咆哮
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DOI:10.18129 / B9.bioc.roar
从RNA-seq比对确定微分APA使用
Bioconductor版本:版本(3.17)
确定优先使用APA网站,比较两个生物条件,从已知的替代标准RNA-seq试验得到网站和比对。
作者:埃琳娜格拉希
维护人员:埃琳娜·葛拉<葛。在gmail.com e >
从内部引用(R,回车引用(“咆哮”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“咆哮”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“咆哮”)
| R脚本 | 从RNA-seq比对确定微分APA使用 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | HighThroughputSequencing,RNAseq,测序,软件,转录 |
| 版本 | 1.36.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.14 (r - 3.1)(9年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (> = 3.0.1) |
| 进口 | 方法,BiocGenerics,S4Vectors,IRanges,GenomicRanges,SummarizedExperiment,GenomicAlignments(> = 0.99.4),rtracklayer,GenomeInfoDb |
| 链接 | |
| 建议 | RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14,testthat |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/vodkatad/roar/ |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | roar_1.36.0.tar.gz |
| Windows二进制 | roar_1.36.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | roar_1.36.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | roar_1.35.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/roar |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/咆哮 |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/roar/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/roar/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
