scRNAseq

DOI:10.18129 / B9.bioc.scRNAseq

公共单细胞RNA-Seq数据集的收集

Bioconductor版本:发行版(3.16)

基因级计数用于公共scRNA-seq数据集的集合，作为singlecel实验对象提供细胞级和基因级元数据。

作者:Davide Risso [aut, cph]， Michael Cole [aut]， Aaron Lun [ctb, cre]， Alan O'Callaghan [ctb]， Jens Preussner [ctb]， Charlotte Soneson [ctb]， Stephany Orjuela [ctb]， Daniel Bunis [ctb]， Milan Malfait [ctb]

维护者:Aaron Lun 的键盘

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

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文档

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browseVignettes(“scRNAseq”)

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PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ExperimentData，ExperimentHub，ExpressionData，RNASeqData，SequencingData，SingleCellData
版本	2.12.0
许可证	CC0
取决于	SingleCellExperiment
进口	跑龙套、方法BiocGenerics，S4Vectors，GenomicRanges，SummarizedExperiment，ExperimentHub(> = 2.3.4),AnnotationHub(> = 3.3.6),AnnotationDbi，ensembldb，GenomicFeatures
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，BiocFileCache，testthat，rappdirs、工具
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	OSCA。先进,OSCA。basic, OSCA.intro, OSCA。工作流,SingleRBook
进口我	singleCellTK
建议我	APL，后面;，咆哮，ccImpute，命运，dittoSeq，Glimma，iSEE，iSEEhex，iSEEu，miQC，mumosa，scAnnotatR，嘘，scDblFinder，scFeatureFilter，司康饼，食物，scTreeViz，天窗，SingleCellExperiment，单，SummarizedBenchmark，UCell，伶盗龙，zellkonverter，zinbwave
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	scRNAseq_2.12.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制文件(x86_64)
macOS二进制文件(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scRNAseq
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/scRNAseq
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/scRNAseq/
软件包下载报告	下载数据