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transcriptogramer
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DOI:10.18129 / B9.bioc.transcriptogramer
基于转录图的转录分析
Bioconductor版本:发行版(3.16)
R包用于基于转录图的转录分析，这是一种分析转录组的方法，将表达值投射到一组有序蛋白质上，其排列方式是基因产物参与同一代谢途径的概率随着排序的两个蛋白质之间距离的增加而呈指数下降。因此，转录谱是全基因组的基因表达谱，它为细胞代谢提供了一个全局视图，同时表明其表达被改变的基因集。
作者:Diego Morais [aut, cre]， Rodrigo Dalmolin [aut]
维护者:Diego Morais
引文(从R内，输入引用(“transcriptogramer”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“transcriptogramer”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 转录仪用户指南 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 聚类，DifferentialExpression，GeneExpression，GeneSetEnrichment，GraphAndNetwork，ImmunoOncology，微阵列，网络，RNASeq，软件，SystemsBiology，转录，可视化 |
| 版本 | 1.20.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.6 (R-3.4)(5年) |
| 许可证 | GPL (>= 2) |
| 取决于 | R(>= 3.4)，方法 |
| 进口 | biomaRt，data.table，doSNOW，foreach，ggplot2，图形，grDevices，igraph，limma平行,进步，红色的，雪统计数据,tidyr，topGO |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle，knitr，rmarkdown，RUnit，BiocGenerics |
| SystemRequirements | Java运行时环境(>= 6) |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/arthurvinx/transcriptogramer |
| BugReports | https://github.com/arthurvinx/transcriptogramer/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | transcriptogramer_1.20.0.tar.gz |
| Windows二进制 | transcriptogramer_1.20.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | transcriptogramer_1.20.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | transcriptogramer_1.20.0.tgz |
| 源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/transcriptogramer |
| 源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/transcriptogramer |
| 生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/transcriptogramer/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/transcriptogramer/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
