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76
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BiomaRt转换
biomaRt
28天前•4天前更新
gwendal.lazennec
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31
的观点
如何自己构造一个snplocs类
BSgenome
SNPlocs
4天前
shangguandong1996
▴20
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72
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CRISPRseek套餐:5 ' PAM?
CRISPRseek
7天前•4天前更新
nderian
•0
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68
的观点
NChannelSet——> set /expressionSet ?如何转换?
ExpressionData
ArrayExpress
4天前更新
戈登•史密斯
42k•6天前写的
Gero
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58
的观点
微阵列:构建HT MG430PM affymetrix注释
AffymetrixChip
微阵列
affymetrix
5天前更新
圭多Hooiveld
★2.9k•写于5天前by
Pierre-Alex
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84
的观点
如何将多次试验和后续处理的数据保存在单个汇总的实验对象中
SummarizedExperiment
4天前更新
劳伦特与
1.5k•6天前写的
rohitsatyam102
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237
的观点
工作:
生物信息学实验室主任,WEHI,澳大利亚墨尔本
澳大利亚
支持,
6天前•5天前更新
戈登•史密斯
42 k
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71
的观点
Limma实验设计与对比
limma
methylationArrayAnalysis
6天前
Kesava
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70
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RSamtools idxstats不返回未映射的读取
Rsamtools
7天前•6天前更新
mja18
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74
的观点
RSamtools idxstatsam不能使用远程bam文件
Rsamtools
7天前
mja18
▴40
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37
的观点
运行>每组100个样本-内存问题
xcms
内存
findchrompeaks
7天前
abrsoule
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36
的观点
篮球选手consensusClustersDESeq2 ()
篮球选手
7天前
MatteoP
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34
的观点
CAGEexp vs CAGErseq
篮球选手
7天前
MatteoP
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47
的观点
检索基因描述与集成bldb
biomaRt
ensembldb
AnnotationData
7天前更新
约翰内斯Rainer
★1.9k•写于7天前by
António Miguel de Jesus Domingues
▴480
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67
的观点
离群值
离群值
Deseq2
7天前
nolwenn
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31
的观点
为UTRs设置颜色
情节
颜色
Gviz
utr
7天前
ginlucks
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42
的观点
错误的阅读。使用multicluster的表函数
multiClust
7天前更新
凯文Blighe
2.8k•写于8天前by
Debashis
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47
的观点
日志转换的eset
codelink
7天前更新
凯文Blighe
2.8k•写于7天前by
Yuxiii
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126
的观点
关于差异基因表达分析的疑问
limma
刨边机
DESeq2
8天前•7天前更新
abhisekdey061
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139
的观点
TCGA数据分析
RSEM
8天前•7天前更新
莉莉
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294
的观点
在DESeq2中如何设置样本设计
DESeq2
7周前写的
dequattro.concetta
▴10
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49
的观点
色散参数的范围值(a1, alpha 0和sigmad)
聚酯
分散
更新1天前by
迈克尔的爱
32k•写于8天前
catalina.gonzalez-gomez
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84
的观点
BSGenome锻造非模式生物
BSGenomeForge
BSGenome
7天前更新
Herve页面
•写于9天前by
sieminsk
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107
的观点
使用ximeta发布加载数据
tximeta
8天前更新
凯文Blighe
2.8k•写于10天前
dshres
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107
的观点
在做共表达网络分析时,我得到一个错误
RNASeqData
9天前•8天前更新
Rishav
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57
的观点
conumee(用于EPIC):没有为所有探测指定查询强度
IlluminaHumanMethylationEPICmanifest
minfi
conumee
7天前更新
王Yibo
•0•写于9天前by
theresa.walder
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101
的观点
isSecondaryAlignment=FALSE与BWA MEM映射的BAM文件不工作?
bwa
Rsamtools
9天前•8天前更新
sbcn
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190
的观点
数据归一化
DESeq2
归一化
9天前•8天前更新
nolwenn
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48
的观点
Deseq2错误" error in designAndArgChecker"
DESeq2
9天前更新
迈克尔的爱
32k•写于9天前by
polaxgr
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73
的观点
DiffBind没有使用DESeq2 MLE估计褶皱变化
DiffBind
9天前更新
罗里斯塔克
★3.8k•写于11天前by
山姆
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60
的观点
当我使用edgeR如何我可以转换。txt文件和。tabular文件到。rdata文件?请提供一个代码来完成这个过程。
刨边机
9天前更新
戈登•史密斯
•写于9天前
abhisekdey061
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83
的观点
我如何建立一个对比矩阵在edgeR与makeContrasts,当相关水平下降?
刨边机
RNASeq
9天前更新
戈登•史密斯
•写于9天前
瑞安
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69
的观点
我想使用全局测试。
基因
r
凯
rpy
globaltest
10天前•9天前更新
金
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128
的观点
DiffBind的结果与DESeq2(来自DiffBind)检索到的相同结果之间的不匹配
DiffBind
10天前更新
罗里斯塔克
★3.8k•写于26天前by
山姆
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42
的观点
运行ViSEAGO与结果fora
ViSEAGO
10天前
tim.meese
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129
的观点
EPIC阵列单复制管道?
minfi
methylationArrayAnalysis
11天前•8天前更新
伞形花耳草
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81
的观点
放大时,Gviz feature注释消失
Gviz
7天前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
•10天前写的
svenbioinf
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57
的观点
无法在NCBI的.gff文件上使用ensembldb的"ensDbFromGff()"函数
ensembldb
RNASeq
10天前•9天前更新
Torkel
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56
的观点
不同的基因使用相同的方法
DESeq2
10天前
menuka
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64
的观点
champ.SVD(): Error in while (step == 0) {: missing value where TRUE/FALSE needed
methylationArrayAnalysis
EPICarray
冠军
冠军。圣言会
10天前•7天前更新
arisarkar88
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129
的观点
当我试图通过limma移除非差异表达基因时,我得到了一个警告
RNASeqData
10天前更新
戈登•史密斯
•10天前写的
Rishav
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42
的观点
解码包在dada2 -实现Silva_metaxa2训练集从qza文件到fastq.gz/.Rdata
解读
dada2
10天前
anrongloh
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52
的观点
错误生成计数df使用DRIMSeq/DEXseq
DRIMSeq
DEXSeq
11天前
jbono
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123
的观点
错误与hclust
系统树图
hclust
textanalysis
R
RStudio
11天前•8天前更新
艾比
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44
的观点
新闻:
用户句柄更改站点
Bioconductor
处理
11天前
natay.aberra
10
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160
的观点
读取连接时出错(url(con)))
TCGAbiolinks
11天前•4天前更新
xiaofeiwang18266
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55
的观点
新闻:
更新BiocFileCache、AnnotationHub和ExperimentHub
BiocFileCache
AnnotationHub
ExperimentHub
缓存
11天前•9天前更新
shepherl
2.6 k
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38
的观点
用conumee总结CNV图
conumee
11天前
melpag
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41
的观点
在不考虑批量效应的情况下应用exomeCopy调用CNVs
exomeCopy
CNV
韦斯
11天前
程
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3.
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74
的观点
estimateDisp, glmQLFit和glmQLFTest如何处理我的TMM规范化读计数矩阵?
刨边机
glmQLFTest
glmQLFit
estimateDisp
11天前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
•写于11天前
朱塞佩
•0
40,562个结果•页
812年2
最近……
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备注:在受试者设计之间和设计内批改
通过
迈克尔的爱
32 k
在软件问题方面,我没有更多的建议。
备注:在受试者设计之间和设计内批改
通过
demisa
•0
我理解你的观点并同意你的观点。但是当我使用1/10的样本进行配对分析时,我得到了1000个带有p0.01的DEGs…
备注:在受试者设计之间和设计内批改
通过
迈克尔的爱
32 k
抱歉,我错过了你最初的帖子中的那部分。好吧,我猜你可能在意义的边缘与100,并加上所有的…
备注:在受试者设计之间和设计内批改
通过
demisa
•0
我完全同意。但当我不做配对分析时,我使用了简单的~批处理+条件模型,功率很好。我由罗斯福和…
备注:在受试者设计之间和设计内批改
通过
迈克尔的爱
32 k
数据集中没有大的变化。你不能拒绝这些基因的零值。你可以和统计学家讨论一下…
票
注释:CBioportal R-workshop示例2提示错误
注释:.onLoad failed in loadNamespace() for 'org.Hs.eg.db'
注释:.onLoad failed in loadNamespace() for 'org.Hs.eg.db'
备注:在受试者设计之间和设计内批改
答案:使用或不使用子矩阵的plotMA差异
奖
•所有
学者
来
迈克尔的爱
32 k
学者
来
肖恩·戴维斯
21日k
评论员
来
Herve页面
14 k
老师
来
kevin.rue
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学者
来
凯文Blighe
2.8 k
位置
•所有
澳大利亚墨尔本,Walter and Eliza Hall医学研究所,
7分钟前
WEHI,墨尔本,澳大利亚,
12分钟前
美国,
32分钟前
巴西,
45分钟前
美国,
45分钟前
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