DOI:10.18129 / B9.bioc.single

从纳米孔读取基因文库的精确一致序列

Bioconductor版本:发行版(3.16)

从纳米孔读取DNA基因文库的精确一致序列。SINGLe纠正了基因文库的纳米孔测序读取中的系统错误,它检索了条形码识别的变体的真实一致序列,每个变体只需要几次读取。更多信息见预印本doi: https://doi.org/10.1101/2020.03.25.007146。

作者:Rocio Espada [aut, cre]

维护者:Rocio Espada < Rocio . Espada at espci.fr>

引文(从R内,输入引用(“单一”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“单一”)

超文本标记语言 R脚本
PDF 参考手册
文本 许可证

细节

biocViews 测序软件
版本 1.2.0
在Bioconductor BioC 3.15 (R-4.2)(0.5年)
许可证 MIT +文件许可证
取决于 R (>= 4.1)
进口 BiostringsBiocGenericsdplyrGenomicAlignmentsIRanges、方法、reshape2rlangRsamtools统计数据,stringrtidyr,跑龙套
链接
建议 BiocStyleknitrrmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 single_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 single_1.2.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64) single_1.2.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) single_1.1.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/single
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/single
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/single/
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