spatialLIBD

DOI:10.18129 / B9.bioc.spatialLIBD

spatialLIBD: R / Bioconductor包可视化在转录组数据

Bioconductor版本:版本(3.15)

检查交互在10 x基因的转录组数据Visium平台以及数据梅纳德Collado-Torres et al,自然神经科学,2021项目分析了利大脑发展研究所(LIBD)研究人员和合作者。

作者:达芬奇Collado-Torres (aut (cre),克里斯汀·r·梅纳德(施)安德鲁·e·贾菲(施),布伦达帕尔多(施),艾比斯潘格勒(施),耶稣维圣地亚哥(施),卢卡斯·m·韦伯(施)

维护人员:达芬奇Collado-Torres < lcolladotor gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“spatialLIBD”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“spatialLIBD”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

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HTML R脚本 介绍spatialLIBD
HTML R脚本 用spatialLIBD 10倍基因组学公共数据集
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细节

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版本 1.8.3
许可证 艺术- 2.0
取决于 SpatialExperiment(> = 1.3.3)、R (> = 3.6)
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链接
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SystemRequirements
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URL https://github.com/LieberInstitute/spatialLIBD
BugReports https://support.bioconductor.org/t/spatialLIBD
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