天窗
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DOI:10.18129 / B9.bioc.scuttle
单细胞rna序列分析实用程序
Bioconductor版本:发行版(3.16)
提供用于执行单单元分析的基本实用函数，重点关注简单的规范化、质量控制和数据转换。还提供了一些帮助器函数来帮助开发其他包。
作者:Aaron Lun [aut, cre]， Davis McCarthy [aut]
维护者:Aaron Lun
引文(从R内，输入引用(“天窗”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“天窗”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 1.质量控制 |
| 超文本标记语言 | R脚本 | 2.归一化 |
| 超文本标记语言 | R脚本 | 3.其他功能 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | DataImport，GeneExpression，ImmunoOncology，归一化，预处理，质量控制，RNASeq，测序，SingleCell，软件，转录组 |
| 版本 | 1.8.4 |
| 在Bioconductor | BioC 3.12 (R-4.0)(2年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | SingleCellExperiment |
| 进口 | 方法，utils，统计，矩阵，Rcpp，BiocGenerics，S4Vectors，BiocParallel，GenomicRanges，SummarizedExperiment，DelayedArray，DelayedMatrixStats，beachmat |
| 链接 | Rcpp，beachmat |
| 建议 | BiocStyle，knitr，scRNAseq，rmarkdown，testthat，食物 |
| SystemRequirements | c++ 11 |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | 嘘，食物 |
| 进口我 | 基础知识，BASiCStan，后面;，DropletUtils，火焰，imcRtools，米娅，mumosa，马斯喀特，scDblFinder，singleCellTK，spatialHeatmap，spatialLIBD，伶盗龙 |
| 建议我 | 咆哮，HCAData，miloR，MouseThymusAgeing，单，飞溅，TSCAN |
| 链接到我 | DropletUtils，食物 |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | scuttle_1.8.4.tar.gz |
| Windows二进制 | scuttle_1.8.4.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | scuttle_1.8.4.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | scuttle_1.8.3.tgz |
| 源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scuttle |
| 源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ scutle |
| 生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/scuttle/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/scuttle/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
| BioC 3.16的旧源包 | 源存档 |
