synlet

DOI:10.18129 / B9.bioc.synlet

点击选择合成致命的RNAi屏幕数据

Bioconductor版本:版本(3.17)

从合成致命的RNAi选择点击屏幕上的数据。例如,有两个相同的celllines除了一个基因在一个cellline拆装的。利息是找到基因导致更强的致命效果时拆装的进一步的核。质量控制和实现各种可视化工具。四种不同算法可以用来拿起有趣的支安打。这个包的目的是基于384口井盘子,但可能适用于其他平台通过适当的配置。

作者:Chunxuan邵(aut (cre)

维护人员:Chunxuan邵< Chunxuan outlook.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“synlet”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“synlet”)

HTML	R脚本	synlet的工作演示
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CellBasedAssays,FeatureExtraction,ImmunoOncology,预处理,质量控制,软件,可视化
版本	2.0.0
Bioconductor自	BioC 3.2 (r - 3.2)(7.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.5.0)
进口	数据。表、ggplot2 grDevices, magrittr、方法、拼凑,RankProd,统计RColorBrewer跑龙套
链接
建议	BiocStyle,testthat knitr rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	synlet_2.0.0.tar.gz
Windows二进制	synlet_2.0.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	synlet_2.0.0.tgz
macOS二进制(arm64)	synlet_2.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/synlet
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ synlet
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/synlet/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/synlet/
包下载报告	下载数据