runibic

DOI:10.18129 / B9.bioc.runibic

runibic:用于分析R基因表达数据的基于行的双聚类算法

Bioconductor版本:发行版(3.16)

这个包在r中实现了UbiBic算法。这个用于分析基因表达数据的聚类算法是由Zhenjia Wang等人在2016年提出的。它被认为是目前最有前途的聚类方法,用于识别复杂和噪声数据中的有意义结构。

作者:Patryk Orzechowski, Artur pazynczyk

维护者:Patryk Orzechowski < Patryk。Orzechowski在gmail.com>

引用(从R中,输入引用(“runibic”)):

安装

要安装此包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("runibic")

对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“runibic”)

超文本标记语言 runibic: R教程中的UniBic
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews 聚类报道GeneExpression微阵列测序软件
版本 1.20.0
在Bioconductor公司 BioC 3.6 (R-3.4)(5年)
许可证 MIT +文件许可证
取决于 R (>= 3.4.0),biclustSummarizedExperiment
进口 Rcpp(> = 0.12.12),testthat、方法
链接 Rcpp
建议 knitrrmarkdownGEOqueryaffy气道QUBIC
SystemRequirements c++ 11, GNU使
增强了
URL http://github.com/athril/runibic
BugReports http://github.com/athril/runibic/issues
全靠我
进口我
建议我 mosbi
给我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包 runibic_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 runibic_1.20.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)
macOS二进制文件(arm64)
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/runibic
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/runibic
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/runibic/
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