生物导体版本:版本(3.12)
一个广泛的自定义表达归一化工作流程,其中包含了微荷兰(SNM)的监督标准化,替代变量分析(SVA)和主方差成分分析,以识别批处理效应并将其从表达数据中删除,以增强检测潜在的生物学信号的能力。
作者:Karthikeyan Murugesan [AUT,CRE],Greg Gibson [Sad,THS]
维护者:yahoo.com上的karthikeyan murugesan
引用(从r内,输入引用(“ expressionNoralizationWorkflow”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ expressionNormalizationworkflow”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ expressionnoralizationworkflow”)
html | R脚本 | 基因表达归一化工作流程 |
生物浏览 | geneexpressionworkflow,,,,Immunooncologyworkflow,,,,工作流程 |
版本 | 1.16.0 |
执照 | GPL(> = 3) |
要看 | |
进口 | 生物酶(> = 2.24.0),林玛(> = 3.20.9),LME4(> = 1.1.7),矩阵(> = 0.10.3),PVCA(> = 1.4.0),SNM(> = 1.12.0),SVA(> = 3.10.0),VSN(> = 3.32.0) |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,生物使用 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
BugReports | https://github.com/ |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | ExpressionNormalizationWorkflow_1.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
MacOS 10.13(高山脉) | |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/expressionnormalizationworkflow |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/expressionnormalizationworkflow |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/expressionnormalizationworkflow/ |
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