EQTL.

DOI：10.18129 / b9.bioc.eqtl.

启用云的CIS-EQTL搜索Biocumon GGTools 5.x

Biocometiond版本：释放（3.12）

该工作流程侧重于CIS的EQTL搜索，从而测试用于表达的基因的局部DNA变体进行关联。

作者：文森特凯莉[AUT，CRE]

维护者：文森特凯悦

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.0”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，squiatly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“eqtl”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

BROWSEVIGNETTES（“EQTL”）

HTML.

r script.

启用云的CIS-EQTL搜索Biocumon GGTools 5.x

细节

Biocviews.	GenomicvariantsWorkflow.那工作流程
版本	1.14.0
执照	艺术-2.0
依靠	r（> = 3.3.0），ggdata.那GGTools.那genomeinfodb.那S4Vectors.那snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37.那宾诗人那big那data.table.那多达齐全那Foreach.那kniTcitations.那lumi.那lumihumanall.db.， 平行，reta.那散点图3d.那Snpstats.， 网格，Yri1kgv.
进口
链接到
建议	kn那RAMAMAMDOW.那生物焦
系统要求
加强
URL.	https://www.biocumon.org/help/workflows/eqtl/
取决于我
进口我
建议我
链接给我

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

源包	eqtl_1.14.0.tar.gz.
Windows二进制文件
Macos 10.13（高塞拉）
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/eqtl.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocumon.org：包/ eqtl
包短网址	https://biocumon.org/packages/eqtl/
包裹下载报告	下载统计信息