
Konstantinos叶尔
•40
•13个月前更新
lee.s.
•70年
4
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9
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208
的观点
使用基因组范围来获得非重叠(非冗余)区域的计数
genomicranges
农庄
grangeslist
R
15个月前
new_user6.
•0
•15个月前更新
詹姆斯W.麦克唐纳
55 k
7
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8
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4.6K.
的观点
如何从画眉山庄移出界限行
农庄
grangeslist
5.2年前
vinod.acear
•50
•17个月前更新
巴威斯
•40
3.
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10
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1.1 k
的观点
为每个基因组坐标从GRanges对象提取元数据
Genomicranges.
农庄
17个月前
罗伯特
•10
4
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2
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341
的观点
从IPO中建立GPO
genomicranges
农庄
gpo
2.2年前
麦芽德贝格
•140年
•18个月前更新
Herve页面
14 k
0
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2
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630
的观点
Genomicranges错误构建咯语
农庄
20个月前
rhooads7
•0
•20个月前更新
詹姆斯W.麦克唐纳
55 k
2
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1
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216
的观点
TxDb对象包含关于非转录活性区域的信息吗?
TxDb
农庄
BSGenome
变体注释
21个月前
jacorvar
•40
•21个月前更新
詹姆斯W.麦克唐纳
55 k
4
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1
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246
的观点
覆盖田庄的seqinfo推荐的方法是什么?
农庄
seqinfo.
import.bw
BigWigFile
rtracklayer.
21个月前
麦芽德贝格
•140年
•21个月前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
1
投票
3.
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308
的观点
获取5'上游区域到最近编码区域的坐标
r
农庄
启动子
22个月前
Eggrandio.
•0
•21个月前更新
Herve页面
14 k
2
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1
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467
的观点
创建一个矩阵以在多个调格间之间显示重叠
r
农庄
Genomicranges.
22个月前
Vinicius Henrique da Silva
•40
•22个月前更新
詹姆斯W.麦克唐纳
55 k
3.
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2
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418
的观点
如何在“ChIPseeker”包的annotatePeak中使用EnsDb
农庄
ChIPseeker
annotatepeak.
TxDb
ensdB.
22个月前
焚风
•60
•22个月前更新
约翰内斯Rainer
♦1.7K.
5
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8
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645
的观点
范围从fasta文件
生物仪器
fasta
genomicranges
农庄
22个月前
Konstantinos叶尔
•40
•22个月前更新
马丁摩根
25 k
0
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4
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291.
的观点
改变符号从Granges分数可视化负链数据
农庄
rtracklayer.
22个月前
ferbecneu
•0
•22个月前更新
詹姆斯W.麦克唐纳
55 k
3.
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12
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374
的观点
MCLAPPLY以循环在GrangeSlist对象上
Genomicranges.
农庄
格兰德莱斯列表
平行
mclapply
22个月前
焚风
•60
0
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1
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248
的观点
创建农庄对象
微阵列
minfi
Genomicratio
农庄
甲基化
23个月前
Lalchungnungabt17
•0
•23个月前更新
詹姆斯W.麦克唐纳
55 k
2
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4
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365
的观点
从TXDB.hsapiens.ucsc.hg19提取有关外显子的信息的问题.Knowngene:不正确的外显子和重叠的外显子
txdb
txdb.hsapiens.ucsc.hg19.knowngene
农庄
外显子
加州大学
2.0年前
olavur.
•10
•在2.0年前更新
詹姆斯W.麦克唐纳
55 k
0
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1
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271
的观点
如何可能覆盖GRanges类的构造函数?
genomicranges
农庄
2.0年前
Shaurya Jauhari.
•0
3.
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7
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4.7K.
的观点
非重叠的调格(或Subsoverboverlaps的相反)
农庄
genomicranges
绞喉
subsetByOverlaps
5.2年前
vinod.acear
•50
•在2.1年前更新
doublehelix31
•0
1
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2
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322
的观点
通过基因名称获得Granges对象
农庄
基因符号
IdeoViz
2.1年前
阿尔曼Shahrisa
•10
2
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4
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319
的观点
基于MCols价值的拆分经纪到格拉尔斯特
农庄
2.1年前
unamourdeswann
•10
•在2.1年前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
1
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2
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346
的观点
将AME .tsv文件分割成GRanges对象或数据帧
meme
ame
主题
dataframe
农庄
2.2年前
rbronste.
•60
•2.2年前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
2
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1
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343
的观点
GPO对象的范围内变换?
genomicranges
gpo
农庄
2.2年前
麦芽德贝格
•140年
•2.2年前更新
Herve页面
14 k
0
票
3.
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542
的观点
选择列形成一个grange对象列表
r
农庄
农庄
2.2年前
g.k
•0
2
票
2
回复
1.2 k
的观点
连接一系列的基因组范围
r
农庄
genomicranges
2.3年前
g.k
•0
•2.3年前更新
詹姆斯W.麦克唐纳
55 k
4
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8
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442
的观点
最近的基因到断点
农庄
普利兰语
2.3年前
波格丹
•610.
•2.3年前更新
戈登•史密斯
41 k
0
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1
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631
的观点
getPromoterseq错误“值中的错误[[3L]](COND):记录1(1:xxxx-xxx)被截断”
getPromoterseq.
农庄
GenomicFeatures
2.3年前
jerrywu1987
•0
5
票
9
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453
的观点
subsetByOverlaps:比较grange并将所有信息保存在元列中
农庄
bedtools
相交
2.3年前
波格丹
•610.
•2.3年前更新
lee.s.
•70年
1
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1
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288
的观点
构造子集农庄objext
农庄
子集
2.4年前
Lalchungnungabt17
•0
•2.4年前更新
詹姆斯W.麦克唐纳
55 k
0
票
7
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599
的观点
计算多个bed文件的平均得分
chip-seq
农庄
R
床上的文件
2.4年前
jinseok.
•0
•2.4年前更新
spotifywebplayer
•0
2
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1
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394
的观点
在Granges交互中重命名seqlevels时出错
interactionset
农庄
2.5年前
Vinicius Henrique da Silva
•40
•2.5年前更新
亚伦伦
♦26 k
0
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4
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566
的观点
合并基因组范围列表中的每个元素
txdb
农庄
cd
ORF.
R
2.5年前
q.thomas
•0
•2.5年前更新
詹姆斯W.麦克唐纳
55 k
0
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1
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351
的观点
探测距离最小的地点
R
genomicranges
农庄
农庄
2.7年前
g.k
•0
0
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0
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341
的观点
DEXSeq分析的元数据表
dexseq
差动同种型使用
亚型
summarizeoverlaps
农庄
2.7年前
一个
•40
1
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2
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436
的观点
检测格兰奇对象中的重叠
r
农庄
农庄
绞喉
2.7年前
g.k
•0
•2.7年前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
0
票
1
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336
的观点
R_Granges_adding合并元数据列
农庄
findoverlaps
2.8年前
Me.saichi.
•0
2
票
2
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422
的观点
功能在2kb的窗口内,但有重采样
genomicranges
农庄
slidingwindow
2.8年前
bruce01campus
•0
•2.8年前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
2
票
7
回复
523
的观点
根据字符列表拆分GRanges对象的行
农庄
grangeslist
2.8年前
stephen.williams
•10
•2.8年前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
3.
票
2
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731
的观点
不能将coverage()输出的SimpleRleList转换为grange
错误
genomicranges
农庄
rlelist
覆盖范围
2.9年前
小通.Yao23
•10
•2.9年前更新
Herve页面
14 k
195结果•页面
4中的1个
最近……
回复
注释:矩阵数据集的差异表达式分析错误
通过
迈克尔的爱
31 k
您可以从RSEM中四舍五入估计的计数并提供给DESeqDataSetFromMatrix。我没有从T导入汇总数据的代码…
注释:矩阵数据集的差异表达式分析错误
通过
didemdkn
•0
谢谢你的帮助。但是,我没有RSEM输出文件。我刚下载了TCGA-BRCA学习的3级数据,我只有......
答案:使用BiocManager安装::Install()在docker容器中不起作用
通过
马丁摩根
25 k
这些消息表明你是在一个'代理'或'防火墙'后面,你需要遵循的指令在"设置代理" secti…
注释:cnetplot(中化plot)的颜色刻度不是居中为0,偏向正负
通过
Guido Hooiveld.
♦2.8K.
所以如果我理解正确,你对默认的颜色渐变`cnetplot`不满意(即蓝白红色),而是希望......
答案:矩阵不是全级别(时间序列实验与一个组和协变量)
通过
迈克尔的爱
31 k
链接到我刚才在另一篇文章上的回答:https://support.bioconductor.org/p/97705/#p133790
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答案:读取读取压缩文件时的误导错误
答案:读取读取压缩文件时的误导错误
使用元素列表从hg38检索相同GC内容和长度的区域
使用元素列表从hg38检索相同GC内容和长度的区域
C: clusterProfiler -在dotplo中基因的生成和nb总是呈正相关的
奖
•所有
先知
来
heikki.sarin
•0
欣赏
来
托马斯·杰克
♦1.7K.
很好的问题
来
珍妮Drnevich
♦2.0K.
学生
来
珍妮Drnevich
♦2.0K.
很好的问题
来
svlachavas.
•760年
地点
•所有
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