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83
的观点
微阵列非基阵的DEG分析
度
9个月前
sheikhbeigali
•0
•9个月前更新
凯文Blighe
2.4 k
1
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3.
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87
的观点
DESeq2 -控制其他变量
deseq2
度
协变量
研究设计
变量
11个月前
Yonatan Amzaleg
•0
•11个月前更新
迈克尔的爱
31 k
4
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5
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195
的观点
所有基因在limma后topTable结果均呈现正的折叠变化
limma
微阵列
foldchange
度
地理
11个月前
彼得罗
•30
•11个月前更新
戈登•史密斯
42 k
0
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2
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86
的观点
同样的结果改变对比函数
deseq2
对比
度
14个月前
ire.ontiveros
•0
•14个月前更新
迈克尔的爱
31 k
0
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4
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188
的观点
多因素DESeq2分析
DESeq2
度
multiplefactors
deseq2
15个月前
yura.song
•0
•15个月前更新
史蒂夫Lianoglou
13 k
2
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6
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205
的观点
在edgeR中“添加基因注释”不使用select()
刨边机
度
15个月前
mjavad2012
•0
•15个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
1
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2
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294
的观点
时间序列数据和两个层次(对照和处理)的成对Limma分析
limma
微阵列
时间序列
度
配对
16个月前
kawess
•0
•16个月前更新
戈登•史密斯
42 k
0
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0
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168
的观点
实验组与对照组的DEG比较
桅杆
度
批处理的影响
16个月前
chendianyu
•0
0
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2
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167
的观点
通过limma寻找DEG的不同设计
limma
度
设计
17个月前
amin.ghareyazi
•0
1
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1
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129
的观点
区域样本间的RNASeq微分表达式
R
deseq2
度
17个月前
ecg1g15
•0
•17个月前更新
迈克尔的爱
31 k
5
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13
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390
的观点
DESeq2多组比较(ANOVA)具有批处理效应
DESeq2
度
方差分析
批处理效果
比较
17个月前
amin.ghareyazi
•0
•17个月前更新
迈克尔的爱
31 k
0
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8
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223
的观点
自定义后归一化计数来自DESeq2
度
deseq2
协变量
20个月前
sum732
•0
•20个月前更新
迈克尔的爱
31 k
1
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7
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750
的观点
limma -多级实验-时间课程数据
limma
limma轰
rnaseq_analysis
度
2.8年前•更新于22个月前
SPbeginner
•0
1
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5
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335
的观点
担忧计数:DESeq2: deg来自不同群体的基因,多数为零
deseq2
德
度
23个月前
hermanapis
•0
•23个月前更新
迈克尔的爱
31 k
1
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4
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469
的观点
TMM归一化的含义和可能的替代方案
刨边机
TMM
度
归一化
2.1年前
rproendo
•0
•2.1年前更新
戈登•史密斯
42 k
2
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3.
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900
的观点
为什么我的limma DEG结果在top Table都没有显著意义,显示logFC <1.5或logFC>-1.5 ?
limma
toptable
度
logfc
2.4年前
生物医学
•0
•2.4年前更新
戈登•史密斯
42 k
0
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0
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473
的观点
舞会礼服数据处理错误
舞会礼服
Stringtie
度
rnaseq
2.7年前
vharshavardhanan
•0
0
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3.
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722
的观点
读取舞会礼服对象时出现错误和警告消息
软件错误
illumina公司
度
舞会礼服
燕尾服
2.8年前
amy16
•0
•更新于2.8年前
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
6
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14
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1.1 k
的观点
在FireBrowse中使用TCGA数据查找DEG时遇到困难
, TCGA
FireBrowse
limma
度
2.8年前
lawarde.ankita1
•20
•更新于2.8年前
svlachavas
•770年
1
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0
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591
的观点
topGO (Version: 2.30.1) - weight01算法
topgo
基因本体论
路径分析
rnaseq
度
2.9年前
digrigor
•10
0
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0
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635
的观点
利用层次聚类中的子聚类方法制作基因表达数据的热图
heatmap.2
分层聚类
微阵列
RNA seq
度
3.0年前
lawarde.ankita1
•20
0
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4
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517
的观点
我是在差异表达基因分析之前还是之后映射探针到基因符号?
limma
度
微阵列
3.3年前
JackieMe
•0
•3.3年前更新
戈登•史密斯
42 k
0
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1
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608
的观点
RNA-Seq DEG分析问题
rnaseq
度
3.4年前
mullin.yu
•0
•3.4年前更新
戈登•史密斯
42 k
11
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15
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1.3 k
的观点
edgeR - MDS计数数据图
刨边机
度
mds
情节
3.4年前
baus87
•0
4
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7
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1.7 k
的观点
用于分析微阵列数据集的limma的替代包
limma
微阵列
度
3.7年前
马克西米利安
•10
•3.7年前更新
贝恩德•克劳斯
•590年
2
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2
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543
的观点
FDR学位分数
罗斯福
度
3.7年前
nia
•20
•3.7年前更新
svlachavas
•770年
2
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3.
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701
的观点
使用R进行上下调节的Degs代码
limma
度
3.8年前
nia
•20
3.
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2
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797
的观点
limma法DEG分析
度
Limma
4.1年前
、Sarhadi
•20
•4.1年前更新
亚伦Lun
♦26 k
4
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7
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591
的观点
化学敏感与耐药的limma DEG分析
limma
微阵列
度
4.1年前
、Sarhadi
•20
•4.1年前更新
史蒂夫Lianoglou
13 k
0
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2
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536
的观点
过滤数据集与未过滤数据集limmas toptable函数两个输出的比较
limma
taptable
度
4.8年前
、Sarhadi
•20
5
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12
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924
的观点
线性建模和经验贝叶斯步骤前的滤波
度
Limma
过滤
4.9年前
、Sarhadi
•20
•4.8年前更新
莱恩·c·汤普森
7.6 k
0
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3.
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622
的观点
与limma密切相关的两种条件的DEG试验
limma
度
4.9年前
、Sarhadi
•20
•4.9年前更新
亚伦Lun
♦26 k
2
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4
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748
的观点
一种合理选择GSEA中p值显著的DEG数的方法
GSEA
度
4.9年前
、Sarhadi
•20
•4.9年前更新
戈登•史密斯
42 k
3.
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4
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1.9 k
的观点
选择差异表达基因的R脚本
limma
微阵列
affy
度
5.4年前
contato.carlosbau
•10
3.
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3.
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4.4 k
的观点
从RNA-seq中找到DEG:如果只有RPKM数据怎么办?
度
rna-seq
rpkm
5.9年前
悦赵
•0
•5.9年前更新
b.nota
•340年
35个结果•页面
1 / 1
最近……
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注释:在edgeR中计算logFC
通过
凯文Blighe
2.4 k
链接到重复的帖子:https://support.bioconductor.org/p/p134430/#p134430
备注:在edgeR中计算logCPM
通过
凯文Blighe
2.4 k
链接到重复的帖子:https://support.bioconductor.org/p/p134418/#p134418
备注:从ENST到eng
通过
suxxa
•20
我瞎了,对不起……非常感谢!
评论:使用ChIPSeqSpike将ChIPSeq实验与输入相减的问题
通过
nicolas.descostes
•0
你在研究什么生物?
点评:singlecelexperiment的质量控制
通过
1498554536
•0
我很高兴你解决了第一个问题。我想你只是收到了警告信息。我认为这无关紧要。这种信息很常见。T…
票
答:在edgeR中计算logCPM
备注:从ENST到eng
备注:从ENST到eng
备注:从ENST到eng
答:从ENST到ENSG
奖
•所有
受欢迎的问题
来
erwan.scaon
•10
很好的问题
来
komal.rathi
•80年
史诗的问题
来
komal.rathi
•80年
欣赏
来
马修·里奇
•950年
受欢迎的问题
来
s.munster
•40
位置
•所有
爱尔兰共和国,
5分钟前
美国,
7分钟前
新德里,
40分钟前
意大利,
56分钟前
海德堡EMBL / de.NBI,
1小时前
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