注解

DOI:10.18129 / b9.bioc.annotation.

基因组注释资源

Biocometiond版本:释放(3.12)

注释资源构成了比例的Biocuconduct项目。还有一个不同的在线资源,可以使用特定软件包访问。这个演练将描述这些资源最受欢迎的,并为如何使用它们提供一些高级示例。

作者:Marc RJ Carlson [Aut],Herve页面[Aut],Sonali Arora [Aut],Valerie Obenchain [Aut],Martin Morgan [Aut],Bioconductor Package维护人员[CRE]

维护者:Bioconductor Package维护者

引文(从R内,输入引文(“注释”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

if(!percennamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“注释”)

对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

Browsevignettes(“注释”)

HTML. r script. 注释基因组范围
HTML. r script. 基因组注释资源

细节

Biocviews. AnnotationWorkflow.工作流程
版本 1.14.0
执照 艺术-2.0
依靠 r(> = 3.3.0),VariantAnnotation.annotationhub.有机族txdb.hsapiens.ucsc.hg19.knowngene.txdb.hsapiens.ucsc.hg38.knowngene.txdb.mmusculus.ucsc.mm10.ensgene.org.hs.eg.db.org.mm.eg.db.homo.sapiens.bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19生物雕bsgenome.txdb.athalana.biomart.plantsmart22
进口
链接到
建议 knRAMAMAMDOW.生物焦
系统要求
加强
URL. http://biocadiond.org/help/workflows/annotation/annotation_resources/
取决于我
进口我
建议我
链接给我

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

源包 annotation_1.14.0.tar.gz.
Windows二进制文件
Macos 10.13(高塞拉)
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/annotation.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondion.org:包/注释
包短网址 https://biocumon.org/packages/annotation/
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文件»

生物体

R./cr包裹和文件

支持»

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  • 支持网站- 关于生物导体包的问题
  • 正常词 邮件列表 - 适用于包开发人员bob电竞体育官网