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- Bioconductor 3.17
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spaSim
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DOI:10.18129 / B9.bioc.spaSim
空间点数据模拟器组织图像
Bioconductor版本:版本(3.17)
一套功能模拟细胞在组织图像的空间模式。输出图像multitype SingleCellExperiment格式的数据。每个点代表一个细胞,2 d位置和细胞类型。潜在的细胞模式包括背景细胞,肿瘤/免疫细胞集群,免疫戒指,和血液/淋巴管。
作者:禹州冯(aut (cre)
安娜,小麦(aut)
维修工:禹州冯<禹州。冯:petermac.org >
从内部引用(R,回车引用(“spaSim”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“spaSim”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“spaSim”)
| HTML | R脚本 | 装饰图案 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | BiomedicalInformatics,软件,空间,StatisticalMethod |
| 版本 | 1.2.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.16 (r - 4.2)(0.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (> = 4.2.0) |
| 进口 | ggplot2、方法、统计、dplyr spatstat。几何学、spatstat.randomSpatialExperiment,SummarizedExperiment,RANN |
| 链接 | |
| 建议 | RefManageR,BiocStyle、knitr testthat (> = 3.0.0), sessioninfo, rmarkdown减价 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://trigosteam.github.io/spaSim/ |
| BugReports | https://support.bioconductor.org/t/spaSim |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | spaSim_1.2.0.tar.gz |
| Windows二进制 | spaSim_1.2.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | spaSim_1.2.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | spaSim_1.2.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/spaSim |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ spaSim |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/spaSim/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/spaSim/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
