pcxnData

DOI:10.18129 / B9.bioc.pcxnData

预先定义的通路/基因集之间的相关系数和p值

Bioconductor版本:发行版(3.16)

PCxN数据库分别包含MSigDB H特征基因集、MSigDB C2 CP (Canonical pathways)、MSigDB C5 GO BP基因集和Pathprint中预定义基因集之间的相关系数和p值,以及调整后的通路相关性,以解释通路对之间的共享基因。

作者:Sokratis Kariotis, Yered Pita-Juarez, Wenbin Wei, Winston Hide

维护者:Sokratis Kariotis

引文(从R内,输入引用(“pcxnData”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“pcxnData”)

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细节

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版本 2.20.0
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源包 pcxnData_2.20.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制文件(x86_64)
macOS二进制文件(arm64)
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pcxnData
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/pcxnData
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/pcxnData/
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