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transformGamPoi
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DOI:10.18129 / B9.bioc.transformGamPoi
γ -泊松模型的方差稳定变换
Bioconductor版本:发行版(3.16)
方差稳定转换有助于分析异方差数据(即方差不是常数的数据，如计数数据)。这个包提供了两种类型的方差稳定转换:(1)基于delta方法的方法(例如，'acosh'， 'log(x+1)')，(2)基于模型残差的方法(Pearson和随机分位数残差)。
作者:Constantin Ahlmann-Eltze [aut, cre]
维护者:Constantin Ahlmann-Eltze
引文(从R内，输入引用(“transformGamPoi”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“transformGamPoi”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | glmGamPoi快速入门 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 归一化，预处理，回归，SingleCell，软件 |
| 版本 | 1.4.0 |
| 在Bioconductor | bio3.14 (R-4.1)(1年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | |
| 进口 | glmGamPoi，DelayedArray，矩阵，MatrixGenerics，SummarizedExperiment，HDF5Array，方法，utils，Rcpp |
| 链接 | Rcpp |
| 建议 | testthat，TENxPBMCData，食物，knitr，rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/const-ae/transformGamPoi |
| BugReports | https://github.com/const-ae/transformGamPoi/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | transformGamPoi_1.4.0.tar.gz |
| Windows二进制 | transformGamPoi_1.4.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | transformGamPoi_1.4.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | transformGamPoi_1.3.1.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/transformGamPoi |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/transformGamPoi |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/transformGamPoi/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
