变体
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doi：10.18129/b9.bioc.variants
注释基因组变体
生物导体版本：版本（3.12）
读写VCF文件。确定变体的结构位置，并计算非同义变体的氨基酸编码变化。使用SIFT和Polyphen数据库包来预测氨基酸编码的结果
作者：生物导体软件包维护器[CRE]
维护者：bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>
引用（从r内，输入引用（“变体”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ variants”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“变体”）
| html | R脚本 | 注释基因组变体 |
细节
| 生物浏览 | 注释工作流，，，，Immunooncologyworkflow，，，，工作流程 |
| 版本 | 1.13.0 |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | r（> = 3.3.0），变体，，，，CGDV17，，，，org.hs.eg.db，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg19，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19，，，，polyphen.hsapiens.dbsnp131 |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | 尼特，，，，rmarkDown，，，，生物使用 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | //www.anjoumacpherson.com/help/workflows/variants/ |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | variants_1.13.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| MacOS 10.13（高山脉） | |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/variants |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/变种 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/variants/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
