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AnnotationDbi
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93
的观点
DE基因的基因本体分析
clusterProfiler
AnnotationDbi
OrgDb
goseq
4天前
vanbelj
•10
•3天前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
11
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12
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239
的观点
从ENST到ENSG
AnnotationDbi
5天前•12小时前更新
suxxa
•20
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61
的观点
如何使用select()检索GO生物过程祖先?
GO.db
AnnotationDbi
6天前
圭多Hooiveld
♦2.9 k
•5天前更新
马丁•摩根
25 k
4
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88
的观点
包含多余符号基因的智人有机体集合?
AnnotationDbi
EnsDb。Hsapiens
org.Hs.eg.db
25天前
bastien_chassagnol
•0
•13天前更新
约翰内斯Rainer
♦1.8 k
5
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155
的观点
复制ENTREZID基因注释org.Hs.eg.db
ENTREZID
象征
AnnotationDbi
org.Hs.eg.db
25天前
bastien_chassagnol
•0
•24天前更新
戈登•史密斯
42 k
3.
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175
的观点
基因组构建38
AnnotationDbi
org.Hs.eg.db
7周前•6周前更新
蔓
•0
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104
的观点
将Refseq蛋白id转换为UniProt id
AnnotationDbi
7周前
sgupt46
•0
4
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108
的观点
使用AnnotationDbi从SYMBOL到ENTREZ的基因转换不会转换某些基因
AnnotationDbi
org.Hs.eg.db
9周前
伊米莉亚
•30
0
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7
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647
的观点
注释dbi错误:无法为签名“字符”找到函数“选择”的继承方法。
AnnotationDbi
6个月前
hina.abbas.bandukwala
•0
•6个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
0
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4
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138
的观点
许多基因注释错误(TSS/TTS): keytype="GENEID" with mapIds(TxDb.Mmusculus.UCSC.mm10.knownGene)
AnnotationDbi
注释
TxDb.Mmusculus.UCSC.mm10.knownGene
7个月前
94133
•0
•7个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
4
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5
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174
的观点
makeOrgPackage - ERROR:源DB中的两个字段具有相同的名称
软件错误
AnnotationForge
AnnotationDbi
8个月前
jdiaz
•0
•8个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
1
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5
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110
的观点
org.Mm.eg.db是否更新到mus musculus版本99?
org.Mm.eg.db
AnnotationDbi
9个月前
kavator
•20
0
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1
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53
的观点
安装“DBI”和“AnnotationDbi”后,安装“org.hs.eg.db”时,AnnotationDbi依赖包仍然不可用
org.hs.eg.db
AnnotationDbi
10个月前
1287420667
•0
•10个月前更新
马丁•摩根
25 k
0
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4
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74
的观点
当使用AnnotationDbi包时,
基因本体
去
注释
annotationdbi
10个月前
CUCIO199
•0
3.
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10
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151
的观点
org.Sc.sgd.db包中的数据不一致
org.Sc.sgd.db
AnnotationDbi
12个月前
felix.gm.ernst
•0
•12个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
0
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2
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67
的观点
.deriveTableNameFromField(field = keytype, x)中的makeOrgPackage错误:源DB中的两个字段具有相同的名称
软件错误
去
AnnotationForge
AnnotationDbi
12个月前
tzaquin
•0
•12个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
0
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3.
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156
的观点
没有一个基因或化合物映射到通路上!
pathview
AnnotationDbi
16个月前
kevinvdburg
•0
•16个月前更新
迈克尔的爱
31 k
2
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3.
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263
的观点
tximport::summarizeToGene忽略retxversion失败
tximport
tximeta
AnnotationDbi
19个月前
便雅悯
•0
1
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1
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203
的观点
OrgDb (Salmo salar;[["AH66207"]]])只是NCBI基因数量的一半?!
Annotationhub
Annotationdb
分析器
annotationdbi
21个月前
wecai
•0
4
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5
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370
的观点
使用TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene中的mapIds从ENSEMBL/SYMBOL键中获取CDSCHROM值
运用
cdschrom
org.Hs.eg.db
AnnotationDbi
SingleCellExperiment
22个月前
kushshah
•10
•22个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
0
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5
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343
的观点
hyperGTest不能在自定义注释包上工作
GOstats
AnnotationDbi
GO.db
23个月前
lucas.michel
•0
•23个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
2
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2
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981
的观点
在R(3.5.2版本)中安装org.Hs.eg.db包失败
org.Hs.eg.db
AnnotationDbi
23个月前
biojun
•0
•23个月前更新
马丁•摩根
25 k
1
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9
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349
的观点
AnnotationDbi:选择-连接顺序
AnnotationDbi
24个月前•23个月前更新
faustfrankenstein
•0
3.
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4
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907
的观点
DGE矩阵标注
DGE
DESeq2
AnnotationDbi
2.3年前
maxininfa
•0
•2.3年前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
1
投票
2
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351
的观点
SYMBOL不是官方的MGI基因符号吗?
org.mm.eg.db
annotationdbi
2.5年前
brendan.innes
•10
•2.5年前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
5
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11
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601
的观点
BioMart中关于基因注释的错误
biomart
AnnotationDbi
2.6年前
波格丹
•610年
•2.6年前更新
daniel.vantwisk
•50
3.
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6
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507
的观点
使用AnnotationDBI mapIDs将集成id注释为基因符号的问题
注释
运用
annotationdbi
2.6年前
vd4mmind
•0
3.
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5
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581
的观点
GO.db安装失败(MacOS, AnnotationDbi, R3.5.0)
去
bioclite
R3.5
MAC OS x
annotationdbi
2.7年前
Jens Preussner
•30
•2.7年前更新
马丁•摩根
25 k
1
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1
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346
的观点
蛋白质网络数据结构的建议
AnnotationDbi
Bimap
Interactome
2.7年前
达里奥Strbenac
♦1.5 k
0
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3.
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557
的观点
如何产生一个有唯一ENTREZID的数据帧在gage中使用?
计
annotationdbi
可以
运用
3.0年前
colaneri
•30
2
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2
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1.5 k
的观点
使用AnnotationDbi的问题
annotationdbi
bioconductor
3.0年前
h72ghorashi
•0
1
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3.
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496
的观点
由toTable和annotateEset函数提供的不同微阵列注释
微阵列
注释
annotationdbi
affycoretools
annotationtools
3.1年前
eleonoregravier
•60
•3.1年前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
1
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4
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1.4 k
的观点
Ubuntu 17.10的biocLite更新问题
ubuntu
biocgenerics
s4vectors
IRanges
annotationdbi
3.1年前
热泪盈眶
•0
•3.1年前更新
马丁•摩根
25 k
5
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3.
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1.9 k
的观点
是否可以用ENSEMBL id和Homo.sapiens/ muss .musculus标记线粒体基因?
homo.sapiens
annotationdbi
3.2年前
Shian苏
•40
•3.2年前更新
约翰内斯Rainer
♦1.8 k
2
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3.
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1.5 k
的观点
org.Mm.eg.db mm9版本的ChIPpeakAnno getEnrichedGO函数
chippeakanno
annotationdbi
5.3年前
Yi-Fang。王
•0
•3.3年前更新
jun.yu
•0
8
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12
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1.4 k
的观点
如何创建tx2gene data.frame时,没有TxDb对象为您正在工作的生物。
tximport
deseq2
annotationdbi
3.4年前
prab4th
•0
•3.4年前更新
约翰内斯Rainer
♦1.8 k
4
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1
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710
的观点
检索所有相关基因
去
R
annotationdbi
biomart
3.4年前
石头
•40
•3.4年前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
0
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1
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633
的观点
注释dbi错误GO项
去
annotationdbi
3.4年前
石头
•40
•3.4年前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
1
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3.
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1.4 k
的观点
注释基因计数
注释
RNASeq
annotationdbi
3.5年前
亚历山德拉
•0
•3.5年前更新
迈克尔的爱
31 k
0
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7
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740
的观点
oligo和GenericPDInfo
affy
oligoclasses
益生元包
pdinfobuilder
annotationdbi
3.5年前
Aedin Culhane
•510年
•3.5年前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
3.
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1
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3.6 k
的观点
寻找同源人/小鼠ENSEMBL id
人类
鼠标
运用
annotationdbi
同系物
3.6年前
基斯Hughitt
•130年
5
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6
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734
的观点
mapId应该连接multival吗?
annotationdbi
ensembldb
3.7年前
史蒂夫Lianoglou
13 k
•3.7年前更新
约翰内斯Rainer
♦1.8 k
0
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3.
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1.7 k
的观点
错误:依赖项“AnnotationDbi”对包“GO.db”不可用
bioconductor
R
go.db
annotationdbi
依赖
3.9年前
埃塞俄比亚人。妈
•0
0
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0
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595
的观点
创建自定义的“系统生物学”注释包-类未找到
AnnotationDb
annotationdbi
AnnotationForge
4.0年前
罗兰Cougnaud
•20
0
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12
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1.8 k
的观点
简单的方法把OrgDb对象从AnnotationHub到包?
AnnotationHub
AnnotationDbi
AnnotationForge
pathview
4.0年前
珍妮Drnevich
♦2.0 k
•4.0年前更新
瓦莱丽Obenchain
♦6.7 k
1
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2
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682
的观点
编程下载正确的全基因组注释包为给定的生物/组装
annotationdbi
organismdbi
4.1年前
s1437643
•10
•4.1年前更新
约翰内斯Rainer
♦1.8 k
4
票
8
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2.3 k
的观点
使用AnnotationDbi mapIds注释DEseq输出,大多数结果说NA
AnnotationDbi
mapIds
org.Mm.eg.db
ENSEMBLTRANS
4.1年前
迈克
•10
•4.1年前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
3.
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5
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710
的观点
从react .db中选择几个id
annotationdbi
reactome.db
错误
4.1年前
Lluís雷维拉·桑丘
•610年
•4.1年前更新
马丁•摩根
25 k
3.
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5
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1.5 k
的观点
TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19地图。knownGene TXID键到ENSEMBL转录本ID或Refseq ID
annotationdbi
4.1年前
goldberg.jm
•10
•4.1年前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
1
投票
3.
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512
的观点
makeOrgPackage访问RefSeq表时出现问题
annotationdbi
4.3年前
费边克
•20
•4.3年前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
159个结果•页面
1 / 4
最近……
回复
备注:在DiffBind中,比较结果score和Conc不同
通过
shangguandong1996
•20
谢谢Stark博士,我会尽力的:)
答案:为什么我的p值缩水(GWAS)?
通过
安娜
•0
同样值得注意的是,你的样本量非常小,这并不一定会导致这个qq图,但这是一个更普遍的问题……
评论:DESeq2对Log2FoldChange的异常高估计
通过
迈克尔的爱
31 k
由' plotCounts '返回的值有一个伪计数添加,而GLM不使用伪计数再次,这里没有一个错误。如果你……
评论:DESeq2对Log2FoldChange的异常高估计
通过
swbarnes2
•620年
你怎么能算一半呢?0比任何数都很大。至于排除他们……在……方面有区别。
答案:DESeq2异常高估计Log2FoldChange
通过
hugo.denis
•0
您好,非常感谢您的回答。根据设计,我对log2FoldChange计算的假设是m…
票
答案:DESeq2异常高估计Log2FoldChange
评论:为什么在AnnotationHub中没有一些其他生物的Uniprot信息?
注释:DiffBind安装失败:错误:包' BiocGenerics ' 0.34.0被加载,但是
注释:DiffBind安装失败:错误:包' BiocGenerics ' 0.34.0被加载,但是
答:一组与另外两组比较,采用LRT检验(伪体法)
奖
•所有
先知
来
amel.zulji
•0
受欢迎的问题
来
erwan.scaon
•10
很好的问题
来
komal.rathi
•80年
史诗的问题
来
komal.rathi
•80年
欣赏
来
马修·里奇
•960年
位置
•所有
海边的城市,
32分钟前
美国,
2小时前
澳大利亚,
3小时前
WEHI,澳大利亚墨尔本,
3小时前
海德堡EMBL / de.NBI,
4小时前
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