tximportData

DOI:10.18129 / B9.bioc.tximportData

tximportData

Bioconductor版本:Release (3.15)

该包提供了在GEUVADIS项目的一组6个RNA-seq样本上运行各种转录丰度量化器的输出。量词分别是Cufflinks, RSEM, kallisto, Salmon和Sailfish。Alevin示例输出也包括在内。有关版本号、示例信息和调用细节的详细信息，请参阅包附页。

作者:迈克尔·洛夫

维护者:Michael Love

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("tximportData")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“tximportData”)

超文本标记语言	R脚本	tximport的示例输出文件
PDF		参考手册

细节

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版本	1.24.0
许可证	GPL (>= 2)
取决于
进口
链接
建议	knitr，减价
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我	DESeq2，鱼池，HumanTranscriptomeCompendium，tximeta，tximport，variancePartition
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	tximportData_1.24.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tximportData
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/tximportData
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/tximportData/
软件包下载报告	下载数据