tRNAscanImport

DOI:10.18129 / B9.bioc.tRNAscanImport

导入一个tRNAscan-SE结果文件作为农庄组织对象

Bioconductor版本:版本(3.17)

包进口tRNAscan-SE为农庄组织对象的结果。

作者:Felix通用恩斯特(aut (cre)

维修工:Felix通用恩斯特< felix.gm。恩斯特在outlook.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“tRNAscanImport”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“tRNAscanImport”)

HTML	R脚本	tRNAscanImport
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DataImport,预处理,软件,可视化,WorkflowStep
版本	1.20.0
Bioconductor自	BioC 3.7 (r - 3.5)(5年)
许可证	GPL-3 +文件许可证
取决于	R (> = 3.5),GenomicRanges,tRNA
进口	方法、stringrBiocGenerics,Biostrings,Structstrings,S4Vectors,IRanges,XVector,GenomeInfoDb,rtracklayer,BSgenome,Rsamtools
链接
建议	BiocStyle,rmarkdown knitr testthat ggplot2,BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer3
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/FelixErnst/tRNAscanImport
BugReports	https://github.com/FelixErnst/tRNAscanImport/issues
取决于我
进口我
建议我	Structstrings,tRNA
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	tRNAscanImport_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	tRNAscanImport_1.20.0.zip
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)	tRNAscanImport_1.20.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tRNAscanImport
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ tRNAscanImport
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/tRNAscanImport/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/tRNAscanImport/
包下载报告	下载数据