sccomp

DOI:10.18129 / B9.bioc.sccomp

单单元数据组成和异质性的稳健异常值感知估计

Bioconductor版本:发行版(3.16)

从单细胞数据测试差异组织组成的稳健和异常值感知方法。该模型可以推断组织组成和异质性的变化，并可以基于任何现有数据集产生真实的数据模拟。该模型还可以从大量集成数据集中转移知识，进一步提高准确性。

作者:Stefano Mangiola [aut, cre]

维护者:Stefano Mangiola

安装

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如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

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文档

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超文本标记语言	R脚本	sccomp包概述
PDF		参考手册

细节

biocViews	聚类，GeneExpression，ImmunoOncology，归一化，RNASeq，测序，SingleCell，软件，转录组
版本	1.1.0
在Bioconductor	BioC 3.15 (R-4.2)(0.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 4.1.0)
进口	方法,Rcpp(> = 0.12.0),RcppParallel(> = 5.0.1),rstantools(> = 2.1.1),rstan(> = 2.18.1),SeuratObject，SingleCellExperiment平行,dplyr，tidyr，purrr，magrittr，rlang，宠物猫，引导，生命周期统计数据,tidyselect跑龙套,ggplot2，ggrepel，拼接而成，forcats，readr，尺度，stringr
链接	黑洞(> = 1.66.0),Rcpp(> = 0.12.0),RcppEigen(> = 0.3.3.3.0),RcppParallel(> = 5.0.1),rstan(> = 2.18.1),StanHeaders(> = 2.18.0)
建议	BiocStyle，testthat(> = 3.0.0),减价，ggplot2，knitr，tidyseurat，tidySingleCellExperiment
SystemRequirements	GNU使
增强了	furrr，extraDistr
URL	https://github.com/stemangiola/sccomp
BugReports	https://github.com/stemangiola/sccomp/issues
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进口我
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包档案

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源包	sccomp_1.1.0.tar.gz
Windows二进制	sccomp_1.1.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	sccomp_1.1.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	sccomp_1.1.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sccomp
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/sccomp
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/sccomp/
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