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批处理效应
•
重置
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114
视图
解决多因素实验中的批处理效应
EDGER
批处理效应
rnaseq
8周前
Anikng
•0
•6周前更新
萨姆格
•250
1
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3
答复
96
视图
Limma:具有两个批处理效果,位置和批次的差分表达。
重复关系
批处理效应
林玛
科菲特
8周前
凯瑟琳
•0
•8周前更新
戈登·史密斯(Gordon Smyth)
41k
0
投票
1
回复
56
视图
林玛:正确的位置和批处理效果
林玛
批处理效应
重复关系
堵塞
批
8周前
凯瑟琳
•0
•8周前更新
凯文·布莱(Kevin Blighe)
2.3k
0
投票
2
答复
92
视图
提取鼠标的某些亚群
MousegastrulationData
正常化
批处理效应
9周前
xyang2
•120
•9周前更新
乔纳森·格里菲斯(Jonathan Griffiths)
•30
1
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1
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100
视图
结合治疗和控制批次进行分析
scrnaseq
scrna
Batchelor
批处理效应
9周前
阿德里安
•0
•9周前更新
亚伦·伦
♦26K
1
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1
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67
视图
DESEQ2批处理效果
批处理效应
deseq2
rnaseq
10周前
伊戈尔
•40
•10周前更新
迈克尔·洛夫
31k
0
投票
0
答复
35
视图
创建具有多个数据集和多个集成的稳定批处理校正的SCRNA-SEQ数据
评分
Singlecell
斯克兰
批处理效应
11周前
hamza_karakurt
•50
2
投票
4
答复
667
视图
差异分析的EDGER和批处理效果校正
EDGER
林玛
r
rnaseq
批处理效应
20个月前
M93
•0
•20个月前更新
詹姆斯·W·麦克唐纳
56k
0
投票
6
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401
视图
在使用表达数据进行聚类之前,EDGER删除批处理效果
EDGER
r
批处理效应
聚类
remove batcheffect
20个月前
生物学家
•90
•20个月前更新
詹姆斯·W·麦克唐纳
56k
1
投票
5
答复
339
视图
小组特定条件查询
deseq2
deseq
批处理效应
2.4年前
BDY8
•0
•2。4年前更新
迈克尔·洛夫
31k
4
投票
10
答复
812
视图
主题:批处理效果产生的VOOM曲线中的奇怪故障
林玛
VOOM
批处理效应
协变量
3.7年前
RAF4
•20
•3。7年前更新
戈登·史密斯(Gordon Smyth)
41k
3
投票
6
答复
840
视图
在这种情况下是否有必要检查批处理效果?以及如何?
svaseq
战斗SVA
拉塞克
批处理效应
remove batcheffect
4.3年前
Amoltej
•10
•4。3年前更新
雅库布
•30
6
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4
答复
2.7k
视图
合并不同的数据集并在Limma中执行差异表达分析
暗示
批处理效应
林玛
差异基因表达
生物导体
5.5年前
Svlachavas
•770
•5。5年前更新
亚伦·伦
♦26K
3
投票
6
答复
2.3k
视图
RNASEQ多因素实验Limma设计具有患者和批处理效果
林玛
rnaseq
批处理效应
6.2年前
cfreije
•10
•5。6年前更新
罗伯特·莫恩
•0
2
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3
答复
2.0k
视图
Limma中有关多因素设计和可能的批处理效果校正的问题
林玛
批处理效应
批处理校正
多因素设计
5.7年前
Svlachavas
•770
•5。7年前更新
詹姆斯·W·麦克唐纳
56k
1
投票
5
答复
897
视图
适当合并同一数组的批处理以创建最终的总表达式集
FRMA
生物导体
批处理效应
priperview
暗示
5.8年前
Svlachavas
•770
•5。8年前更新
马修·麦考尔
•830
2
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1
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1.0k
视图
EDGER:对成对分析中的批处理效果进行核算
配对
批处理效应
6.0年前
Cinderelliedoll
•0
•6。10年前更新
戈登·史密斯(Gordon Smyth)
41k
0
投票
0
答复
736
视图
来自virtualArray示例的分位数无批处理效果删除都是相同的
微阵列
批处理效应
HGU133PLUS2
HGUG4112A
VirtualArray
微阵列
批处理效应
HGUG4112A
7.8年前
丹尼尔·埃姆登(Daniel Emden)
•10
18结果•页面
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最近的 ...
答复
评论:deseq2和log2折叠的收缩更改
经过
迈克尔·洛夫
31k
您的意思是FDR界的集合增加?当前版本的DESEQ2中的收缩方法不会更改FDR(`padj colum…
答案:比较结果在分数和差异方面有所不同
经过
Shangguandong1996
•20
我知道在较新的difbind版本中,`score'参数的默认值不同,因此我发布了较新的difbind版本结果。``图书馆(…
答案:conc_1在differnet dba中。报告结果略有不同
经过
Shangguandong1996
•20
对于较新的diffbind版本``````库库(difbind)库(bioCparallel)库(dplyr)tamoxifen <-dba(samplesheet =“ tamoxifen.csv”)ta…
评论:conc_1在differnet dba中。报告结果略有不同
经过
Shangguandong1996
•20
嗨,史塔克(Stark)博士,我发现您修复了链接,我想使用测试数据来重现我的问题``````````````````biocpara''库库(diffbind)库
评论:deseq2和log2折叠的收缩更改
经过
较大
•0
一个问题与此有关。在使用Schrinkage(在我的miRNA-Seq数据集中)的情况下,SDE miRNA(FDR)的数量会增加WIT…
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答:对RT PCR实验数据进行差异基因分析
答:对RT PCR实验数据进行差异基因分析
评论:DESEQ2:0与20个计数比较中的重要PADJ和LFC?
答:使用富集res的clusterprofiler / renichplot的绘图函数
评论:DESEQ2:0与20个计数比较中的重要PADJ和LFC?
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美国,
38分钟前
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