注解

DOI：10.18129 / b9.bioc.annotation.

基因组注释资源

Biocometiond版本：释放（3.12）

注释资源构成了比例的Biocuconduct项目。还有一个不同的在线资源，可以使用特定软件包访问。这个演练将描述这些资源最受欢迎的，并为如何使用它们提供一些高级示例。

作者：Marc RJ Carlson [Aut]，Herve页面[Aut]，Sonali Arora [Aut]，Valerie Obenchain [Aut]，Martin Morgan [Aut]，Bioconductor Package维护人员[CRE]

维护者：Bioconductor Package维护者

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.0”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“注释”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

Browsevignettes（“注释”）

HTML.	r script.	注释基因组范围
HTML.	r script.	基因组注释资源

细节

Biocviews.	AnnotationWorkflow.那工作流程
版本	1.14.0
执照	艺术-2.0
依靠	r（> = 3.3.0），VariantAnnotation.那annotationhub.那有机族那txdb.hsapiens.ucsc.hg19.knowngene.那txdb.hsapiens.ucsc.hg38.knowngene.那txdb.mmusculus.ucsc.mm10.ensgene.那org.hs.eg.db.那org.mm.eg.db.那homo.sapiens.那bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19那生物雕那bsgenome.那txdb.athalana.biomart.plantsmart22
进口
链接到
建议	kn那RAMAMAMDOW.那生物焦
系统要求
加强
URL.	http://biocadiond.org/help/workflows/annotation/annotation_resources/
取决于我
进口我
建议我
链接给我

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

源包	annotation_1.14.0.tar.gz.
Windows二进制文件
Macos 10.13（高塞拉）
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/annotation.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包/注释
包短网址	https://biocumon.org/packages/annotation/
包裹下载报告	下载统计信息