Bioconductor版本:Release (3.15)
基因表达(CAGE)数据的Cap分析来自Bornholdt等人的“鉴定基因转录起始位点和增强子响应肺碳纳米管暴露在体内”,作为CAGE转录起始位点(ctss)提供。
作者:Malte Thodberg
维护者:Malte Thodberg
引文(从R内,输入引用(“碳纳米管”)
):
要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“碳纳米管”)
超文本标记语言 | R脚本 | 纳米管 |
参考手册 |
biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.12.0 |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 3.6) |
进口 | |
链接 | |
建议 | knitr,rmarkdown,BiocStyle,GenomicRanges,rtracklayer,CAGEfightR |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/MalteThodberg/nanotubes |
BugReports | https://github.com/MalteThodberg/nanotubes/issues |
全靠我 | CAGEWorkflow |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | nanotubes_1.12.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS 10.13 (High Sierra) | |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/nanotubes |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/nanotubes |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/nanotubes/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |