tRNAscanImport

DOI:10.18129 / B9.bioc.tRNAscanImport

导入一个tRNAscan-SE结果文件作为农庄组织对象

Bioconductor版本:版本(3.17)

包进口tRNAscan-SE为农庄组织对象的结果。

作者:Felix通用恩斯特(aut (cre)

维修工:Felix通用恩斯特< felix.gm。恩斯特在outlook.com >

从内部引用(R,回车引用(“tRNAscanImport”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“tRNAscanImport”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“tRNAscanImport”)

HTML R脚本 tRNAscanImport
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews DataImport,预处理,软件,可视化,WorkflowStep
版本 1.20.0
Bioconductor自 BioC 3.7 (r - 3.5)(5年)
许可证 GPL-3 +文件许可证
取决于 R (> = 3.5),GenomicRanges,tRNA
进口 方法、stringrBiocGenerics,Biostrings,Structstrings,S4Vectors,IRanges,XVector,GenomeInfoDb,rtracklayer,BSgenome,Rsamtools
链接
建议 BiocStyle,rmarkdown knitr testthat ggplot2,BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer3
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/FelixErnst/tRNAscanImport
BugReports https://github.com/FelixErnst/tRNAscanImport/issues
取决于我
进口我
建议我 Structstrings,tRNA
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 tRNAscanImport_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 tRNAscanImport_1.20.0.zip
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64) tRNAscanImport_1.20.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tRNAscanImport
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ tRNAscanImport
Bioc包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/tRNAscanImport/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/tRNAscanImport/
包下载报告 下载数据

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网