Generegulation.

DOI：10.18129 / b9.bioc.geneRegulation.

通过序列匹配找到已知转录因子的候选结合位点

Biocometiond版本：释放（3.12）

转录因子蛋白（TFS）与基因转录起始位点（TSSS）上游的DNA启动子区的结合是基因表达和因此许多细胞过程的最重要机制之一。虽然近年来，许多新的数据已经可用于鉴定转录因子结合位点（TFBS） - SEQ-SEQ和DNASE I超敏区之间的序列匹配继续发挥重要作用。在该工作流程中，我们展示了使用模型生物酿酒酵母酿酒酵母在DNA序列中寻找候选TF结合位点的生物导体技术。这里证明的方法同样适用于其他生物。

作者：Bioconductor包维护者[AUT，CRE]

维护者：Bioconductor Package维护者

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通过序列匹配找到已知转录因子的候选结合位点

细节

Biocviews.	EpigeneticsWorkflow.那工作流程
版本	1.14.0
执照	艺术-2.0
依靠	r（> = 3.3.0），bsgenome.scerevisiae.ucsc.saccer3.那生物仪器那基因组法那motifdb.那S4Vectors.那txdb.scerevisiae.ucsc.saccer3.sgden.那Motifstack.那org.sc.sgd.db.那seqlogo.
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源包	generegulation_1.14.0.tar.gz.
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源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/generegulation.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondudard.org：包/基因调程
包短网址	https://biocumon.org/packages/generegulation/
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