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农庄
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330
的观点
强制Granges从空数据。frame ==>意外的行为??
农庄
强迫
3.0年前
马尔科姆。库克
♦1.5 k
0
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1
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418
的观点
不一致的警告:grange出界
cn.mops
农庄
修剪
Genomicranges-method
3.0年前
znl207
•0
0
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2
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347
的观点
发布psetdiff函数后的元数据检索
grangeslist
农庄
3.0年前
andreag1987
•0
1
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3.
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686
的观点
如何用ensembldb获取内含子。包吗?
农庄
ensembldb
GenomicFeatures
3.0年前
alessandro.pastore
•20
2
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3.
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493
的观点
GRanges对象来自基因列表
农庄
床上
genomicranges
genomeintervals
deseq2
3.0年前
rbronste
•60
2
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4
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634
的观点
围绕TSS制作窗口,并从指定窗口的箱子的另一个data.frame中获取值
R
农庄
genomicranges
chipseq
3.1年前
ssabri
•20
•3.1年前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
0
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6
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673
的观点
为granges对象添加列,在范围内求和得分
R
Grang
r
农庄
rtracklayer
3.1年前
ssabri
•20
•3.1年前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
2
票
2
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463
的观点
使用rangedsummarizeexperiment对象的包
rangedsummarizedexperiment
包
农庄
iranges
3.1年前
rbronste
•60
•3.1年前更新
亚伦Lun
♦26 k
0
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6
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1.8 k
的观点
GRanges::distanceToNearest不会返回距离到最近的位置
农庄
genomicranges
3.2年前
丹尼尔·卡梅隆
•20
•3.1年前更新
瓦莱丽Obenchain
♦6.7 k
2
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5
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502
的观点
没有给出最近的距离
农庄
distancetonearest
3.1年前
chitsazanalex
•10
•3.1年前更新
朱莉·朱
♦4.2 k
0
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1
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465
的观点
Rcpp在c++中添加圆形范围到GRanges对象
农庄
圆形
rcpp
IRanges
3.2年前
hauken_heyken
•70年
3.
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2
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678
的观点
生成mapToGenome时出错
minfi
农庄
3.2年前
michaelwxf2012
•0
•3.2年前更新
彼得希
•460年
0
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5
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1.1 k
的观点
无法为签名grange的函数distanceToNearest找到继承的方法
chipenrich
农庄
distancetonearest
函数
dataframe
3.2年前
rbronste
•60
6
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4
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823
的观点
取消外显子GRangeslist对象的列表,并添加一个基因名称列
农庄
grangeslist
txdb.hsapiens.ucsc.hg19.knowngene
3.2年前
tangming2005
•160年
•3.2年前更新
Herve页面
14 k
0
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1
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538
的观点
predictcode错误:sequence ^1$ not found
variantannotation
预测编码
locateVariants
农庄
3.3年前
托尼·j
•0
2
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5
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456
的观点
GRanges数据类型的弱点,或者只是我?
GRangeslist
农庄
makeGrangesFromDataFrame
3.3年前
hauken_heyken
•70年
•3.3年前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
4
票
17
回复
1.5 k
的观点
如何从RCPP构造一个有效的GRanges对象并传递回R
农庄
IRanges
RCPP
构造函数
3.4年前
hauken_heyken
•70年
•3.3年前更新
fedor.bezrukov
•10
1
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1
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367
的观点
在转录坐标中找出utr中所有orf的结尾和第一个cds外显子的开始之间的距离
农庄
距离
3.3年前
hauken_heyken
•70年
•3.3年前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
6
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2
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282
的观点
将cd的5'导联子和第1外显子合并到GRangesList中
农庄
mapToTranscripts
3.3年前
hauken_heyken
•70年
2
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3.
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790
的观点
subsetByOverlaps with Multimapping
genomicranges
subsetbyoverlaps
农庄
findoverlaps
3.4年前
亚萨合Yeroslaviz
♦1.5 k
3.
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2
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838
的观点
关于setdiff()和GRanges中的元信息
农庄
genomicranges
3.4年前
波格丹
•610年
•3.4年前更新
Herve页面
14 k
0
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4
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1.2 k
的观点
关于grange的错误
农庄
3.4年前
波格丹
•610年
1
投票
4
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839
的观点
IRanges (GRanges):当宽度为0的范围重叠时,行为不一致
Iranges
农庄
3.5年前
balwierz
•40
•3.4年前更新
Herve页面
14 k
4
票
3.
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1.5 k
的观点
根据基因id划分GRanges对象
genomicranges
genomicfeatures
农庄
构造子集
3.4年前
亚萨合Yeroslaviz
♦1.5 k
0
票
3.
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2.0 k
的观点
makeTxDbFromGFF错误:下标包含NAs
genomicfeatures
农庄
maketxdbfromgff
3.5年前
marc_bes
•0
•3.4年前更新
Herve页面
14 k
0
票
3.
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838
的观点
使用IRanges查找重叠窗口的基因TSS
iranges
R
农庄
3.5年前
ssabri
•20
•3.5年前更新
叫海波。刘
•0
2
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3.
回复
815
的观点
如何用granger找到miRNA基因周围最近的CpG岛?
农庄
bioconductor
R
3.5年前
Adam_M
•0
0
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3.
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1.0 k
的观点
从BAM文件到GRanges的IRanges转换
iranges
农庄
3.5年前
seungjoon.kim
•0
0
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8
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1.0 k
的观点
用生物导体检测异构体
bioconductor
biomart
农庄
rna-seq
3.5年前
seungjoon.kim
•0
•3.5年前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
3.
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15
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1.1 k
的观点
(大)完整染色体的假发文件
有重大影响的人
rtracklayer
进口
农庄
grangeslist
3.5年前
亚萨合Yeroslaviz
♦1.5 k
•3.5年前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
0
票
1
回复
845
的观点
如果McOls值与下一个区间一致,则减少granges
农庄
减少
3.5年前
alessandro.pastore
•20
3.
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2
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540
的观点
矩阵作为GRanges的mcols列,lapply不能正确提取
mcols
DataFrame
农庄
3.6年前
wcstcyx
•30
•3.6年前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
1
投票
1
回复
424
的观点
IRanges对象在“+”和“-”链上的宽度
iranges
农庄
grangeslist
3.6年前
沃尔特·f·鲍曼
•10
•3.6年前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
0
票
6
回复
3.0 k
的观点
如何更改GRanges对象中的seqlevel
农庄
3.6年前
海鹰。香港
•110年
•3.6年前更新
或者,Jianhong
♦1.2 k
0
票
2
回复
548
的观点
sortSeqlevels不是GRanges对象的排序
农庄
3.6年前
海鹰。香港
•110年
•3.6年前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
5
票
9
回复
630
的观点
合并cn中的2个GRanges对象后的reduce函数。拖把输出
农庄
cn.mops
3.6年前
海鹰。香港
•110年
•3.6年前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
3.
票
1
回复
1.9 k
的观点
在R中从8个bam文件创建计数矩阵(RNAseq实验)
deseq2
rnaseq
数矩阵
galignments
农庄
3.6年前
bananaal1
•10
•3.6年前更新
迈克尔的爱
31 k
4
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3.
回复
2.3 k
的观点
在GRangesList中修改GRanges的mcols的正确方法是什么?
农庄
元数据
3.7年前
莱恩·c·汤普森
7.6 k
•3.7年前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
2
票
1
回复
933
的观点
特性请求:删除GRanges对象中未使用的seqlevel的语法
农庄
seqlevels
功能要求
3.7年前
查尔斯·普莱西
•130年
•3.7年前更新
Herve页面
14 k
1
投票
1
回复
470
的观点
得到正好重叠的区间
findoverlaps
农庄
3.7年前
julrodr80
•30
•3.7年前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
2
票
3.
回复
599
的观点
带参考重叠的基因组范围分裂(着丝粒)
农庄
genomicranges
分裂
3.7年前
gaiusjaugustus
•0
•3.7年前更新
koisingh69
•0
2
票
2
回复
571
的观点
在同一样本中发现重叠
genomicranges
农庄
findoverlaps
3.7年前
julrodr80
•30
4
票
2
回复
785
的观点
试图注释与外部文件信息重叠
iranges
农庄
3.7年前
chrisclarkson100
•50
•3.7年前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
0
票
2
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797
的观点
GRanges链输入错误
农庄
教程
3.8年前
prabin.dm
•0
•3.7年前更新
马丁•摩根
25 k
0
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4
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467
的观点
数据集的数据结构
元数据
grangeslist
农庄
样本
3.8年前
Sim1pall8a
•0
•3.8年前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
2
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4
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2.0 k
的观点
通过GRange来子集DNAStringSet的最佳方法是什么?
bioconductor
biostrings
农庄
3.8年前
reuscher.stefan
•0
•3.8年前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
22
票
10
回复
5.9 k
的观点
GRanges中的错误:在泛型函数的环境中找不到符号“递归”
农庄
chippeakanno
3.9年前
deut13
•80年
•更新于3.9年前
davide.porcellato
•10
0
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32
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1.3 k
的观点
鉴定小鼠10kbp启动子区域的重复序列
农庄
短串联重复
重复
4.0年前更新于3.9年前
mkmb2004
•0
1
投票
4
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589
的观点
查找重叠的问题
农庄
iranges
findoverlaps
4.0年前
julrodr80
•30
•4.0年前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
2
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3.
回复
2.5 k
的观点
将GRange对象按位置拆分为GRange对象列表。
R
农庄
subsett
grangeslist
集团
4.0年前
RichardJActon
•30
•4.0年前更新
迈克•史密斯
♦4.8 k
195个结果•页面
2 / 4
最近……
回复
评论:如何在linux ubuntu 18中使用bioconductor和Deseq2
通过
凯文Blighe
2.4 k
你的默认R是什么?-应该是4.0.x。在错误消息之前的行中还应该有更多的文本。你能把它寄出去吗?
注释:错误:DBA对象已经从共识峰值集形成
通过
ahua217
•0
如果零峰值是它们最终能产生的,我会重新考虑是否应该生成一个关于这些的维恩图。谢谢!
注释:错误:DBA对象已经从共识峰值集形成
通过
ahua217
•0
谢谢你,斯塔克博士。下面是来自sessionInfo() > sessionInfo() R version 4.0.3(2020-10-10)平台:x86_64-apple-darwin…
评论:DESeq2中的正常化
通过
ATpoint
•400年
如果你有这样的问题(工具x如何做y),第一步总是阅读该工具所基于的论文。在这种情况下…
评论:MAST将两种条件与几个捐助者进行了比较
通过
埃
•0
你好,安德鲁,很抱歉问这个问题,但我有一个类似的情况。关于你的回答,我怎么知道有多少捐献者是…
票
答案:没有结果从plotPCA()
评论:DEseq2比较顺序
评论:DEseq2比较顺序
评论:DEseq2比较顺序
答:DEseq2比较顺序
奖
•所有
先知
来
amel.zulji
•0
受欢迎的问题
来
erwan.scaon
•10
很好的问题
来
komal.rathi
•80年
史诗的问题
来
komal.rathi
•80年
欣赏
来
马修·里奇
•960年
位置
•所有
德国,
刚才
爱尔兰共和国,
41分钟前
美国,
41分钟前
瑞士,
59分钟前
美国,
1小时前
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