seqc

DOI:10.18129 / B9.bioc.seqc

从SEQC RNA-seq生成的数据(MAQC-III)研究

Bioconductor版本:版本(3.16)

SEQC / MAQC-III财团已经产生了基准RNA-seq数据评估的核糖核酸测序技术和数据分析方法(生物科技Nat》, 2014)。数十亿的序列读取来自十个不同的测序网站已经生成。这个包包含了~ 2000测序读计数数据库。它还包括所有exon-exon连接研究的发现。~ 1000个基因和ERCC TaqMan rt - pcr数据激增序列数据都包含在这个包中。

作者:杨廖和施魏从戈登·K史密斯和史蒂夫Lianoglou贡献。

维护人员:杨廖<杨。廖onjcri.org.au >和<魏魏史。史在onjcri.org.au >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“seqc”)

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文档

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细节

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版本	1.32.0
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 2.10)
进口	跑龙套,Biobase
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/release/data/experiment/html/seqc.html
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	seqc_1.32.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/seqc
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ seqc
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/seqc/
包下载报告	下载数据