Bioconductor版本:版本(3.15)
检查交互在10 x基因的转录组数据Visium平台以及数据梅纳德Collado-Torres et al,自然神经科学,2021项目分析了利大脑发展研究所(LIBD)研究人员和合作者。
作者:达芬奇Collado-Torres (aut (cre),克里斯汀·r·梅纳德(施)安德鲁·e·贾菲(施),布伦达帕尔多(施),艾比斯潘格勒(施),耶稣维圣地亚哥(施),卢卡斯·m·韦伯(施)
维护人员:达芬奇Collado-Torres < lcolladotor gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“spatialLIBD”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“spatialLIBD”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“spatialLIBD”)
HTML | R脚本 | 介绍spatialLIBD |
HTML | R脚本 | 用spatialLIBD 10倍基因组学公共数据集 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.8.3 |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | SpatialExperiment(> = 1.3.3)、R (> = 3.6) |
进口 | 闪亮的,傀儡,ggplot2,cowplot,情节,viridisLite,shinyWidgets,sessioninfo、网格grDevices、方法AnnotationHub跑龙套,png,嘘,DT,ExperimentHub,RColorBrewer,SummarizedExperiment、统计数据、图表、S4Vectors,IRanges,字段,benchmarkme,SingleCellExperiment,BiocFileCache,jsonlite,宠物猫,rtracklayer,矩阵,BiocGenerics,GenomicRanges,魔法,调色板 |
链接 | |
建议 | knitr,RefManageR,rmarkdown,BiocStyle,testthat(> =魅惑,covr,在这里,BiocManager,lobstr |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/LieberInstitute/spatialLIBD |
BugReports | https://support.bioconductor.org/t/spatialLIBD |
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源包 | spati |