Bioconductor版本:Release (3.15)
该包提供了来自甲状旁腺肿瘤原代培养实验的成对端RNA-Seq数据的基因和外显子部分的读取计数的rangedsummarizeexperiments对象。数据发表于Haglund F, Ma R, Huss M, Sulaiman L, Lu M, Nilsson IL, Hoog a, Juhlin CC, Hartman J, Larsson C, J clinin Endocrinol Metab的文章《甲状旁腺腺瘤中功能性雌激素受体的证据》。jc。2012-2484, Epub 2012年9月28日,midid: 23024189。在3种情况(DPN、OHT和对照组)的2个时间点对4例患者的肿瘤培养物进行测序。一个控制样本由于质量不高而被作者省略。包小插图描述了从NCBI基因表达Omnibus提供的原始测序数据创建对象,登录号为GSE37211。基因和外显子特征是GRCh37 Ensembl注释。
作者:迈克尔·洛夫
维护者:Michael Love
引文(从R内,输入引用(“parathyroidSE”)
):
要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("parathyroidSE")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“parathyroidSE”)
R脚本 | parathyroidGenesSE | |
参考手册 |
biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.34.0 |
许可证 | LGPL |
取决于 | R (>= 3.5.0),SummarizedExperiment |
进口 | |
链接 | |
建议 | Rsamtools,GenomicAlignments,GEOquery,SRAdb,GenomicFeatures,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | ClassifyR,DEXSeq |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | parathyroidSE_1.34.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS 10.13 (High Sierra) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/parathyroidSE |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/parathyroidSE |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/parathyroidSE/ |
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