rgoslin

DOI:10.18129 / B9.bioc.rgoslin

脂类简写名称解析与归一化

Bioconductor版本:发行版(3.16)

简明脂类命名法语法的R实现解析脂类名称的不同速记符号方言。它将它们规范化为一个标准名称。它进一步为每一个成功解析的脂类名称提供了计算的单同位素质量和求和公式,并补充了脂类地图类别和类信息。此外,在适用的情况下,还返回了头部基团、脂肪酰基和官能团的结构层次和进一步的结构细节。

作者:尼尔斯·霍夫曼[aut, cre],多米尼克·科钦斯基[au]

维护人员:Nils Hoffmann < Nils。霍夫曼在cebitec.uni-bielefeld.de >

引用(从R中,输入引用(“rgoslin”)):

安装

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如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("rgoslin")

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browseVignettes(“rgoslin”)

超文本标记语言 R脚本 用R高斯林对脂质命名法进行解析和规范化
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文本 许可证

细节

biocViews LipidomicsMassSpectrometry代谢组学归一化预处理软件
版本 1.2.0
Bioconductor自 BioC 3.15 (R-4.2)(0.5年)
许可证 麻省理工学院+文件许可证
取决于
进口 Rcpp(> = 1.0.3),dplyr
链接 Rcpp
建议 testthat(> =魅惑,BiocStyleknitrrmarkdownkableExtraBiocManagerstringrggplot2宠物猫lipidr
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/lifs-tools/rgoslin
BugReports https://github.com/lifs-tools/rgoslin/issues
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包档案

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源包 rgoslin_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 rgoslin_1.2.0.zip
macOS二进制(x86_64) rgoslin_1.2.0.tgz
macOS二进制(arm64) rgoslin_1.1.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rgoslin
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ rgoslin
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/rgoslin/
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