scrnaseq

doi:10.18129/b9.bioc.scrnaseq

公共单细胞RNA-seq数据集的收集

生物导体版本:版本(3.15)

基因级计数用于集合的公共SCRNA-seq数据集,该数据集以细胞和基因级元数据为单一的对象提供。

作者:Davide Risso [AUT,CPH],Michael Cole [AUT],Aaron Lun [CTB,CRE],Alan O'Callaghan [CTB],Jens Preussner [CTB],Charlotte Soneson [CTB],Stephany Orjuela [CTB] [CTB],[CTB],[CTB],,,CTB]丹尼尔·布尼斯[CTB],米兰马尔菲[CTB]

维护者:aaron lun

引用(从r内,输入引用(“ scrnaseq”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ scrnaseq”)

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文档

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browsevignettes(“ scrnaseq”)

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细节

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版本 2.10.0
执照 CC0
要看 Singlecellexperiment
进口 UTIT,方法,生物基因,,,,S4VECTORS,,,,基因组机,,,,总结性特征,,,,实验室(> = 2.3.4),AnnotationHub(> = 3.3.6),AnnotationDbi,,,,Ensembldb,,,,GenomicFeatures
链接
建议 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,Biocfilecache,,,,测试,,,,Rappdirs, 工具
系统要求
增强
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取决于我 奥斯卡。
进口我 Singlecelltk
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源包 scrnaseq_2.10.0.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13(高山脉)
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scrnaseq
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/scrnaseq
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/scrnaseq/
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