使用Bioconductor的实验室使用RAW MZXML数据进行辅导分析分析

数据是在LTQ Orbitrap XL HRMS上与Dionex Ultimate 3000 Nanoflow LC系统通过Flex离子纳米 - 电源涂层源结合的，根据Grigoryan等人的方法（AnalChem。201611月1日； 88（21）：10504–：10504--10512.）。使用proteowizard msconvert将原始文件转换为MZXML。

msconvert orb35017raw.raw-   -mzxmlmsconvert orb35017raw.raw-   -mzxml

其他文件是使用软件包加成的制作的

＃加载软件包图书馆（加合））

可以使用以下方式生产rtdevmodels.rdata

rtdevmodelling（（ms2dir =system.file（（“ Extdata”，，，，软件包=“ aDructdata”），ncors =4，，，，runorder =粘贴0（（system.file（（“ Extdata”，，，，软件包=“加合体”），'/runorder.csv'））＃使用bulterimenthub获取文件图书馆（实验室）eh =实验室（）温度=询问（嗯，“加合”'）温度

可以使用：

加入（（ncors =4，，，，targtable =粘贴0（（system.file（（“ Extdata”，，，，软件包=“加合体”），'/exampletargtable2.csv'），intstdrtdrift =30，，，，rtdevmodels =粘贴0（（system.file（（“ Extdata”，，，，软件包=“ aDructdata”），'/rtdevmodels.rdata'），filepaths =list.files（（system.file（（“ Extdata”，，，，软件包=“ aDructdata”），模式=“ .mzxml”，，，，all.files =错误的，，，，Full.Names =真的），QuantObject =无效的，，，，InDivActuct =无效的，，，，maxppm =5，，，，MinSimScore =0.8，，，，Spikescans =1，，，，MinPeakHeight =100，，，，maxrtdrift =20，，，，maxrtwindow =240，，，，Isowindow =80，，，，hkpeptide ='lvnevtefak'，，，，高卢斯=16）＃使用bulterimenthub获取文件图书馆（实验室）eh =实验室（）温度=询问（嗯，“加合”'）温度