表达式正式工作流

doi:10.18129/b9.bioc.bioc.expressionnormalizationworkflow

基因表达归一化工作流程

生物导体版本:版本(3.12)

一个广泛的自定义表达归一化工作流程,其中包含了微荷兰(SNM)的监督标准化,替代变量分析(SVA)和主方差成分分析,以识别批处理效应并将其从表达数据中删除,以增强检测潜在的生物学信号的能力。

作者:Karthikeyan Murugesan [AUT,CRE],Greg Gibson [Sad,THS]

维护者:yahoo.com上的karthikeyan murugesan

引用(从r内,输入引用(“ expressionNoralizationWorkflow”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ expressionNormalizationworkflow”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ expressionnoralizationworkflow”)

html R脚本 基因表达归一化工作流程

细节

生物浏览 geneexpressionworkflow,,,,Immunooncologyworkflow,,,,工作流程
版本 1.16.0
执照 GPL(> = 3)
要看
进口 生物酶(> = 2.24.0),林玛(> = 3.20.9),LME4(> = 1.1.7),矩阵(> = 0.10.3),PVCA(> = 1.4.0),SNM(> = 1.12.0),SVA(> = 3.10.0),VSN(> = 3.32.0)
链接
建议 尼特,,,,生物使用
系统要求
增强
URL
BugReports https://github.com/
取决于我
进口我
建议我
链接到我

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 ExpressionNormalizationWorkflow_1.16.0.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13(高山脉)
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/expressionnormalizationworkflow
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/expressionnormalizationworkflow
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/expressionnormalizationworkflow/
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